在城南体育俱乐部里，一个叫做凤源（=真夏龙）的青年正在训练。与此同时，奥特赛文在黑潮岛上和马格马星人、孪生怪兽战斗，却被孪生怪兽掰断了腿。危急时刻，雷欧奥特曼出现，并与奥特赛文一起击退了敌人。

奥特赛文变回了人间体：MAC队长诸星团（=森次晃嗣），雷欧也变成了凤源。源告诉团，自己的故乡L77星云被马格马星人毁灭了，现在的地球是他的第二故乡。团便告诉他自己已经不能变身了，希望源能加入MAC代替他进行战斗。

城南体育俱乐部的大家都为源感到高兴，源也非常享受在地球上的生活。

谁知此时，孪生怪兽再次出现了。它们用巨大的海啸淹没了黑潮岛，源认定是马格马星人干的，但其他队员都不相信。

源与队员们驾驶麦基一号前去调查，源用超能力感应到了怪兽的踪迹，但其他队员都没有发现。源很不满，团开导他要用人类的眼光看待事物，源却一意孤行。这时，怪兽开始袭击东京湾。

源赶赴现场时大家纷纷逃离避难，源也变成了雷欧，然而，雷欧却在两大怪兽的攻击中败下阵来…

晚上，在城南体育俱乐部中完成了训练任务的小通（=新井庸弘）和爸爸（=二见忠男）、小香一起回家的时候，爸爸被突然出现的宇宙人切成了两半，随后，宇宙人留下一个雷欧头像的徽章就离开了。

MAC的铃木队员（=鹿岛信哉）建议小通和小香区自己家里住，在回家路上他也被宇宙人杀死了。前去调查的源想追击宇宙人，却被团阻止，并叫回了基地。

每晚，团都会去街上等待宇宙人再次出现，这一天他终于与宇宙人见面了，并展开了战斗。而源也赶了过来，却被团击昏。

醒来后的源质问团，团告诉他敌人是祖鲁克星人，并让源为了小通谨慎战斗。这时，祖鲁克星人巨大化出现，MAC伤亡惨重，团命令全队撤退。归队后，源对团的决定很不满，团告诉他自己是为了队员们的生命，并指导源练习三段攻击破祖鲁克星人的二段攻击。

团命令队员们更换战机的引擎，再度出击与祖鲁克星人战斗。一架战机坠落在了练习中的源面前，愤怒的源变身成为了雷欧，却在战斗中败下阵来……

雷欧失败后，团驾机引诱祖鲁克星人攻击电线，暂时击退了敌人。战斗结束后，百子、小通、小香、猛（=伊藤幸雄）一直在海边寻找着源，但是直到深夜也没有结果，团也对自己不能变身而深感自责，终于，他接到了来自体育俱乐部的消息：源还活着。

团赶到体育馆后要把源带走，其他的人都不同意，但源还是决定跟团走。团又把他带到了山沟里，指责他不应该私自变身，并叫他练习劈开瀑布的水。而当他练习之时，祖鲁克星人再度出现了。

看到祖鲁克星人的肆虐，愤怒的小通想要与它决一死战。见到了两人陷入困境的团，再次使用奥特念力赶走了祖鲁克星人。战斗结束后，意识模糊的团来到了源训练的地方，见到没能训练成功的源哭丧着脸，就又骂了他一顿，这时候祖鲁克星人又出现了，团告诉源去找流动的目标后便又去战斗了。

团在地面与祖鲁克星人周旋，而源终于做到了劈开瀑布的水，便变身成为雷欧，终于击倒了祖鲁克星人。

小通和小香也在百子的家里住下来了。

这一天，体育俱乐部的全员去相模原郊游，看着其他孩子一家团聚的样子，小通非常的失落。为了安抚他，源让小通把自己当成爸爸，然而这时怪兽卡内德拉斯出现了，源只得归队战斗，小通也因此讨厌起了源。

在源赶到前，卡内德拉斯就被击退了，因此源没能看到怪兽的攻击方式。于是团设计了一个机器让源进行特训。训练的时候，小通等人也在一旁练习跳马，小通因为这件事情变得非常没有干劲，源也因此陷入了迷惘。此时，团出现了，告诉他要专心练习如何破解怪兽的攻击。突然，团接到消息，怪兽再次出现，他命令源留在这里练习，其他人去避难。小通却又一遍遍地练习不肯离开。

大村（=藤木悠）叫源和小通赶快走，但是没人听他。正当他准备离开的时候，源踢断了装备的一角，大村用空手入白刃接住了它。小通依然不走，源一怒之下扇了他一耳光。大村告诉小通，小香因为担心他跑了回来，小通这才离开了体育馆。

