Le régent du Kantô interroge une jeune femme qui semble tout droit revenir du Japon moderne. Son nom ? Towa Higurashi. Aurait-elle un rapport avec Kagome Higurashi, l'humaine du Japon moderne qui avait accompagné Inuyasha dans sa lutte contre l'infâme Naraku ?

Quand elle était jeune, Towa passait ses journées avec sa sœur jumelle, Setsuna. Malheureusement, lors d'un feu de forêt, un étrange pouvoir les a séparées et Towa a atterri plusieurs siècles plus tard dans un Japon tout à fait moderne.

Alors que Moroha, Setsuna et Towa sont coincées dans le Japon de l'ère Reiwa, Moroha a une idée qui leur permettra d'emprunter le corridor vers le Japon féodal. Attention, cependant, car le prix à payer s'annonce élevé..

Setsuna et Towa sont mandées par Kohaku, afin d'exterminer un yôkai semant le trouble dans un village non loin. Sur ses traces, elles retrouveront leur nouvelle amie Moroha.

Jûbei envoie les princesses Yasha dans les montagnes pour enquêter sur de fréquentes disparitions de voyageurs. Sur place, les filles trouvent un village infesté de chats-yôkai.

Laissée au village par Setsuna, Towa décide de partir au mont Musubi pour chercher l'un des papillons qui le peuplent, en espérant que ça la mette sur la piste du Papillon des rêves. Cependant, en chemin, elle fait une drôle de rencontre.

Les princesses Yasha poursuivent Yotsume jusqu'au repaire de Kyûki, l'un des fléaux, que Jûbei leur a désigné comme cible. À leur arrivée, elles tombent cependant dans un piège onirique qui risque de faire des dégâts...

Moroha part à la recherche d'un yôkai ayant détruit un bastion du fameux Général Singe, mais Towa et Setsuna refusent de l'accompagner, peinant la jeune fille. Cependant, un coup du sort lui remontera le moral et c'est bien à trois qu'elles rencontreront Meifuku, un jeune yôkai dont le père a été lâchement assassiné.

Towa, Setsuna et Moroha sont dépêchées par Jûbei pour exterminer deux frères yôkai qui se battent et, ce faisant, nuisent aux villages alentour. Une fois sur place, l'un des deux frères remarque cependant les perles arc-en-ciel dans les yeux des filles de Sesshômaru. La convoitise les conduit alors à une trêve temporaire...

Alors que Moroha, Towa et Setsuna campent, Moroha aperçoit un oiseau se faire dévorer par un marécage. Ses deux compagnes ne la croient pas, mais elles changent d'avis lorsque Kohaku les envoie exterminer un marais dévoreur d'hommes...

Alors que Towa, Setsuna et Moroha gravissent une montagne pour exterminer le yôkai que leur ont désigné Jûbei et Kohaku, Towa semble graduellement s'affaiblir. Durant le combat, elle se révèle même n'être d'aucune utilité... Que peut-il bien se passer ?

Alors qu'un yôkai sévit dans les environs et dévore plusieurs moines à haute spiritualité, Kohaku envoie Hisui, Towa et Setsuna garder le père du premier, Miroku. Cependant, à la surprise générale, cette mission ne semble pas réjouir son jeune fils...

Setsuna, Towa et Moroha s'en vont chercher une nouvelle prime chez Jûbei. À leur arrivée, elles tombent sur Riku et une ravissante jeune inconnue, Tamano, qui leur raconte l'histoire de sa fuite du domaine de Homura, le démon de la montagne.

Riku nous raconte une histoire vieille de 18 ans mais intimement liée au présent, celle de la naissance de Towa et Setsuna.

Quelques années auparavant, Moroha a été larguée par son maître dans le creuset à venin, une étrange grotte où s'affrontent des yôkai jusqu'à ce que le plus puissant d'entre eux soit le dernier survivant.

Riku enclenche la deuxième phase de son plan. Pour avancer, il a besoin que les princesses Yasha mettent la main sur Konton et Tôtetsu, les deux fléaux restants. La vie des trois comparses est menacée...

