يحاول كولسون وعملاء فريق ش. ي. ل. د. وحلفاؤهم إعادة بناء المنظمة بعد انهيارها عند تسلسل هيدرا. بينما يضطرون للعمل بسرية كهاربين مطلوبين، فإنهم يتابعون ما تبقى من تهديدات من المنظمة الإرهابية.

Агенти от световна секретна правоохранителна агенция разследват странни събития и хора с извънземни сили, докато същевременно се борят срещу престъпна организация на име ХИДРА.

神盾局一沦陷，考森在尼克·弗瑞的允许下开始重建组织、收拾残局，而除了招募新人最重要的事情，就是必须创建起与政府机构的信任桥梁。同时，考森在领队在世界各地全力搜查“九头蛇”余党的踪迹，而昔日的伙伴如今沦为背叛者的沃德则是成为了他们唯一的线索。考森感觉自己当初复活期间所产生的“副作用”时不时会涌上心头，也发觉自己的自控能力越来越差，死命刻墙图、甚至为了查明真相而派队员去送死，屡次让神盾局陷入更大的危机。更吃惊的是，丝凯失散多年的父亲突然回归，并在身后也有一个从古到今毫无任何人见过的“异人”组成的联盟。丝凯因此再度为自己的身世产生疑问，也陷入了选择家人或者伙伴、左右为难的局面

In the second season, Coulson and his team look to restore trust from the government and public following S.H.I.E.L.D.'s collapse.

Ayant perdu une majeure partie des ses moyens logistiques et de ses agents suite à la révélation de son infiltration par le réseau terroriste Hydra, l'organisation mondiale du maintien de l'ordre, le SHIELD, a été dissoute et est considérée par l'opinion mondiale comme organisation terroriste. Pourtant l'agent Phil Coulson s'est vu confié la tâche par l'ex-directeur Fury de rebâtir le SHIELD. À partir d'une ancienne base secrète du SHIELD et avec l'aide des agents restés fidèles à l'organisation, il tente de reconstruire le SHIELD et de stopper Hydra, qui devient de plus en plus puissante, et ce, tout en opérant en totale clandestinité...

עונה שנייה לסדרת האקשן המדוברת. בהמשך לסיום העונה הקודמת, גרנט וורד נמצא במעצר לאחר שנחשף כי היה סוכן כפול של הידרה, מלינדה מיי ממשיכה לעקוב אחרי קולסון, ניק פיורי נעלם, ופיץ נמצא בקומה.

Questa seconda stagione vede il Direttore Phil Coulson (interpretato, ancora una volta, da Clark Gregg) doversi confrontare con numerose problematiche e nemici. Inizialmente, le sue incisioni in seguito al Progetto T.A.H.I.T.I. lo porteranno a scontrarsi con l'HYDRA, capeggiata dal Dr. Whitehall, e alla scoperta di una razza di persone con poteri denominata 'Inumani'. Di queste ne faranno parte Raina, che si tramuterà in un 'mostro' capace di vedere brandelli di futuro, e Skye alias Daisy Johnson, in grado di creare scosse di terremoto. Skye si ritroverà, suo malgrado, tra due fuochi incrociati: la divisione dello S.H.I.E.L.D. guidata da Gonzales, che vuole catturarla, e il gruppo degli Inumani, guidati dalla sua vera mamma. La guerra, ovviamente, è inevitabile e porta a numerosi cambiamenti all'interno del team di Coulson.

シールドの長官であったニック・フューリーに新長官として新生シールドの再建を託されたフィル・コールソン。アメリカ政府に追われる立場から選択肢は限られている中で、彼は残された信頼できるエージェント達、そして自ら選んだ新たなメンバーを招き入れ体制を整えていく。新たなチームで次々と襲いかかるあらゆる脅威から世界を守るべく挑んでいる最中、潜入作戦の実行メンバーが機密情報を第三者に奪われてしまう。

새로운 적, 새로운 쉴드. 히드라에 이어 인휴먼스까지, 쉴드를 어김없이 괴롭히는 적들. 여기에 쉴드 내부에서마저 이상기후가 감지되는데. 안팎의 위기 속에서 팀의 운명은?

Na segunda temporada, Coulson e sua equipe procuram restaurar a confiança do governo e do público após o colapso da S.H.I.E.L.D.

После того, как Колсон помешал планам Гидры был назначен директором Щ.И.Т.'а. Ему приходится несладко, ведь большинство агентов либо убиты, либо покинули организацию, либо работают на Гидру. Мелинда Мэй продолжает работать в команде и присматривать за Колсоном, в котором проснулась неведомая сила, заставляющая его рисовать на стенах странные знаки. Гранд Уорд, как выяснилось ранее, является предателем и агентом Гидры. Фитц чудом избегает смерти на дне океана, но его мозгу нанесены серьезные повреждения, что сказывается на его когнитивных функциях. Джемма Симмонс на время покидает команду, так как у нее другое задание. Скай пытается оправиться от предательства Уорда и узнать тайну своего происхождения, ведь теперь она знает, что является «0-8-4», объектом неизвестного происхождения.

Agents of S.H.I.E.L.D. regresa para una segunda temporada dinámica y llena de acción, con el recientemente nombrado Director Coulson (Clark Gregg), ahora guardián de los secretos, responsable de la reconstrucción y restauración de la confianza del gobierno y la opinión pública en S.H.I.E.L.D. tras los eventos de Capitán América: El Soldado de Invierno, donde se reveló que los malvados agentes de Hydra se han infiltrado en la organización. Desde que la existencia de superhéroes y alienígenas se convirtió en algo de dominio público después de la batalla de Nueva York, el mundo ha estado intentando entender la nueva realidad. El Agente Phil Coulson, que había muerto a manos de Loki durante la batalla, fue resucitado y regresó a la acción, reuniendo un grupo pequeño pero muy selecto de Agentes de la organización mundial para el cumplimiento de la ley conocida como S.H.I.E.L.D. (Strategic Homeland Intervention Enforcement and Logistics Division). La misión de S.H.I.E.L.D.: proteger a aquellos que no se pueden proteger a sí mismos de las amenazas que no pueden concebir.

Coulson y su equipo siguen trabajando en la clandestinidad después de la caída de S.H.I.E.L.D. frente a HYDRA. Esta temporada está ligada a los eventos de Capitán América: El soldado de invierno. Coulson comienza a reconstruir la organización de agentes secretos, lo que es tarea difícil cuando no puede confiar en nadie. El enfrentamiento con Ward ha dejado graves consecuencias en la vida de Fitz. Skye es oficialmente una agente de S.H.I.E.L.D. y ha descubierto parte de su origen como 0-8-4 (objeto peligroso de origen desconocido).

ikinci sezonunda, Coulson ve ekibi hükümetin güveni yeniden kazanmaya ve çökmüş S.H.I.E.L.D. imajını tazelemeye çalışacaklar.