黑夜充满神秘、美丽、危险！夜幕之下，自有一套地下秩序运行。严守纪律的西九龙EU队队长沙展Heman，带领的EU小队，今晚来了新调任的队员爆谷，其神秘传言令人议论。然而，此人性格神怪桀傲，与Heman难以合作。但爆谷却屡见奇功，似有特殊能力，有些东西只有爆谷可以看到，众人半信半疑，爆谷更因为预知事故发生，被怀疑是帮凶！众人经历奇情一夜，为故事拉开序幕！私人会所里，夜游少女Aka在好友介绍下，到夜场兼职「绝世好工」，见识夜场光怪陆离，时黑帮大哥大丹的女友的钻戒失窃，向众女进行脱衣迫供，Aka连身边好友亦不能信任，彼此友情大受考验，进退两难！Aka更遇上古怪客人，能否安渡今宵？好赌的货车司机，被黑帮大哥邪钉追债，被迫答应为对方运毒。途中与粗鲁豪迈的「执杂佬」发生冲突，展开黑夜飞车追逐战，任务能否顺利完成？然而，这事只不过是江湖腥风血雨的开始！

Heman受上司戴家成(大Sir)赏识，推荐面试升职，却要他评估爆谷的精神状态。EU小队换入新血代替爆谷，为了证明自己的能力及精神状态，爆谷毅然向EU小队挑战！黑帮联兴社以下两大头目：邪钉及大丹，为争毒品买卖地盘笼里鸡作反，整晚争斗不断，EU队疲于奔命，但这些只是暴风雨前夕，爆谷得知可靠情报却无人相信，该如何是好？Aka被神秘的算命师预言，将会好心无好报，更当血光之灾。连环的不幸真的降临，算命师说有一方法可保Aka性命，更说中Heman与Aka禁忌的关系。邪钉旗下刀手6 Luck受命伏击大丹，最后演变成厮杀逃命，7-11便利店员阿花被迫协助6 Luck，便利店内展开危险关系。宅男救护员新丁尤勇出更，怀着英雄主义及好奇，想遇到大事争取表现，却事与愿违，频频埋怨。前辈坚叔及契爷不满其态度，故意教训，尤勇不谦虚受教，反而惹出大祸！

西九龙之夜，仍然是危险而美丽，EU队以为可以在平静中渡过。时众EU队员皆收到神秘短讯，是一女子的床上裸照，相中人疑是EU女队员Kit！Kit向众人解释，Heman体谅，只想息事宁人，要众人当没事发生，最后竟发现Kit说的全都是谎话，而传出短讯的，更是EU队中的人！7-11店员阿花顺利掩护刀手6 Luck逃过追捕，以为可以安全脱身，岂料6 Luck跟踪阿花回家，打算继续匿藏到安全为止。时阿花的男友Jason到来，误会丛生，阿花的痴情天真，对比了Jason的无耻及背叛，阿花怒不可歇，问6 Luck 是否有钱就会为人卖命，难道她想报复？热血憨直青年Alan，到深水埗午夜墟做义工派发面包，遇上性情飘忽，难以捉摸的古怪婆婆七婆。阴差阳错下，Alan被七婆要胁，迫令他偷运临终丈夫邓伯出院，可是，七婆和邓伯的意愿却互相违背，Alan左右为难，最后更沦为「杀人凶手」？爆谷找前妻寻求原谅，却遇到前妻男友，爆谷燥狂起来，殴打前妻男友，惊动EU队前来，但他们却发现前妻男友从来都不存在？为什么？

爆谷终于认清自己精神出现问题，愿意接受治疗，他辞去警员工作，甘于在亲戚开的食店帮手。可是，与爆谷一直有过节的黑帮大哥大丹，到来故意戏弄，虽然Heman及EU小队出手相助，与大丹剑拔弩张之时，大丹对头人邪钉现身，要爆谷在Heman面前作出一个艰钜决择。Aka及好友Leslie合作，在夜场办「迷你裙之夜」派对赚钱，可是Leslie误找来「灯头」Sa姐旗下的小姐帮忙，惹怒对方，带走小姐，派对快将开始，Aka等人面对将要失信于人，赔钱的局面，唯有兵行险著，她会否再惹祸上身？爆谷虽有接受治疗，但幻觉再现，神奇的能力令爆谷得到暗示，他犹豫不决，要否再追查下去。Heman到夜场查牌时见到Aka，不满她不听劝告，继续与损友来往，两人激烈争吵，原来过去Aka的介入，令Heman家庭破裂，不能回头。

爆谷仍然对自己的特殊能力半信半疑，找心理医生Edwin寻求协助，进行催眠治疗，希望知道自己一直看到的是真是假，为何别人又看不见，然而，Edwin只是给他换了另一款药物。但无论爆谷如何治疗，幻象线索还是频频出现，爆谷决定追查，竟发现线索来自一个已死的女孩阿Yan，原来因为交通意外，爆谷遗忘了一段往事，甚至是一段婚外情。EU队车长，木讷的鸡翼与热情性感的钢管舞女郎Jessie谱出恋曲，一段浪漫而诙谐的黑夜情缘，鸡翼在表白与退缩之间徘徊，经历数次起落，以为终于有望之际，迎接鸡翼的却是生命不能承受的痛？救护员尤勇今夜生日，却要当值，在同一辆车上，不停巧遇为朋友奔波的Aka，相比起只在社交网络上有朋友的尤勇，好像更明白到朋友的意义，尤勇更想结识Aka。EU队在当值期间，遇上大Sir发生交通意外，大Sir受朋友托管的猫走失，他紧张非常，甚至不惜私下动用Heman的EU队找寻，Heman暗觉奇怪。

