Майкъл, Линкълн, Сукре и Белик прокопават тунела до щаба на Компанията. Гретчен се среща с Пад Мен. Полижията разпитва Т-Бег относно изчезването на Анди.

怀亚特尝到了自食其果的滋味，马宏找到了解决办法。当警察调查他失踪的同事，T-Bag慌乱起来。而格雷琴与一名公司员工相处融洽。迈克尔的病情持续恶化，一名队员在计划地下入侵“锡拉”时做出了最大的牺牲。

Michael a Lincoln se vydávají do podzemí budovy Gate, aby našli Scyllu. Neochotně musí spolupracovat s T-Bagem, Bellick platí vysokou daň.

Gruppen skal krydse et kæmpestort vandreservoir for at få fat i Scyllakortet. T-Bag afværger en efterforskning, og Mahone vil have hævn over Wyatt.

Wyatt krijgt een koekje van eigen deeg. T-Bag begeeft zich op glad ijs als de politie zijn vermiste collega blijft zoeken. Ondertussen blijft Michael's staat verslechteren. Één van de teamleden maakt het ultieme offer tijdens de planning van de ondergrondse inbraak in Scylla.

Wyatt gets a taste of his own medicine, and Mahone finds some resolution. T-Bag scrambles when the police investigate his missing co-worker while Gretchen gets cozy with a Company man. Meanwhile, Michael’s condition continues to worsen, and a team member makes the ultimate sacrifice while planning the underground break-in for Scylla.

L'équipe doit s'aventurer au péril de sa vie dans une canalisation d'eau pour accéder à Scylla. Pendant ce temps, T-Bag réchappe d'un interrogatoire.

Wyatt bekommt einen Vorgeschmack auf seine eigene Medizin, und Mahone findet eine Lösung. T-Bag krabbelt, als die Polizei seinen vermissten Kollegen untersucht, während Gretchen sich mit einem Firmenmann wohnt. In der Zwischenzeit verschlechtert sich Michaels Zustand weiter, und ein Teammitglied bringt das größte Opfer bei der Planung des Einbruchs in den Untergrund für Scylla.

Η ομάδα πρέπει να περάσει μέσα από έναν αγωγό 30.000 γαλονιών για να φτάσει στη Σκύλλα. Ο Τι-Μπαγκ αποφεύγει μια έρευνα.

החבורה מתחילה לחפור מתחת למשרדי "גייט" ונתקלת במכשול- צינור מים ענק. מעליהם, במשרדי החברה עובר טי-באג חקירה לגביי היעלמותו של בלאונר. הגנרל מחליט להעביר את "סילה" לבונקר מחוץ לעיר.

Wyatt saját módszereiből kap ízelítőt Mahone által. Zsebest a rendőrség az eltűnt munkatársa nyomán kikérdezi, Gretchen pedig komolyabb kapcsolatba kerül a Tábornokkal. Michael állapota súlyosabbra fordul, a csapat pedig újabb embert veszít, miközben a földalatti bejutást tervezik a Scyllához.

Lincoln cerca, infruttuosamente, di ottenere informazioni da Wyatt, picchiandolo. Dopo che il Generale Krantz decide di spostare Scylla e il suo contenuto, Gretchen decide di recarsi da lui ad armi spianate per vendicarsi del torto subito in precedenza. Il Generale però non sa che lei ora sta lavorando con Michael e Don Self e così cerca di rientrare nelle sue grazie seducendola. La donna pare infatuata dell'uomo e pretende di essere la sua sola compagna, litigando con Lisa. T-Bag fa entrare Michael, Lincoln, Sucre e Bellick alla Gate, dove seguono il percorso sotterraneo che dovrebbe portarli al quartier generale della Compagnia dove dovranno decodificare Scylla. Sorge, però, un grosso problema, un impianto idrico passa proprio attraverso quei condotti, cosicché Scofield decide che l'unico modo per continuare è passarci attraverso utilizzando un grosso tubo di ferro. Lincoln e Bellick riescono a distruggere la centralina che controlla lo scorrimento dell'acqua, in modo che gli altri possano cominciare a lavorare per far passare il grosso tubo. Durante questi lavori, però, Michael si sente male e sviene. T-Bag deve affrontare un investigatore della polizia che sta cercando notizie sulla morte di Andrew Blauner, ucciso da Gretchen. Sara fa parlare Wyatt, fingendo di essere solidale con lui, ma in realtà la donna sta registrando tutto e quindi Don Self, dopo aver manomesso la registrazione, chiama il Generale e gli fa credere che i componenti della squadra a cui dava la caccia sono morti. Il Generale, che nel frattempo si era attivato per rimettere in circolo la voce degli "Otto di Fox River", decide di abbandonare il piano, convinto di non avere più nulla da temere. L'uomo, dopo aver comunicato la morte di Michael ai 6 Custodi ed a Gretchen, ordina comunque a Lisa di procedere con il trasferimento lampo di Scylla. Wyatt viene così lasciato da solo con Mahone, che ha finalmenete il via libera per vendicarsi del killer. Dopo una lunga tortura ai limiti del dolore fisico e mentale, Alex mette in contatto Wyatt con la ex moglie Pam a cui fa chiedere scusa per l'uccisione del figlio. Alex, dopo aver legato le mani di Wyatt ad una prisma di cemento, lo getta nell'oceano, placando la sua vendetta. T-Bag, sfruttando le minacce ricevute da Blauner riguardo a certi pagamenti errati, le fa sue e le utilizza come prova della colpevolezza dell'uomo, datosi, secondo la versione ufficiosa, alla fuga. Lincoln e Bellick tornano nei sottorranei ad aiutare Michael e Sucre con il tubo, ma quando questo sembra aver raggiunto l'altra sponda, l'asse che lo sosteneva cede proprio mentre la pompa dell'acqua ritorna in funzione. Sembra tutto perduto quando Bellick decide di sacrificarsi per il gruppo e sollevarlo con le proprie forze dall'interno della conduttura idrca, rimanendo però travolto dall'enorme massa d'acqua rientrata in circolo. Michael comunica ai due compagni che per lui ormai non c'è più nulla da fare.

