Дейзи, теперь известная как Дрожь, находит членов Сторожевых псов и атакует их. Однако их жестоко убивает появившийся на горящем Чарджере человек с огненной головой. Тем временем, Мэй, у которой есть своя ударная группа, рассказывает Колсону и Маку о случившемся. Оба встречают Фитца и Симмонс, которая является советницей нового директора. Колсон получает новый протез, а Мак видится с Еленой Родригез. Дейзи ищет убийцу - Призрачного гонщика. Она находит механика Робби Рейеса, тот перевоплощается в Гонщика и чуть не убивает Дейзи, оставив её жить. Колсон и Мак следят за японцами, которым достаётся контейнер. Глава японцев Чен открывает его и освобождает нечто, которое преследует Мэй. Фитц приходит к Доктору Рэдклиффу и видит ЛМД АИДУ. Рэдклифф объясняет Фитцу, для чего он создал её. Тот просит его не говорить об этом Джемме. Дейзи наблюдает, как Робби заботится о своём брате-инвалиде.

Дейзи снова находит Робби и снова проигрывает. Дух Люси освобождает остальных духов. Гонщик, распрашивая Дейзи, узнаёт местоположение духов. Прибыв с Дейзи, он убивает Духа Фредерика, спасая Фитца и Мака, и скрывается. Мак перебинтовывает руку Дейзи и догадывается, что она и Йо-Йо поддерживали связь. Дейзи заключает союз с Призрачным Гонщиком. Тем временем у Мэй всё больше видит галлюцинации и её вырубает директор Мейс, оказывающийся нелюдем.

Сторожевые псы, подставляя нелюдей, вырубают электричество в четырёх городах: Майами, Лос-Анджелес, Москва, Лондон. Агент Родригез находится в Майами, куда прибывает банда Псов чтобы найти её и убить, однако Колсон, Фитц и Мак находят и выручают её. Тем временем Симмонс и Рэдклифф спасают Мэй от смерти. Робби и Дейзи собираются навестить его дядю, но спешат найти Гейба, брата-инвалида Робби. Директор Мэйс объявляет Щ.И.Т. легальной организацией, в то время, как сенатор Эллен Надир, выступающая против нелюдей, уходит из дома своего брата, подвергнувшегося Терригенезизсу.

Колсон и Мак разговаривают с Элайем Морроу, который работал с Люси Бауэр, которая сейчас является призраком. Тот отказывает им в поддержке. Затем Колсон и Мак ловят Призрачного гонщика, племянника Элайа. Дейзи и Джемма собираются спасать нелюдей от Сторожевых псов и первым находят Джеймса, который освободился от контроля Улья. Робби навещает дядю и тот рассказывает ему о Даркхолде, книге в которой собраны все знания, которую ищет Люси и призраки. Джеймс оказывается в союзе с Псами и предаёт Дейзи, так как начал ненавидеть нелюдей и себя, считая их скверной. Он чуть не убивает Джонсон и Симмонс, но на помощь приходит Робби Рейес. Призрачный гонщик побеждает Адское пламя. Дейзи возвращается в Щ.И.Т. Мэй, Колсон и Симмонс узнают, что АИДА ЛМД. Люси узнаёт от своего мужа Джозефа, где книга.

Джозеф погибает, так как был заражён своей женой. Колсон, Мэй, Мак, Робби собираются вытащить Элайа из тюрьмы, где также находятся Люси, Хьюго и Винсент. Робби сжигает души двух последних и убивает Сантино Ногеру, члена банды Пятой Улицы, которая когда-то напала на братьев Рейес и лишила Гейба способности ходить. Люси похищает Элайа и заставляет прочесть найденный ею Даркхолд. В это же время Симмонс понимает, что с директором Мейсом что-то не так, а он раскрывает всему миру, что является нелюдем.

Робби рассказывает своему брату и Дейзи правду о нападении Пятой Улицы. При нападении Робби молил чтобы Гейб выжил, затем ударился о землю и погиб. Тогда он услышал голос, предлагающий ему отомстить за себя и брата. Робби согласился и прибыл Призрачный гонщик на мотоцикле, который вытащил Гейба из горящей машины и наделил Робби способностями Призрачного гонщика. Директор Мейс ненамеренно злит Робби и директору приходиться сразиться с Гонщиком. Гейб успокаивает брата. Симмонс отправляется на задание по приказу директора. Щ.И.Т. готовит операцию по спасению Элайа, однако выясняется, что Элай превратил сотрудников Моментума (Люси, Фредерика, Хьюго и Винсента) в призраков. Робби сжигает душу Люси и Мэй забирает Даркхолд. Элай устраивает энергетический взрыв, из-за которого пропадают Колсон, Фитц и Робби, а сам Элай получает сверхспособности.