小香和小通躲在了一辆车里，为了保护二人，源变成雷欧用身体挡住了卡内德拉斯的攻击。看到保护自己的雷欧的样子，小通终于想通了，而雷欧也展开了反击，用空手入白刃击败了卡内德拉斯。

小通明白了坚持到底就一定能成功的道理，终于成功地完成了跳马

白土纯队员（=松坂雅治）为了参与会议从宇宙回来，让源把自己的女朋友洋子（=菅泽惠美子）送回家。在路上他们被卡利星人袭击，洋子被卡利星人杀死了，源变身成雷欧，依旧败下阵来。

白土队员非常愤怒，并告诉源自己见到雷欧就要干掉他。面对悲伤的源，团让他去看看白土正在做什么。当源看到白土为了打倒卡利星人加入MAC并练习枪技时，自己也决定展开特训。

某天巡逻时白土遇上了卡利星人，并发现它的弱点在双眼之间，于是提出了让每个队员负责一个区域的提案。源希望团不要执行这个计划，团则质问他到目前为止都做了什么。

大村等人看到了源特训时的样子，非常害怕想要阻止他，但源告诉他们这就是MAC队员的责任。

黑田队员（=黑田宗）在巡逻时发现了卡利星人，但是被击倒了，随即赶过去的青岛队员（=柳泽优一）也被打败了。

源和白土都在努力地练习，但团告诉源，他的训练没有意义，于是团开车撞源来训练，源终于练就了飞车躲避的方法。

卡利星人再度出现，白土在地面展开进攻，但是陷入了困境。这时源赶到，变成了雷欧，并击倒了卡利星人。

战斗结束后，白土回到了空间站，临走前要源继续努力，团则表扬了源的表现。

俱乐部的大家训练时，大村让小香来单挑自己，结果被小香打翻了。

肯多罗斯向地球释放了一枚剑轮草，被小香捡到了，她想把花插到父亲的坟前，但源看出来那是来自宇宙的植物，团便要求源尽快处理掉那朵花。

剑轮草变大飞走了，源变身成雷欧想截住那朵花，谁知被肯多罗斯抢先了一步，将剑轮草变成了自己的武器，团前去支援，雷欧依然败下阵来。

百子把受了重伤的源带回去治疗，醒来后的源坚持前去战斗。在路上，团截住了源，教他飞镖特训。

源终于训练成功，这时肯多罗斯再次出现了，MAC队遭遇重创。源变身成了雷欧，最终击倒了肯多罗斯。

源、百子、小香三个人去植物园玩，源却输给了蜜蜂们……

怪兽贝基拉突破了MAC的防御网，青岛队员命令源用镭射光线攻击怪兽的眼睛，源却发现大村在地面上后自作主张下去救人。在这过程中，他发现了怪兽的弱点在它的背上。

归队后，团要求源一周禁止出战，并用实际行动教训了自认为只有自己打得赢怪兽的源。最后，团命令源去我心山白云庵找一个叫十贯的僧人。

源找到了十贯（=明石潮），但是他不承认自己是十贯，源想打十贯的后背来试探他，他依然没有暴露。于是源开始尾行十贯，终于发现了退敌的关键：空翻。十贯也认可了源。

经过彻夜的练习，源终于成功了。这时十贯告诉他怪兽再次在东京出现，源便紧急赶赴东京。

MAC正面攻击怪兽失利，青岛不顾团的命令决定绕到贝基拉背后攻击，却在半路上被贝基拉打伤了。源赶到现场，救下了青岛，自己绕到怪兽背后攻击。危急时刻，源变身成雷欧，击倒了贝基拉。

因为青岛和源都违反了命令，于是两个人都被关了一周的紧闭。

在游乐园的怪兽秀里，混进了一头真正的怪兽基罗。源等人要小通离开它，但小通带着它一起跑了。源开车去追他们，基罗进行了反击并巨大化，挟持了小通，源变身成雷欧战斗，打着打着基罗消失了。

归队后，团再一次指责了源随意变身的行为。

晚上，基罗再次出现在游乐园里，MAC的众人赶到后发现小通被基罗的催眠术操控着。MAC用计救下了小通，但是他依然沉浸在基罗创造的世界里。

团告诉源，基罗的攻击方式是从触角里发射强蚀性溶液，并要源尽快进行特训。源依然十分迷惘要不要击败没有办坏事的基罗，但团要求源一心想着特训就行了。这时，小通从医院里消失了。