グレッチェンと組んでいるティーバッグは、コールという偽の身分証でゲート社のセールスマンに成りすましていた。「鳥の本」によると、スキュラを手に入れるためにはこのゲート社のコールの部屋から地下へ下り、トンネルを通っていくと組織の司令部へと通じているらしい。しかし、目指す地点の手前を巨大な水道管が横切っていた。

링컨은 와이어트를 협박해 장군에게 자신들이 죽었다고 보고하라고 한다. 하지만 와이어트는 호락호락하게 넘어가지 않고 계속 버틴다. 그런 와이어트를 보면서 죽은 아들이 떠올라 상당히 괴로워하는 머혼. 마이클과 수크레, 벨릭, 링컨은 지하 통로를 통해 크렌츠 장군이 있는 곳으로 가려 한다.

Wyatt jest przetrzymywany i torturowany przez drużynę. Nie chcą także dopuścić, aby wpadł w ręce Mahone'a żądnego zemsty za zabójstwo syna. Pad Man wraz z Lisą omawiają plan przeniesienia Scylli. Tymczasem generał dowiaduje się, że Wyatt nie daje żadnych oznak życia. Drużyna kontynuuje omawianie planu zdobycia Scylli.

A equipa tem de atravessar um depósito de água para chegar até Scylla. Entretanto, T-Bag tenta defender-se de uma investigação.

Lincoln, Michael, Sucre e Bellick chegam aos domínio da Companhia. Gretchen encontra-se com Pad Man. A condição de Michael continua a piorar. A polícia interroga T-Bag sobre o desaparecimento de Andy. Wyatt faz uma proposta indecente para Sara.

Grupul trebuie să treacă printr-o conductă principală de apă de mare capacitate pentru a ajunge la Scylla. Între timp, T-Bag este interogat.

Линк пытается заставить киллера позвонить генералу и сообщить о смерти братьев. Путем обмана они записывают нужные слова и звонят генералу. Махоуни удовлетворяет свою жажду мести и убивает киллера. С помощью карты из книги Уистлера Майкл понимает, что люк в подсобке кабинета Тедди ведет в тоннель, который в конечном счете приведет их в здание Компании к «Сцилле». В офисе «Гейт» появляются служители закона, расследующие исчезновение одного из сотрудников, который копал под Тедди и погиб от рук Гретхен. Тэдди приходиться крутиться между следователем, владельцем компании, шумом из люка и толпой народа, выходящей из его подсобки. Тедди убеждает мистера Уайта избавиться от полиции, так как если выяснится, что в отчётах по продажам ошибки, то у них будут неприятности с налоговой службой. Состояние Майкла резко ухудшается. Бред Беллик погибает в потоке воды, успев помочь ребятам протолкнуть трубу.

El equipo debe abrirse paso a través de una tubería de cien mil litros de agua para llegar a "Scylla". Mientras, T-Bag elude una investigación.

Gruppen måste ta sig igenom en huvudvattenledning. T-bag kommer undan en utredning och Mahone väntar på att få hämnas på den tillfångatagna Wyatt.

Nhóm cần tìm đường xuyên qua một ống nước 113.000 lít để đến Scylla. Trong khi đó, T-Bag đang phải đối phó với một cuộc điều tra.