Колсон, Фитц и Робби попадают в зеркальное измерение, откуда их никто не видит и не слышит, а Элай сбегает, убив несколько агентов. Директор Мейс требует вернуть Симмонс на базу и Фитц узнаёт, что Мейс отправил её в опасное место и та не может вернуться. Дух возмездия покидает Робби и вселяется в Мака, после чего тот уезжает на мотоцикле за китайцами, с которыми сотрудничает Элай. Дейзи следует за ним на Чарджере, в то время как с ней находится Робби. Мак превращается в Призрачного гонщика, но Робби удаётся уговорить Дух вернуться. Мэй даёт Рэдклиффу возможность прочесть Даркхолд для возвращения Колсона, но доктор опасается, что это перегрузит человеческий мозг, после чего АИДА читает книгу и создаёт портал, через который Колсон, которого чуть не поглотило зеркальное измерение, Фитц и Робби возвращаются обратно. Джемма помогает брату-нелюдю сенатора Надир раскрыть кокон Терригенезиса, в котором тот провёл семь месяцев. АИДА, в тайне от всех, начинает создание собственного разума.

Рейес, Джонсон и Родригез идут к возможному местоположению Элая, но встречает его только Робби. Элай протыкает его насквозь штыком из углерода и показывает, как он создаёт воду, как он утверждает, из ничего, и раскрывает свои мотивы. Колсон и Мэй сообщают директору о том, что АИДА - андроид. Они раскрывают его сотрудничество с Надир, но затем понимают, что Мейс старается защитить Щ.И.Т. Колсон, Мак, Мэй, Йо-йо и Мейс в суперкостюме вступают в стычку с китайцами, в то время как Дейзи, Фитц, Симмонс, Рэдклифф и АИДА строят машину для телепортации. Из-за Елены Элая отбрасывает в его собственный механизм. После включения машины телепортации в другое измерение Призрачный гонщик выбирает разобраться с собственным дядей, не смотря на то, что Колсон пытается вытащить его с помощью цепи, и пропадает в другом измерении. На публике директор Мейс заявляет, что Дрожь всегда была агентом под прикрытием и что она всех спасла. Дейзи соглашается вернуться в Щ.И.Т. У Мака и Йо-йо наконец начинаются романтические отношения. Джеффри разрешает Рэдклиффу работать над Жизнеспособной Моделью Человека под надзором Щ.И.Т.а, но АИДА тайно убивает агента Нэйтансона и заменяет Мэй на ЖМЧ...

Симмонс удается установить личность нелюдя, которому она помогла пробудиться. Узнав, кто он, директор Мэйс вместе с агентами отправляется на его поиски. Тем временем база ЩИТ-а в опасности. Аида, получив знания от Даркхолда, берет управление станцией в свои руки. Восстание роботов, которого так боялся Мак, вот-вот начнется...

Сторожевые псы совершают покушение на директора Мейса, в результате чего Дейзи ловит одного из них. Колсон, Мак, Мейс и Бёрроус терпят крушение квинджета. Сторожевые псы забирают кейс, который так отчаянно пытается вернуть Мейс, у мёртвого Бёрроуса. Колсон и Мак узнают, что Директор не является нелюдем, а просто использует улучшенную сыворотку суперсилы Кэлвина Джонсона. На помощь им приходят Дейзи и ЖМЧ Мэй, которая обнаружив у себя ранение, начинает задумываться, кем она на самом деле является. Генерал Тэлбот рассказывает Фитцу и Симмонс о проекте "Патриот". Мейс хочет вернуть пост директора Филу, но тот отказывает, понимая, что Мейс — хороший человек для Щ.И.Т.а.

Мейс, Тэлбот и Дейзи находятся на встрече с Эллен Надир, где ловят Колсона и Йо-йо. Фитц раскрывает планы Рэдклиффа, который в сделке с Надир, и его арестовывает Щ.И.Т, но это лишь ЖМЧ копия трансгуманиста. АИДА и Рэдклифф отправляют разум Мэй в изменённые воспоминания времён Бахрейна, в то время ЖМЧ Мэй не может сообщить никому, что она не человек, из-за того, что она на это не запрогромированна. Мак рассказывает Елене тайну о Хоуп.

Сторожевые псы берут в плен Билли Кёнига, которому Колсон доверил Даркхолд. Фитц хочет выяснить, как Рэдклифф запрограммировал своего ЖМЧ. Тот мучает Фитца словами про его отца. Оказывается, у ЖМЧ имеется настоящий мозг из квантовой энергии, о который узнала первая модель АИДЫ из Даркхолда. На базе "Лабиринт" Колсон, Дейзи, Сэм и Эл Ти Кёниг спасают Билли, однако Рэдклифф забирает книгу у ЖМЧ Мэй, которую раскрыли Фитц и Симмонс. На Зефире-1 Колсон сообщает, что семья Кёнигов была частью задумки ЖМЧ.