Toujours aux prises avec le piège de Konton, Towa et Setsuna affrontent ce dernier. Pendant ce temps, Moroha entame un duel avec Tôtetsu.

Aiya, fille du régent du Kantô Danjô Hiiragi-Ôgigayatsu, organise un concours entre chasseurs de prime et exterminateurs. Tout concours qu'il se nomme, c'est en réalité une lutte à mort que devront se livrer les deux groupes...

Towa suit Setsuna alors qu'elle s'enfonce profondément dans les montagnes. Devant l'insistance de sa sœur, Setsuna lui révèle qu'elle a vécu ici une partie de son enfance.

Comment la perle arc-en-ciel a-t-elle vu le jour ? Pourquoi Riku la recherche-t-il ? La réponse à toutes ces questions, et bien plus encore, est sur le point d'être dévoilée...

Setsuna est en quête d'un affûteur. Pendant ce temps-là, Zero décide de mettre son plan à exécution et va chercher les princesses Yasha.

Les trois princesses Yasha se préparent à reprendre ce qui leur a été volé, mais dans les coulisses, de nouveaux personnages semblent avoir un intérêt dans la situation actuelle. Kirinmaru rend visite à une mystérieuse yôkai qui ressemble étrangement à Sesshômaru...

Towa, Setsuna, Moroha, Zero, Riku, Sesshômaru et Kirinmaru sont réunis à l'endroit où le père d'Inuyasha a perdu la vie. La bataille finale se prépare.

Alors que Towa pleure sa sœur, son père Sesshômaru lui tend son sabre Tenseiga. Towa parviendra-t-elle à ressusciter sa sœur ?

Towa, Moroha et Setsuna sont à la recherche de pistes les menant au fameux ingrédient dont a parlé Tôtôsai. La première d'entre elles se matérialisera sous la forme de la Femme serpentine, un yôkai qui protégeait autrefois les marins…

Comment exactement Rin a-t-elle fini prisonnière de l'Arbre des Âges ? Que s'est-il passé dans la jeunesse de Setsuna et Towa ?

Pour mettre la main sur la fameuse racine spirituelle, les trois princesses Yasha doivent pénétrer sur un territoire ceint par une puissante barrière. Ce sera l'occasion pour elles de se poser certaines questions, mais surtout d'obtenir de précieuses réponses.

La fille de Kirinmaru explique à Towa, Setsuna et Moroha que son âme est prisonnière du mont des Liens depuis 600 ans. Elle les supplie donc de la délivrer et de tuer son père.

Des hommes masqués enlèvent Setsuna, toujours en train de dormir, au nez et à la barbe de Towa. Notre exterminatrice se réveille dans la chambre d'Aiya, fille du régent du Kantô, qui se lance dans une tirade très émouvante au sujet de l'horrible existence qu'on lui fait mener…

Towa et Setsuna enragent, chacune dans son coin, de ne pas être assez forte pour protéger l'autre. Quant à Moroha, à deux doigts de solder son ardoise auprès de Jûbei, elle compte bien encaisser son dernier écu en acceptant le travail que lui offre Takechiyo…

Pendant que Zero s'apprête à tendre un piège à Towa, cette dernière chemine en compagnie de Rion et Riku. Setsuna débarque dans un village que les exterminateurs doivent défendre de l'avidité d'un dieu local, et Moroha est mise aux fers…

Lors de la petite conversation qu'elle a avec Mayonaka, le dieu qui terrorise le village, Setsuna comprend que l'histoire qu'on lui a racontée à son arrivée est loin d'être tout à fait exacte. Towa, elle, se désole de voir Riku devenu aveugle, pendant que Moroha récupère.

Comme à chaque nouvelle lune, Towa voit ses pouvoirs réduits à néant et sa chevelure virer au noir. Le Papillon des rêves ayant été tué par Sesshômaru, Setsuna est affectée par le même phénomène, pour la première fois de sa vie.

