机器的下落不明，而且完全处于「自我管理」状态，但仍然给Finch提供看似「毫不相关」的号码，帮助他确定那些身处险境之人的身份。机器提供的新号码指向一名海军官员，他和许多水手都已经来到纽约过「舰队周」（每年一度的水手集会，每年的5月海军军舰和空中救援队突然出现在城中，士兵们穿着正式的白色水兵服，场面很特别）。放眼望去，纽约的大街小巷上到处是穿白色水手服的士兵和军官，究竟谁才是Finch要找的人？他指派Reese和Shaw完成任务，这可给他们出了一道难题。与此同时，Carter遭腐败的警察犯罪组织HR陷害，被降职为街头巡警。但她并未放弃与HR组织的斗争，相反，她设下一个计策要将他们一网打尽。Root身处精神病院，她决定对自己的周遭环境进行一番试探。

The team suffers a devastating loss and confront staggering challenges. Adapting to the next evolution of The Machine, now completely self-governed and hidden from all, Finch and Reese team with rogue agent Sameen Shaw to save lives and seek justice, but their missions now threaten to tear them apart. Joss Carter and Lionel Fusco finally unravel the criminal police conspiracy "HR" - but at a tragic cost. And former cyber-enemy — and now highly tuned confederate of The Machine — Root becomes an unpredictable ally when the team learns a second surveillance apparatus to rival The Machine is on the verge of activation.

Après avoir fait face à des adversaires du passé d'espion de Reese et de celui, gouvernemental, de Finch, l'équipe de justiciers anonymes est continuellement menacée. Pendant ce temps, les détectives de la police de New York Carter (Taraji P. Henson) et Fusco (Kevin Chapman) doivent lutter contre les tentacules corrompues d'une conspiration policière, alias “HR”.

עונה שלישית לסדרת המתח, ובה הסוכנים פינץ וריס ממשיכים לפעול למעצרם של מבוקשים בסיוע המכונה המיוחדת. בפתח העונה, פרשה של מלח שמזכיר לריס את עצמו, לוחם מצוין שעושה הכל למען חבר. יש גם חברה חדשה בצוות: שו, שיורה בלי חשבון.

Il team subisce una perdita devastante e affronta sfide sorprendenti. Adattandosi alla successiva evoluzione de La Macchina, ora completamente autonoma e nascosta da tutti, Finch e Reese si uniscono all'agente ribelle Sameen Shaw per salvare vite e cercare giustizia, ma le loro missioni minacciano ora di dividerli. Joss Carter e Lionel Fusco finalmente smascherano la cospirazione criminale della polizia "HR" - ma a un costo tragico. E l'ex nemica informatica - e ora alleata altamente addestrata de La Macchina - Root diventa un alleato imprevedibile quando il team scopre che un secondo sistema di sorveglianza, in grado di sfidare La Macchina, è sull'orlo dell'attivazione.