Правая рука Антона Иванова Терренс Шокли наведывается к Эллен Надир и разбивает кристалл Терригена, чтобы проверить, является ли Надир нелюдем, однако сам получает способности и убивает её взрывом. Щ.И.Т. ловит Шокли, но директор Мейс схвачен Сторожевыми псами. Тем временем Колсон и Мак встречают Агнес Китсуорт, бывшую возлюбленную Рэдклиффа, на основе которой он создал АИДУ. Холдэн переносит её сознание в виртуальную реальность, так как у неё имеется опухоль мозга и жить ей осталось недолго.

Щ.И.Т. спасает Мейса, а Дрожь побеждает Антона Иванова. На "Площадке" Фитц и Симмонс обнаруживают, что АИДА заменила Колсона, Дейзи, Мака и Мейса на двойников...

АИДА убивает Рэдклиффа, считая его угрозой Скелету, виртуальной реальности, куда были погружены сознания агентов, и создаёт Иванову роботизированное тело для защиты Скелета. Фитц и Симмонс понимают, что кто-то из них также является ЖСМ. Испуганная Джемма под дулом пистолета заставляет Фитца порезать тому кисть, чтобы проверить его. Он режет кисть, Джемма уже готова помочь ему, но он вырубает её. Очнувшись, Джемма сама уничтожает двойника Фитца. Дейзи обнаруживает множество своих копий и, забрав дробовик у ЖСМ Мака, находит и успокаивает Симмонс. ЖСМ Мейс и ЖСМ Колсон приказывают всем агентам найти их и Джемма распыляет усыпляющий газ. Пока Дейзи уничтожает копии Мейса и Мака, Джемма будит Пайпер, Дэвиса и Принса. Двойник Колсона встречает ЖСМ Мэй, которая позволила агентам проникнуть в Зефир-1 и улететь, после чего она взрывает базу вместе с собой и двойником Фила. Дейзи, Симмонс и остальные подбирают Йо-Йо Родригез , и затем Дейзи и Джемма погружаются в Скелет ради спасения похищенных АИДОЙ агентов.

Дейзи и Джемма пробуждаются в Скелете и обнаруживают для себя, что Грант Уорд жив и является агентом Гидры, как Мэй и Фитц, а Дейзи, имя которой всё ещё Скай, не прошла через Терригенезис. На нелюдей ведётся охота: Линкольн Кэмпбелл мёртв, а над Виджаем Надир Фитц проводит эксперименты. Любовницей Фитца является лидер Гидры Мадам Гидра. Колсон не может вспомнить Джемму, после чего на неё и Дейзи ведут охоту, но тут им помогает Уорд, работающий на Сопротивление Нелюдей.

Лидером Сопротивления оказывается Джеффри Мейс. Дейзи схвачена из-за действий Мака, котороый защищал свою дочь Хоуп. Уорд, Джемма и Колсон приходят за Рэдклиффом, который всё помнит и говорит, что выбраться из Скелета невозможно. В это же время к Рэдклиффу прилетают Мадам Гидра и Фитц, который убивает Агнес Китсворт, несмотря на попытки Холдэна убедить Фитца, обманутого АИДОЙ, что этот мир не настоящий. К Сопротивлению присоединяется Мак, желающий помочь спасти Дейзи.

Мейс, Колсон и Бёрроус отправляются на задание по спасению людей из филиала Гидры. Там они находят учеников Колсона Бёрнелла и Криса, а также агента Щ.И.Т.а Антуанна Триплетта. Мадам Гидра отправляет Мэй устранить Патриота. Квинджет обрушивает здание, в то время как Мейс удерживает его, чтобы остальные успели выбраться, и погибает под завалами. Мэй, вдохновлённая самопожертвованием Патриота, распыляет Терриген на Дейзи

Мелинда Мэй и Дейзи Джонсон присоединяются к Сопротивлению и травмируют Офелию, после чего главой Гидры становится Фитц. Колсон, Мэй, Уорд, Дейзи и Бёрроус захватывают студию Сунила Бакши, и Колсон объявляет всему миру, что Патриот был героем, и Гидра все фальсифицировала, а сам он — агент Щ.И.Т.а. Дейзи, говорит Уорду из Скелета, что в реальном Уорде всё же было что-то хорошее. Джемма и Трип узнают план Фитца и Офелии: АИДА готовиться создать себе настоящее человеческое тело.

