La batalla para encontrar al supremo Sekirei continúa. Todavía algunos de los luchadores y sus amos se niegan a participar en la batalla, ya que perderla significa perder a los Sekirei para siempre, y muchos de ellos realmente se preocupan por sus socios, mientras que otros simplemente los usan como herramientas. Se avecina una tormenta en el horizonte, una amenaza mayor se acerca a la ciudad y está a punto de traer dolor y sufrimiento a quienes aman y cuidan a sus Sekireis.

被称为“鹡鸰”的108名可爱战士，为了寻找各自的主・苇牙，被放飞到人类世界——睹上自己的信念，为了成为最后一只“鹡鸰”。 “对不起，今年也失败了……” 虽然来到了憧憬已久的东京，但是考大学失败，成为复读生的佐桥皆人。 整天无所事事，也没什么亲密朋友，当然也不可能会有女朋友，是个所谓的心力交瘁者。 而且在那一天，决定要第二次复读。 在残酷的现实世界，情绪低落的皆人走在回家的路上。 在他的面前，突然，一个美少女从天而降。 她的名字是“结”。自称名叫“鹡鸰”的少女，选择皆人作为命运的对象“苇牙”。

Étudiant de 20 ans, Minato Sahashi a un très gros manque de confiance en lui et échoue très souvent à l'examen d'entré à l'université ! Mais sa vie banale et ennuyante va vite se terminer quand une Sekirei nommée Musubi tombe du ciel... Elle lui informe qu'il est maintenant son Ashikabi, une personne associé à une Sekirei. Minato devra alors s'associer avec Musubi pour reprendre une vie normale.

Segue a historia da 1 temporada, Minato Sahashi é um jovem de 19 anos e pouca sorte, se é que podemos concluir isso. Falhou pela segunda vez consecutiva à admissão para a universidade, pois é uma das mais concorridas, não é popular entre as mulheres, não tem amigos e está desempregado. No entanto, a sua vida muda quando encontra-se com Musubi, uma bela mulher que reconhece-o como seu Ashikabi e lhe envolve em uma batalha entre 108 misteriosos e poderosos seres chamados Sekirei.