Philip rivela a Martha di aver ucciso Gene per proteggerla; la donna è sconvolta. Paige parla dei suoi genitori con il pastore Tim. Gabriel assegna una nuova missione a Philip ed Elizabeth: incontrare William, uno scienziato americano che ha accesso a mortali sostanze chimiche e microorganismi. Durante un incontro dell'ETS, Philip ricorda un episodio della sua infanzia, quando aveva picchiato brutalmente e ucciso un bullo, nonostante nel suo racconto non riveli quest'ultimo particolare.

Le tensioni familiari aumentano quando Paige condivide nuove informazioni. Nel frattempo Philip prova a liberarsi di un pacco molto pericoloso.

Philip estrae Martha dal campo e, insieme a Gabriel, i due si rifugiano in una casa sicura; il KGB organizza nel frattempo i preparativi per la sua esfiltrazione in Russia. Tuttavia, Martha diventa diffidente e lascia la casa, contro il volere di Gabriel. Nel frattempo, Stan e Aderholt scoprono la verità su Martha e Clark e rivelano la scoperta a Gaad.

Philip ed Elizabeth iniziano un nuovo incarico con Tuan per indagare su un esperto di agricoltura sovietico che ha disertato di nome Morozov, sua moglie Evgheniya e il figlio Pasha. La coppia continua a disapprovare la crescente relazione di Paige con Matthew. Elizabeth insegna a Paige una lezione di autodifesa, dopo che la figlia ha confessato le sue paure.

Philip ed Elizabeth ricevono notizie sorprendenti su Henry e notizie rovinose su un'operazione passata. Stan potrebbe essersi innamorato, ma Philip si chiede se stia succedendo qualcosa di più oscuro.

L'approfondirsi del coinvolgimento di Paige nel mondo dei suoi genitori sta per crearle grandi problemi, e tensioni con Matthew Beeman.

Philip ed Elizabeth sono colti di sorpresa quando le cose con Tuan prendono una piega inaspettata. Nel frattempo, Henry fa una proposta sorprendente sul suo futuro scolastico e Stan ha un incontro inquietante con la vedova di Frank Gaad.

La curiosità di Paige costringe Philip ed Elizabeth a prendere una decisione che può spostare per sempre gli equilibri della loro vita. Sofia inizia a dare informazioni importanti a Stan e Dennis che coinvolgono un'ex stella di hockey sovietica.

Un incarico a sorpresa da parte del Centro porta una grande tensione tra Philip ed Elizabeth. Stan porta Henry a fare un giro per l’FBI. Oleg e il suo partner indagano su Lydia.

Mentre Philip ed Elizabeth si trovano ad affrontare una decisione importante, Tuan decide di prendere in mano la situazione. Nel frattempo a Mosca, l'inchiesta di Oleg si scontra con le realtà del sistema sovietico.