Симмонс наведывается к Алистеру Фитцу и убивает его в самообороне. Прибыв на место портала в реальный мир, все перемещаются туда, кроме Мака, который решил остаться с Хоуп. Рэдклифф также загоняет Фитца в портал. АИДА создаёт себе живое тело и телепортируется вместе с пробудившемся Фитцем в неизвестном направлении.

Дейзи, Симмонс и остальные спасают Колсона и Мэй, вынужденных противостоять роботизированным копиям Антона Иванова. Фитцу удаётся убедить АИДУ, теперь Офелию, спасти Мака, но обоих вырубает Джемма. Фитц, понимающий, что натворил в Скелете, отвергает Офелию, и она в порыве гнева пытается убить всех, кто ему дорог. Убив Дэвиса и Принса и продемонстрировав новообретённые способности Гордона, Линкольна и Виджая Надир, она сбегает к Иванову, а Тэлбот и армия прочёсывают "Площадку", после чего из уцелевшего портала, построенного Рэдклиффом, выходит Призрачный гонщик. Йо-Йо погружается в Скелет, чтобы найти Мака, что оборачивается для неё плохо...

Елену спасает Рэдклифф, запрограммированный Дейзи найти её и Мака и вытащить их из Скелета. Тем временем Робби Рейес пытается убить Офелию и забрать Даркхолд, после чего объединяется со Щ.И.Т.ом. Иванов пытается заставить людей на собрании по судьбе Щ.И.Т.а прочесть Даркхолд, но прибывшая ЖСМ Дейзи подстреливает Гленна Тэлбота, после чего тот впадает в кому, а Даркхолд забирают Колсон и Мэй. Офелия находит Фитца и убивает Джемму после того, как Фитц рассказал ей, что Колсон хочет уничтожить Даркхолд, однако Колсон, временно ставший Призрачным гонщиком, убивает Офелию, убившую не Джемму, а её ЖСМ. Скелет самоуничтожается. Бёрроус и другие пропадают, затем исчезает Хоуп. В итоге Мак и Елена просыпаются в реальном мире, а Рэдклифф окончательно умирает. Робби забирает Даркхолд в другое измерение. Колсона, Мэй, Дейзи, Фитца, Джемму, Мака и Йо-Йо похищают и отправляют в космос.

2091 год. Колсон и команда, кроме Фитца, обнаруживают себя в космосе, сталкиваясь с хищным вреллнексианином, который убивает Вёрджила, сказавшего Филу, что агенты прибыли спасти человечество. Команда сталкивается с Крии, из рук которых их хитростью вытаскивает наёмник и торговец Дик. В разговоре с ним Колсон понимает, что белый Монолит переместил их не через пространство, а через время, в то время, как Мэй и Симмонс, угнавшие космический корабль, видят расколотую на множество осколков Землю...

Земля была уничтожена Дрожью, о чём Дейзи узнаёт, пройдя в Скелет, где временами просиживает Дик. В это время Тесс, одна из многих выживших людей из колонии, помогает Колсону, Мэй, Джемме, Маку и Елене. Хитрый торговец Грилл вживляет Колсону, Маку и Елене импланты. Когда Симмонс пытается помочь раненому прислужнику Крии из людей, её забирают к Касиусу, командующему Крии. Он внедряет в её организм серую слизь, после чего Джемма становится его прислужницей.

Симмонс приказано помочь молодому нелюдю по имени Эбби обуздать свою силу — контроль плотности собственного тела. Касиус демонстрирует Эбби в бою и продаёт её Леди Баше, после чего ловит Дейзи с помощью Дика. Тем временем, Колсон, Мэй, Мак и Тесс летят к осколку Земли, откуда отражаются радиосигналы, и приходят к выводу, что они с поверхности планеты. Чтобы спасти свои жизни, они подставляют помощника Грилла Зева, и того высаживают на Землю, где его убивают вреллнексиане.

Грилл поручает Маку заставить его должника Ганнера вернуть долг. Мак и Елена угрожают ему, но понимают, что Ганнер не платил, так как у него появился ребёнок, купленный у Крии. Дик, Колсон и Мэй прониакют на Станцию 35, где также видят новорождённого. Дик объясняет, что через еду Крии стерилизовали всех, так как синекожие пытаются вывести новых нелюдей для Касиуса, а затем раскрывается, что он продал Дейзи, и Колсон забирает у него плату, отдав её Ганнеру и заперев Дика, но оставив Мэй на бой с Синарой. После избиения Ганнера из-за слов того, что Мак не достоин быть отцом, Мак разочаровывается в себе. Дейзи встречает владеющего телепатией нелюдя Бена. Он говорит Дейзи, что Касиус хочет уничтожить Маяк после своего ухода, и на демонстрации Дрожи другим инопланетным расам появляется Лео Фитц...

