L'agent spécial Scott Forrester et son équipe volante du FBI basée à Budapest se rendent en Croatie, après qu'Isobel Castille leur a demandé leur aide pour capturer un fugitif américain qui s'est échappé à Zagreb avec une jeune fille de 14 ans. Omar Zidan poursuit la mission à l'étranger, avec l'intention de traduire le fugitif en justice, tandis que l'agent d'Europol Katrin Jaeger tente d'aider l'équipe à obtenir le soutien et l'accès nécessaires auprès des autorités locales peu coopératives.

L'International Fly Team est appelée à intervenir lorsqu'une jeune mère s'enfuit en Hongrie avec son fils, après avoir perdu la garde partielle de ce dernier aux États-Unis. Cependant, après que le garçon ait été enlevé par sa mère en plein jour à Budapest, l'équipe se demande quel parent représente le danger pour la vie de l'enfant.

Le détournement de millions de dollars de crypto-monnaie en route vers un coffre-fort de la Suisse cause la mort d’un transporteur américain, alors qu’un autre prend la fuite. L’équipe internationale du FBI doit tenter d’élucider l’affaire.

L'équipe enquête sur un citoyen américain qui clame son innocence après avoir cherché refuge à l'ambassade américaine de Madrid alors qu'il est encore couvert du sang de son petit ami espagnol assassiné. De plus, Cameron et Raines continuent de développer leur amitié.

L'équipe enquête sur la mort par empoisonnement d'un journaliste américain après qu'il ait tenté de rencontrer une source anonyme en Pologne. Par ailleurs, Kellett reproche à Forrester d'avoir été trop protecteur avec elle pendant la mission.

Après la disparition d'une négociatrice des services de renseignement américains et la découverte de son appartement parisien saccagé et couvert de son sang, l'équipe se met à la recherche d'elle avant que les secrets nucléaires du pays ne tombent entre de mauvaises mains. En outre, Forrester se surprend à faire des parallèles avec la disparition de sa mère.

Lorsque le fondateur américain d'un site illégal réservé aux adultes est tué à Prague, l'équipe est chargée de retrouver son cofondateur, qui est toujours en fuite en République tchèque. Par ailleurs, Kellett a du mal à maintenir une relation avec sa mère en raison des complications liées au fait de travailler si loin de chez elle.

Lorsqu'un groupe d'américains figure parmi les victimes d'un attentat à la bombe lors d'un festival à Budapest, l'équipe est appelée à trouver les auteurs de cet attentat avant qu'ils ne frappent à nouveau. De plus, lorsque le nouveau fiancé de Vo est blessé dans l'explosion, elle réévalue ce que signifie vraiment le fait de sortir avec quelqu'un pendant son séjour au bureau.

L'équipe se rend en Bulgarie lorsque des terroristes prennent en otage, pour des millions en crypto-monnaies, une salle de concert remplie d'étudiants multinationaux et de leurs familles. De plus, Raines a l'intention de prouver ses compétences sur le terrain, et Forrester reçoit des nouvelles de leur chien, Tank.

Kellett et l'équipe se joignent à contrecœur à une enquête en Irlande du Nord, lorsqu'un des informateurs de Kellett, louche mais précieux, arrêté pour son lien avec un vol et un meurtre, l'appelle pour l'aider à blanchir son nom.

Lorsqu'un officier de la police de New York est détenu en Transnistrie pour coups et blessures, l'équipe enquête sur ses allégations concernant l'infiltration d'un réseau de trafic sexuel dissimulé par les personnes au pouvoir. Forrester reçoit également un message inhabituel d'un expéditeur inconnu.

Lorsqu'un célèbre magnat américain de la technologie est impliqué dans un meurtre à Francfort, l'équipe doit le pourchasser au milieu des manifestants locaux qu'il a incités avec ses théories de conspiration sur les médias sociaux. Par ailleurs, Jaeger est ravie de travailler dans son pays d'origine et Forrester doit prendre une décision concernant le passé de sa mère.

Lorsqu'un couple s'enfuit en Albanie alors qu'il attend sa condamnation pour avoir escroqué des millions de dollars de fonds d'aide au COVID au gouvernement américain, la Fly Team et Jaeger doivent faire face à la famille criminelle et menaçante de l'épouse pour tenter de retrouver le duo. De plus, Kellett travaille sur l'affaire depuis Budapest alors qu'elle et Forrester tentent de retrouver leurs limites professionnelles.

L'équipe volante doit trouver comment assurer la sécurité du procureur général des États-Unis, alors qu'il se trouve en Hongrie pour une réunion importante. De plus, la soeur de Raines est à Budapest.

Lorsque la sœur de Raines est portée disparue au Kosovo, il part à sa recherche, mettant son travail et sa vie en danger. Kellett et Forrester font l'objet d'une surveillance accrue au sein du bureau.

L'équipe Fly se retrouve dans l'eau chaude lorsque Vo est retrouvé sur les lieux du meurtre d'un régulateur hongrois des jeux d'argent.

Lorsqu'un viticulteur américain est tué par balle sur son domaine viticole en France, l'équipe doit déterminer si le groupe de protestation local de la région, qui a un passé de violence contre les étrangers, est responsable.

Suite à une attaque frénétique d'hommes armés à bord d'un bateau de croisière fluvial appartenant à des Américains sur le Danube, la Fly Team se rend à Vienne pour enquêter sur les raisons pour lesquelles le bateau a été pris pour cible. De plus, Forrester se rend compte que ses sentiments de méfiance causés par son passé affectent ses relations personnelles.

L'équipe Fly et Jaeger se rendent à Berlin lorsque le fils de 19 ans d'un milliardaire américain est retrouvé inconscient dans son appartement. Alors que l'équipe travaille pour déterminer si un acte criminel était impliqué, ils se rendent compte qu'il y a également un groupe ténébreux sur l'affaire.

Lorsqu'un jet privé transportant des citoyens américains est abattu à l'extérieur d'une petite ville de Pologne, la Fly Team enquête sur l'homme qui a raté le vol. De plus, Forrester est en conflit lorsqu'il reçoit des informations de sa mère.