Druhá série, stejně jako první, sleduje dvě různé časové linie. Primární časová linie sleduje Patty, Ellen a Toma, kteří jdou proti energetické společnosti, jež se dopustila neetických praktik. Bývalý Pattyin milenec Daniel Purcell ji na věc upozorní, ale pak nevysvětlitelně vycouvá, takže Patty stojí proti generálnímu řediteli UNR Walteru Kendrickovi a jeho zuřivé právničce Claire Maddoxové. Ellen mezitím spolupracuje s FBI, aby Patty dostala, a zároveň se snaží pomstít Arthuru Frobisherovi za jeho domnělou roli ve smrti jejího snoubence. Ellen netuší, že ji Patty podezřívá a že Frobisherovy kriminální vazby zřejmě sahají i k jejímu novému příteli Wesovi.

The second season of the FX legal drama series Damages premiered on January 7, 2009 and concluded on April 1, 2009. It consisted of thirteen episodes, bringing the series total to 26. Damages was created by brothers Todd and Glenn Kessler along with Daniel Zelman, each of whom served as executive producers and contributed seven scripts for the season, including the premiere and the finale.

The second season, like the first, follows two different timelines. The primary timeline follows Patty, Ellen, and Tom as the firm goes up against an energy company who have engaged in unethical practices. A former lover of Patty's, Daniel Purcell, brings the matter to her attention, but then inexplicably backs out, leaving Patty up against UNR CEO Walter Kendrick and his fierce lawyer Claire Maddox. Meanwhile, Ellen works with the FBI to bring down Patty, while also seeking revenge on Arthur Frobisher for his presumed role in her fiance's death. Ellen is unaware that Patty is suspicious of her, and that Frobisher's criminal connections appear to extend to her new friend Wes.

A second timeline takes place six months later, when Ellen meets with an unknown person in a hotel room, and subsequently appears to shoot them.

In der zweiten Staffel von Damages wird das Vertrauen von Ellen zu ihrer Chefin erschüttert, da sie Patty des Mordes an ihrem Verlobten verdächtigt. Von Rachegedanken getrieben, versucht sie Patty zu stellen.

Nach dem Mord an ihrem Verlobten David weiß Ellen, dass Patty etwas damit zu tun hat, kehrt jedoch trotzdem in die Kanzlei zurück. Als Rache versucht sie, Patty mit einem konstruierten Fall abzulenken und soll derweil mit Hilfe vom FBI Patty als Mörderin zu stellen. Doch Patty arbeitet an einem Fall von Wasservergiftungen der Energiefirma UNR, auf den sie ihr alter Bekannter Daniel Purcell aufmerksam gemacht hat. Als Purcell verdächtigt wird, seine Frau ermordet zu haben, vertritt Patty ihn. Nach einiger Zeit deckt Ellen prekäre Details aus der Vergangenheit von Daniel und Patty auf. Zugleich versuchen sie und Tom mehr Beweise zum Umweltskandal der UNR zu beschaffen. Als Patty mit dem Fall an die Öffentlichkeit geht, ist sie schockiert, als sie entdeckt, dass Daniel sich vor Gericht gegen sie wendet. Er hat schon die ganze Zeit mit der UNR zusammengearbeitet und seine Frau selbst aus dem Weg geschafft. Daraufhin wird Ellen von Frobisher in dem Fall unterstützt, der damit sein Image aufbessern will.

In Wahrheit hat aber nicht Purcell seine Frau ermordet, sondern Deacon. Denn Daniels Frau war immer noch am Leben bis Deacon sich auf Befehl von Kendrick, dem CEO von UNR, sich darum gekümmert hat. Da Purcell immer noch denkt, er hätte sie getötet und von Schuldgefühlen geplagt wird, stellt er sich der Polizei. Ellen geht derweil zur Trauerberatung und trifft dort auf Wes und beginnt sich mit ihm anzufreunden. Doch Wes arbeitet eigentlich für Rick Messer, der für den Tod an David Connor verantwortlich ist. Am Ende der zweiten Staffel will Messer Ellen töten und wird von Wes aufgehalten.

Im Staffelfinale konfrontiert Ellen Patty mit den Anschuldigungen, dass sie für ihren Tod sorgen wollte. Sie zückt eine Waffe, aber statt auf Patty zu schießen, schießt sie auf die Kamera, von der aus das FBI zuschaut. Daraufhin bekommt sie ein Geständnis von Patty, dass die Anschuldigungen wahr sind. Ellen verlässt Pattys Büro. Patty geht zum Fahrstuhl und blutet, da sie vor ihrer Konfrontation mit Ellen von Fin Garrity niedergestochen wurde. Agent Werner findet sie im Fahrstuhl und nimmt an, Ellen hätte auf sie geschossen. Als Ellen den Richter bestechen will, lässt Werner sie verhaften. Doch Werner wird daraufhin selbst verhaftet, da er sich als korrupt entpuppt. Am Ende erholt sich Patty zu Hause, außerdem wird klar, dass sie die ganze Zeit von der Beschattung des FBI wusste. Ellen erhält ein neues Jobangebot und hält sich erstmal von Patty und der Kanzlei fern.

En esta temporada Patty debe enfrentarse a un nuevo caso en el que está involucrado Daniel Purcell, un hombre que tuvo mucho que ver en el misterioso pasado de la abogada. Pero lo que en un principio parece la investigación de un crimen doméstico alcanza una dimensión de conspiración política a nivel gubernamental. Además, el enfrentamiento entre Patty y Ellen Parsons comienza a hacerse más evidente cuando ésta última es contratada por el FBI para investigar a Patty mientras sigue trabajando para ella.