В июне 2017 года всю команду за исключением Фитца отправили в будущее. Фитца арестовывают военные и допрашивают на протяжении полугода, предоставляя ему все нужные ресурсы, чтобы он мог спасти команду, но безуспешно. Тогда его спасает Лэнс Хантер, и вместе они находят Инока, который и отправил агентов Щ.И.Т.а в будущее. Пришелец желает помочь им и приводит Фитца и Хантера к Робин, дочери погибшего Чарльза Хинтона, который мог предсказывать будущие трагедии. Она обладает схожими способностями, но показывает будущее в рисунках. Все отправляются в бункер Маяк. Инок говорит, что прибыл на Землю в капсуле 30000 лет назад, и, чтобы найти эту капсулу, Фитц и Хантер возвращаются на военную базу, откуда забирают и Зефир-1. Фитц уложен в криогенный сон на 74 года, где в будущем его должен разбудить Инок.

На показ сил нелюдей прибывает множество инопланетных представителей со всей галактики. Бен сражается с Мэй и побеждает, после чего её отправляют на поверхность планеты, куда за ней следует Инок. Бена же убивают за помощь Дейзи. Фитц, скрывающийся под именем Бошток Марадёр, делает оглушённой Симмонс предложение руки и сердца, но Джемма его не слышит. На втором бою, где Разрушительницу Миров хочет выкупить брат Касиуса, Дейзи бьётся с Синарой и, победив, устраивает удачный побег с ФитцСиммонс. Оба хотят жениться. В это же время, шестнадцатилетний Флинт проходит Терригенезис. С помощью новообретённых способностей он в самообороне убивает Грилла. За то, что Тесс не выдала местонахождение мальчика, её убивают.

На поверхности Инок находит Мэй и вместе они оказываются на базе Щ.И.Т.а, встреченные постаревшей Робин Хинтон. Сбежавший Дик приводит Дейзи, Фитца и Симмонс к Колсону, Маку и Йо-Йо. Забрав Флинта от Синары, они спешат к кораблю на Землю, но Мак и Елена решают остаться на Маяке и помогать Флинту, желающему спасать обитателей станции. Подлетая к планете, Колсон, Дейзи, Фитц, Симмонс и Дик попадают в энергетический шторм. Касиус убивает своего брата Фолнака и просит Синару привести к нему Разрушительницу Миров, и тогда отец вновь зауважает Касиуса.

Мелинда, Колсон, Джемма, Фитц и Дейзи знакомятся с оракулом по имени Робин, которая подсказывает агентам способ вернуться в свое время. Тем временем Касиус, отправив Синару в погоню за разрушительницей миров, решает немедленно уничтожить оставшихся под его началом людей. Это только усложняет задачу Мака, Флинта и Йо-Йо, старающихся пробраться на третий уровень в поисках заветной коробки. Между тем Скай на земной базе пытается получить от провидицы ответы, не подозревая, какая угроза поджидает их с друзьями.

Игнорируя советы Энока, команда пытается починить управление самолетом, а Дик никак не решит, на чью сторону встать — пленника или пришельцев из будущего. Тем временем Касиус, узнав, что люди не только выжили, но и захватили несколько этажей, использует секретное оружие, дабы напомнить мятежникам об их положении, а также выдвигает тем условия возможного помилования. Мак, Йо-Йо и Флинт решают пойти на риск, чтобы дать достойный ответ синекожему диктатору. Скай же придется закончить бой, начатый еще на базе.

Благодаря наводке своей провидицы Касиус начинает лично преследовать агентов. После гибели Синары он решается на самые отчаянные меры для достижения желаемого. Тем временем главной задачей членов команды становится помощь Флинту в воссоздании временного портала, а также обеспечение достаточной мощности для его функционирования. В процессе выполнения задуманного Йо-Йо ждет пугающая встреча и зловещее предсказание, Мака — запоминающийся бой, а Дика — нелегкий выбор ради спасения товарищей. Колсон же идет наперекор Дейзи, а возвращение некоторых его коллег ставится под вопрос.

Агенты переносятся в свое время и сразу же берутся выяснять происхождение странного луча света, направленного на Землю из космоса. Пока Колсон с командой пытается исследовать необычное явление, оставшаяся на маяке Скай отправляется на помощь новому знакомому, каким-то образом оказавшемуся в их времени. Остальных членов команды ждет неожиданная встреча с бывшей помощницей, любопытное открытие, а также серьезный бой, не прошедший для друзей без последствий.