Heman意外发现，大Sir与死去的钢管舞女郎Jessie似有不可告人关系，暗中调查。另一方面，爆谷破解Yan留下的线索暗号，Yan原来并非自己婚外情情人，反而是位线人，他查出背后似牵涉另一单大案，幕后黑手矛头指向大Sir！Heman与爆谷合作设局试探，途中爆谷却出意外，难道Heman出卖同伴？Aka之前在夜场做派对搞手的绰头令她声名大噪，得Sa姐赏识，但Aka拒做「扯皮条」，然而，好友Leslie却以她的名义接客，更破坏江湖规矩，终惹得Sa姐对头人Eva姐寻仇，众人以为大祸临头，结局却出人意表！大Sir得知Heman及爆谷对自己调查不舍，终於与Heman摊牌，威迫利诱下，Heman面对人生交差点！

现实与理想难道真的难以并存？Heman面对前途及使命的左右为难，面对大Sir以酒、色、财、气的重重利诱，一时犹豫不决。同时，Aka亦面对左右为难的局面，好不容易与Heman冰释前嫌，约定今夜谁都不能阻止他们的相会，可是Leslie等好友有事相求，Aka两边都不想得失，想方法左右欺瞒，又会否得不偿失？爆谷独自调查，深信自己遇到的交通意外是人为，也想知道Yan的死亡真相，透过在警察的人际网络，追查到意外的肇事司机，真相是否就在眼前？而最后，爆谷竟然袭击Heman？难道所有事都与他有关？做坏事的人会不会有机会重生？7-11店员阿花，怀上前度的骨肉，打算堕胎，刀手6 Luck得知，大力阻止，愿意照顅两母子，阿花不相信他可以，两人进行一场赌局，阿花要6 luck做正行直到指定时限，不能动武，6 Luck的努力，阿花看在眼里。但还差几分钟成功在望之际，6 Luck仇家却找上门！

案情峰回路转，感情翻来覆去，世事从来真亦假时，假亦真。大Sir用尽方法，令所有人深信爆谷精神异常，说的话无人相信。另一方面，Heman接近大Sir的真正目的暴露，大Sir开始防范，所有线索看似断了。爆谷再找心理医生Edwin，不理劝告，进行危险的催眠，凭著记忆片断追查，记起整件事与一笔庞大的黑钱失踪有关，大Sir背后的集团成谜，Heman为得知当时黑钱收踪之事，竟找大丹合作？Aka与Heman关系僵持，Aka却心软为Heman通宵排队买心头好，却遇排队党连夜搅事，Heman到场维持秩序，再一次误会Aka只顾夜游，两人再度吵架，感情来到了临界点。爆谷凭著记忆，确定大Sir就是黑警！约他出来当面质问，又为何要如此对待自己，却原来有惊人内幕，唤起爆谷更多的记忆，叫他难以置信！

爆谷为了寻找失踪的黑钱，再找心理医生Edwin帮忙催眠，而Heman亦为此事奔走，最终得知黑钱来自此墨西哥毒枭。同时，爆谷终记起黑钱最后下落，立时寻找，只是螳螂捕蝉，黄雀在后，爆谷受袭，来人身份叫人惊讶！今夜正值Aka生日，她满心期待Heman会到来为她庆祝，可惜Heman正忙著追查黑钱之事，一时忘记。Aka因失落玩得放纵，Heman终记起Aka生日，赶往补救，却见Aka好友Leslie以Aka名义领取小姐接客的佣金，引起Aka与Heman误会，Aka意气用事，做出一夜情傻事。黑钱辗转落入大丹之手，爆谷及Heman报案，只是无人相信，Heman坚持用正途法律惩治坏人，可是爆谷不甘被动，对付坏人自要用一套非常手段！

Heman崩紧神经，迎来紧张的一夜，爆谷联同邪钉突袭大丹，成功拿回黑钱，可是邪钉出卖，更叫6 Luck处理爆谷，爆谷命悬一线。Heman终收到通知，邪钉预备夹带潜逃，Heman带领EU队与其展开混战，最后黑钱却被神秘人拿走。Heman正为黑钱下落焦急不已，然而爆谷却在调查一个拥有神秘纹身之人，说可能与案件有关，可惜并无所获。两人茫无头绪之际，却收到神秘短讯指示，黑钱失而复得，两人不知为何，大感奇怪，还未及整理神秘人是谁及其目的，两人却已因黑钱的处理方法而意见不合，未有决定，钱交由Heman放在安全之地。墨西哥黑帮老大对大Sir发出最后通知，立即寻回黑钱。大Sir要Heman凌晨3时前交出黑钱，不然Heman将过不了今晚。江湖立时风声四起，暗花卖起Heman，EU队员更被要钳制，不得插手。Aka透过Eva得知，竟焦急得要去买黑枪救爱郎？面对杀局，Heman如何应付？

难为正邪定分界。Heman单独面对杀局，EU队员是否真的袖手旁观？可以独善其身？在杀局之中，重重谜团逐渐解开，Yan的死亡真相，真凶出人意表！Heman在危难之中，Aka持鎗冒死前来相助，真爱战胜恐惧，一切误会尽数化解。爆谷及Heman二人终决定将黑钱交给警方，可是钱却不翼而飞？墨西哥黑帮终按捺不住，派杀手来抢夺黑钱！黑夜之中，众人迎来最后一战。Heman、爆谷、Aka、6 Luck、阿花、Leslie、大Sir各人故事似是告一段落，但神秘、美丽、危险的黑夜永远存在，每个Night Shift都将惊险刺激！