Moroha, Hachiemon et Takechiyo doivent déjouer un complot de taille, celui du serviteur en chef du clan des tanuki. Pour y arriver, ils ne peuvent guère compter que sur les indications d'un de ses anciens adversaires, mais Moroha a du mal à les comprendre…

Pour pousser Towa au désespoir, Zero s'ingénie à lui rappeler les plus tristes épisodes de sa vie, les petits moments de doute où elle ne s'est pas sentie pleinement acceptée dans son nouveau monde. Elle semble vouloir à dessein la mettre en colère, et un certain fil rouge pourrait être la clé du mystère…

Au vu de la progression du mal qui frappe Rin, elle n'en a plus pour très longtemps à vivre. Setsuna vole au secours de Towa, mais réussira-t-elle à l'empêcher de tuer Zero et ainsi commettre l'irréparable ?

Alors qu'elle avait enfin une chance de rencontrer ses parents, Moroha doit batailler contre Kirinmaru lui-même pour lui reprendre la perle noire où sont enfermés Inuyasha et Kagome. Le combat est terriblement inégal jusqu'à l'intervention de Sesshômaru, qui remet les pendules à l'heure…

Enfin, Moraha peut serrer ses parents dans ses bras. Mais les effusions sont de courte durée, car il faut mettre Inuyasha et Kagome au courant de la situation : Sesshômaru a été gravement atteint par l'attaque de Kirinmaru, ce qui signifie qu'il faut sortir de la perle noire à tout prix, et vite.

Tandis que Sesshômaru se vide de son énergie, ses filles tentent par tous les moyens de le rejoindre pour le secourir. Malheureusement, c'est plus facile à dire qu'à faire… à moins de réussir à attirer à soi l'épée de Sesshômaru, Tenseiga.

Towa a donné tout ce qu'elle avait pour sauver son père, mais à quel prix ! Seule une intervention miraculeuse pourrait la tirer des griffes de la mort, mais est-il encore temps ?

La victoire se profile pour le camp des hanyô, puisqu'enfin, les filles de Sesshômaru ont rejoint le palais de leur grand-mère, où se trouve aussi la Roue du Temps. Froidement reçues par leur aïeule, elles vont devoir en plus gagner le droit de traverser les âges.

Les portes du temps une fois franchies en direction de l'époque moderne, reste à arrêter l'étoile spirituelle dans sa course. Enfin, c'est ce qui était prévu, mais la comète demeure invisible, plongeant les trois cousines dans une grande perplexité.

Le professeur de Towa unit ses forces à celles des princesses pour venir à bout de l'étoile, et tous quatre finissent par l'immobiliser. Mais nos héroïnes vont comprendre, un peu tard, que tout danger n'est pas écarté pour autant, car leur allié de circonstance a d'autres projets en vue…

De retour dans le Japon féodal avec l'aide d'Akuru, les princesses constatent vite que la situation est grave : l'étoile spirituelle attire à elle tous les yôkai, que Kirin est en train de pourfendre allègrement. Il semblerait aussi que sa loyauté envers Kirinmaru soit toute relative…

Nos trois princesses, qui ont juré de sauver Rion, s'aventurent à l'intérieur même du Papillon spirituel pour tenter de la délivrer. Quand Kirin se dresse sur leur chemin avec la ferme intention de les arrêter, Towa n'a d'autre choix que de l'affronter pour permettre à Setsuna et Moroha de continuer leur route…

Sesshômaru s'est relevé et se lance avec Kirinmaru dans un duel dont l'issue ne peut être que la mort de l'un d'entre eux. Rion aura-t-elle le temps de révéler ses véritables sentiments à l'égard de son père, avant de disparaître dans les limbes ?

Tout est pour le mieux dans le monde où vit désormais Towa aux côtés de Setsuna et Moroha, de la même manière que sa famille adoptive a repris le cours de sa vie. Mais les filles de Sesshômaru se demandent à quoi rimait la série d'épreuves que leur père leur a infligées.