Проведя сканирование помещения, Фитц обнаруживает, что взрыв образовал пространственно-временную дыру, которая начала генерировать страхи каждого из членов команды, воплощая их в реальность. Споря о том, кто из них готов пожертвовать собой, чтобы уничтожить пространственно-временную прореху, друзья случайно узнают о секрете Колсона. Тем временем Йо-Йо и остальных начинают одолевать ожившие кошмары, а Дик отправляется на поверхность с важной миссией, от которой зависит исход операции и будущее его новых знакомых.

Фитц обнаруживает, что их старания по запечатыванию разрыва принесли лишь временный результат. Чтобы укрепить «заплатку», агентам нужно найти максимальное количество вещества, способного раз и навсегда закрыть эту щель. Оставшись вместе с Йо-Йо и Диком в убежище, Лео пытается освободиться от приставучего новичка. Остальные же отправляются на поиски человека, знающего о местоположении нужного им вещества. Между тем Вернер фон Штрукер получает от генерала Хэйл предложение присоединиться к ее отряду, а ее дочь Руби делает все, чтобы юноша согласился остаться.

Фитц никак не может придумать способ навсегда закрыть разлом, а тем временем наружу выбирается еще одна аномалия, поразительно похожая на него. Двойник без промедления начинает заниматься своим любимым делом, предварительно взяв одного из членов команды в заложники для своих экспериментов. Между тем Колсону и Мэй удается заманить генерала Хэйл в ловушку, однако чрезмерная вера главы «Щ.И.Т.а» в свое везение играет с ним злую шутку. Симмонс же ждут любопытные новости от Дика, немного скрасившие осознание того, что ее брак оказался под угрозой.

28 лет назад юная Хэйл, уверенная, что ее блестящие знания и умения будут оценены по достоинству, ждет распределения, но оно не оправдывает ее ожиданий. За два года до настоящих событий мать Руби узнает о секретном проекте, связывающем Землю с разумными существами с других планет, призванными помочь в защите от надвигающейся войны. В настоящем же, узнав от генерала про ее проект, Колсон раскрывает причину будущего разрушения Земли, в то время как Дейзи пытается отыскать альтернативное решение текущей проблемы.

Заняв место лидера, Дейзи разрабатывает план спасения Колсона. Джемма заручается помощью восстановившейся Йо-Йо, чтобы вытащить Лео из камеры и найти Фила. Тем временем Хэйл испытывает вещество на Криле. Одержимый голосами, тот отправляется поквитаться с новым заключенным, однако в процессе изменяет свои намерения. Захватив с собой Тэлбота, мужчины стараются выбраться из заключения. Вернер продолжает трудиться над расшифровкой записей отца, а Руби стремится доказать готовность стать разрушительницей миров.

Стараниями Дейзи и ее части команды Колсону с Тэлботом удается спастись, однако во время операции Дик попадает под огонь Хэйл, и в отсутствие Симмонс спасти его оказывается весьма проблематично. Тем временем группа Фитца проникает на секретную базу и находит странное устройство, записи о котором наконец-то расшифровывает Вернер. Последний же не только делится радостной вестью с Руби, но и дает девушке стимул сбросить оковы рабства и взять исполнение задуманного в свои руки. Йо-йо же ждет битва со старым знакомым, а Джемма с Лео вскоре оказываются в безвыходном положении.

Фитц с Симмонс как могут оттягивают починку устройства, однако обстоятельства вынуждают их все же выполнить задачу. Тем временем, обнаружив местоположение Хэйл, Дейзи с Мэй отправляются в ее укрытие, где объединяются с генералом, чтобы с ее помощью остановить Руби от необдуманного шага. Тэлбот же, подчиняясь приказу, начинает тайную миссию Гидры по похищению провидицы, и Колсону приходится рискнуть жизнью для разрешения этой ситуации. Вернеру же удается запустить созданное отцом устройство, а Йо-Йо идет на жертвы ради спасения мира.

Под удобным предлогом и при поддержке Мэй Дэйзи отправляется на поиски средства, способного спасти Колсона от смерти. Тем временем Тэлбот, одержимый некими цифрами, сообщает Филу о грозящей всем им опасности, что рушит планы последних использовать гравитониум для запуска двигателя. Агенты обнаруживают взявшийся из ниоткуда корабль инопланетян, намеренных любыми способами получить необходимое им вещество. Противостоять им, даже с учетом встроенной в убежище защиты, оказывается практически невозможно.

Захватив с собой друга, Тэлбот добирается до корабля пришельцев, где не только устанавливает свои правила, но и добивается включения себя в члены Совета Конфедерации. От Гленна Фил узнает об угрозе Земле в лице врага, непобедимого даже для альянса, а также о новом союзнике генерала, в котором Колсон признает представителя уже знакомого ему семейства. Между тем остальные агенты приступают к спасательной операции, а Джемма с Фитцем начинают работу над сывороткой, призванной спасти жизнь их лидера.

Дейзи получает ультимативное предложение от Тэриана, не подозревающего о знаниях и настоящей силе женщины, в то время как стараниями Дика, Колсон и Мэй не только освобождаются из заключения, но и получают свежие сведения о Тэлботе. Последний между тем уверенно продвигается к осуществлению задуманного, и вскоре становится понятно, что образумить его не получится. Сумев противостоять Ковасу, агенты переходят к главной миссии и оказываются перед сложнейшим выбором, ведь спасти мир от разрушения они смогут, лишь пожертвовав одним из товарищей.

Оказавшись перед непростым выбором, агенты затевают нешуточный спор, который разрешается непредсказуемым образом. Тем временем между Диком и Дейзи состоится важный разговор, после которого женщина принимает неожиданное для остальных решение. Вскоре Джонсон предстоит самая важная битва в жизни, Мак обзаводится новыми обязанностями, а Джемма узнает печальные новости. Впереди же членов команды ждет прощание с близким им человеком и путешествие навстречу новым подвигам.

Команда разделена миллионами световых лет ради решения двух основных задач: найти в космосе погруженного в анабиоз Фитца и понять, кто прорывается на Землю из другой реальности через таинственные порталы. Мак осваивается в новой роли директора, в то время как Йо-Йо решает не ставить крест на своей личной жизни.

Странные пришельцы приступают к осуществлению своей миссии на Земле, для чего им понадобятся таинственные кристаллы. Агенты Щ.И.Т. выслеживают преступников, и Мэй сталкивается с незнакомыми технологиями прежде чем вступить в рукопашную схватку.

Едва разминувшиеся в космосе Фитц и Симмонс наконец-то оказываются на одной планете, но им предстоит пройти длинный путь, прежде чем найти друг друга. Энок применяет свои невероятные способности, чтобы вытащит друга из сложной ситуации. Команде придется столкнуться с новым противником.

Беззаботному процветанию Дика Шоу приходит конец, и гостю из будущего грозит смертельная опасность. В это время на базе Щ.И.Т.а происходят странные и ужасные события, которые помогают лучше понять мотивы отряда пришельцев из другой реальности.

У Мэй наконец-то появляется возможность поближе узнать новых врагов Щ.И.Т.а. В это время Скай, Симмонс и другие члены космической команды пытаются спасти Фитца и Энока от хроникомов. Мак, Йо-Йо и доктор Бэнсон продолжают расследование трагедии, произошедшей на Маяке.

Фитц и Симмонс наконец-то вместе, но не свободны. Хроникомы пытаются выяснить у пары гениев способ путешествия во времени. Попутно мужу и жене придется столкнуться с глубокими личными проблемами, которые могут помешать работе и обоюдному счастью.

Мэй удается захватить и привезти на Маяк Саржа и остатки его команды. Агентам Щ.И.Т.а предстоит разобраться с истинной миссией и намерениями пришельцев. В это время Энок, Фитц и Симмонс снова рискуют жизнью, но неожиданно приобретают покровителя.

Команда отважных защитников Земли готова прибегнуть к помощи самых сомнительных людей, чтобы защитить планету от монстра, уничтожающего целые миры. В это время в глубоком космосе на корабле, с которым Фитц и Симмонс возвращаются домой, происходит нечто странное.

Напряжение нарастает, когда к точке встрече на полном ходу приближаются заминированный грузовик Саржа, космический корабль с новой знакомой Фитца и Симмонс и «Зефир» с остальной командой на борту. Удастся ли агентам предотвратить катастрофу? Смогут ли Джемма и Леопольд вернуться на Землю?

На утро после празднования победы не всем удается восстановить в памяти прошлый вечер. Враг, о котором чуть не забыли, снова дает о себе знать. Дик и Фитц пытаются найти связь между Колсоном и Саржем, а остальная команда вычисляет опасного гостя на Маяке. Смогут ли агенты отличить своего от чужого?

Йо-Йо и Мак оказываются в плену у Айзел, но злодейке нужны не эти двое. В это время на Маяке Мэй и Дейзи допрашивают Саржа, пытаясь добраться до его сущности, а Дик, Джемма и Лео изучают способности врага, чтобы найти способ защитить агентов от привычки Айзел занимать чужие тела.

Йо-Йо и Мак встречают старого знакомого, который обладает необычайными способностями. Айзел все ближе к исполнению своего плана, и агентам Щ.И.Т.а придется очень постараться, чтобы ей противостоять. Пока Фитц-Симмонс и Дик разрабатывают средства защиты, Дейзи и Мэй помогают Саржу подобраться поближе к врагу.

Финальная схватка с Айзел открывает новые стороны и страшные секреты героев. Сможет ли Дейзи перебороть себя и освободить друга от мучений? Оправдаются ли надежды Мэй на то, что Сарж хотя бы отчасти был Колсоном? Будет ли угроза вторжения демонов из другой реальности последним приключением команды?

Колсон и агенты оказываются отброшены назад во времени в Нью-Йорк 1931 года. Теперь команде предстоит гонка со временем, чтобы выяснить правду обо всем произошедшем.

После вечеринки Рузвельта пути агентов расходятся: Мак и Дик сопровождают Фредди на встречу, о сути которой знает только он, а Дейзи и Колсон возвращаются в бар "Рыба-меч", чтобы узнать подробности о произошедшем от раненной девушки. В это время хроникомы и не думают бросать погоню, а агент Мэй наконец-то знакомится с новым членом команды.

Оказавшись в 1950-х в штате Невада, агенты получают новую задачу в битве против Хроникомов за историю Щ.И.Т.а. Команде предстоит защитить лучшие умы организации, для чего герои должны проявить недюжинную смекалку. Однако, операция может оказаться под угрозой из-за неожиданного знакомства. Смогут ли агенты защитить своё прошлое от вмешательства?

Приключение в 1950-х продолжается. Колсону предстоит сопровождать Сузу на важную сделку, но друг агента Картер может действовать непредсказуемо. Пока события приближают героев к неизбежному, Дик попадает в неприятности и встречает старого знакомого. На этот раз агенты должны сохранить важную веху в истории Щ.И.Т.а и обрести нового соратника.

Попав в 1973 год, агенты обнаруживают, что течение времени сильно изменилось, и последствия следующих действий могут извратить будущее до неузнаваемости. Героям предстоит разом решить несколько задач: избавиться от Уилфреда Малика, остановить разработку опасного оружия, и спасти родителей одного из агентов, внезапно оказавшихся в центре событий.

После того, как агенты Щ.И.Т. выдали своё местоположение и повредили летающую базу, команде предстоит отчаянная операция по спасению родителей Мака. Герои должны предотвратить вмешательство хроникомов в историю и отремонтировать корабль, пока Дейзи и Суза выживают в плену у Натэниеля Малика.

После того, как Зефир совершает непредсказуемый прыжок во времени и оставляет Мака и Дика в 1982 году, директор и юный изобретатель оказываются сами по себе. Пока Мак тяжело переживает потерю родителей, Дик пытается создать подобие Щ.И.Т.а. Но агентам еще рано расслабляться по поводу хроникомов...

Пока Мак и Дик выживают в 1983 году, команда на Зефире пытается починить машину времени. Для этого необходимы способности Йо-Йо, но девушка еще не до конца восстановилась. Сможет ли Елена осознать правду и вернуть себе скорость? Суза получает неожиданный подарок, а у героев появляется новый враг.

Починка машины времени усилиями Йо-Йо не помогла, и Дейзи оказывается заключена во временной петле, о которой знает только она и ещё один член команды. Вместе они пытаются найти решение, в то время как "Зефир" неумолимо затягивает в воронку времени. Смогут ли герои справиться с неординарной задачей и спастись?

Вырвавшись из временной петли, агенты возвращаются в 1980-е, чтобы помочь Джай Йин и её нелюдям избавиться от Натэниеля. Однако на стороне злодея технологии хроникомов, и героям будет непросто справиться с его возросшей силой. Симмонс всё чаще задумывается о том, что она забыла, а Колсон встречает старого знакомого.

Кору привозят на Маяк, и у агентов появляется шанс побольше узнать о смертоносной девушке. В это время Натаниэль пытается забраться в память Симмонс, а Колсон обнаруживает у себя новые способности. После разговора с сестрой Дейзи решает действовать в одиночку, но как на это отреагирует команда?

Оказавшись на корабле хроникомов, Дэйзи отправляется на поиски Симмонс и Дика, пока Мак и Суза пытаются найти способ вернуться на землю. Смогут ли герои противостоять могущественной инопланетной расе, которая ничего не боится? В это время на Маяке появляется нарушитель, с которым придётся разбираться Колсону и Мэй.

Благодаря жертве Дика агенты возвращаются в привычную реальность, где им предстоит последняя битва с хроникомами. Для этого им снова придётся вернуться на космический корабль противника и создать неожиданный союз с бывшим врагом. Несмотря на угрозу уничтожения Земли, героям удаётся защитить самое ценное.