基罗再次出现，因为手里拿着小通做人质，MAC无法攻击。源特训成功，变成了雷欧，救下了小通，并杀死了基罗。

因为基罗的死，小通指责MAC。于是团让源变成雷欧，复活了基罗，并让基罗回到了宇宙。

一个带有生命反应的流星降临到了地球，MAC紧急出击。当怪兽的正面对准源的时候，源却没有攻击，因此使MAC战败了。

因为源看出那个怪兽是L77星的罗恩，团指责源没有进攻，源表示自己理解罗恩的感受。被团斥责没有做MAC队员的资格后，源离开了MAC。

源一个人在公园里弹吉他，一旁女生们在玩跳绳。这时，跳绳女孩的妈妈过来给她送棒棒糖，她要把棒棒糖给小香，却被小香把棒棒糖都扔掉了。源问她为什么这么做，她告诉源自己讨厌撒娇的人。这时，百子过来教育了小香，并让她跟跳绳女孩道了歉。之后，百子又教育了一通源。

源在思考百子刚刚对自己说的话时，罗恩又出现了。为了恢复队员们对自己的信任，源再一次来到了现场参加战斗。MAC在怪兽面前毫无还手之力，于是源驾驶战车展开了攻击，并在危急时刻变成了雷欧。

经过一番思想斗争后，雷欧与罗恩开始了战斗。最终雷欧将罗恩缩小，送到了宇宙中去。

源给小香买了一条狗，取名叫做罗恩。

在体育俱乐部，一个叫松本一郎（=大山正明）的孩子正努力练习着引体向上。

街上，源在追击凯特尔星人，途中遇到了一郎的叔叔（=西山健二）。叔叔作死和凯特尔星人战斗，结果被杀死了。面对着悲伤的一郎，源告诉他自己会为他叔叔报仇的。

面对伤感的源，团再一次告诉了他他的职责所在。

目睹了悲伤却奋进的一郎后，源决定努力练习，打倒凯特尔星人。终于，在一郎和他婶婶（=高岛雅罗）扫墓的时候，凯特尔星人再次出现了。然而，凯特尔星人又杀死了一郎的婶婶，源也没能打败凯特尔星人。

一郎一个人练习着引体向上，并指责源他们没有努力。源告诉他他自己也有和一郎一样的痛苦，并在一郎的练习中理解了打倒宇宙人的方法，开始了特训。

源特训成功后，凯特尔星人再次出现。在等身体的肉搏后，凯特尔星人巨大化，源也变成了雷欧与其展开战斗，并最终击败了凯特尔星人。

而一郎，则去美国找他的父亲了。

这一天，体育俱乐部的大家在野外练习长跑，突然怪兽班吉出现了。一个穿着土著人衣服的人跳了一场奇怪的舞后冲了过去，赶跑了怪兽。然后他告诉源，自己是他的新搭档佐藤三郎（=东龙明）。

源和佐藤巡逻时吃午饭的时候，佐藤发现了地下的一个奇怪的洞，那竟然是怪兽的鼻孔。怪兽开始了破坏，源向MAC总部报告，却完全不是怪兽的对手。于是佐藤爬到了气球上面“吓唬”怪兽。

怪兽暂时被吓退后又出现了，并开始模仿刚刚佐藤吓唬自己的动作。于是源便让佐藤把制服充上气，让班吉模仿；佐藤在空中又故意抽烟给班吉看，调戏班吉。

突然，佐藤的绳子断了，源便变身为雷欧，救下了佐藤，并吹出特殊瓦斯把班吉送到了宇宙里。

佐藤离开了MAC，前往喜马拉雅山探险。

在街上，源和警方一起追击百贝星人。突然，百贝星人消失了，而源则莫名其妙“杀死”了一个警察。

在团的请求下，源被保释了。然而，团告诉他暂时不要管这件事情，停职一周。

闲下来的源依然在想着百贝星人的事，这时，百贝星人又出现了。源追击百贝星人，它又使出了那一招，被误解的源继续追击，在路上遇到了团，源向团辞去了MAC的职务。

为了证明源的清白，团决定自己击败百贝星人。而源也为了胜利拼命练习着。终于，通过尺子震动的启发，团发现了百贝星人隐身的原理。于是在下一次百贝星人出现的时候，团破解了百贝星人的阴谋。

在山中修炼的源也发现了百贝星人的秘密。这时，巨大化的百贝星人出现了，并在战斗中隐形大肆破坏。于是团亲自撞向百贝星人，并在危机时刻被雷欧救下了。

战斗结束后，源告诉团是松子让他知道团的战斗方法的。

雷欧和蝎子怪兽安塔雷斯战斗，后背被刺中，败下阵来。一个少年（=川代家继）来体育俱乐部踢馆子，把一群人都打倒了。团发现那个少年其实是怪兽。于是团把所有队员都叫到体育俱乐部，让他们练习空手道，并从俱乐部的人口中得知了少年的战斗方法。

这时，怪兽出现了。团命令青岛、赤石（=大岛健二）留下来和源一起继续练习。MAC和安塔雷斯的战斗中伤亡惨重，但是团依然命令他们继续练习，众人都对团和源十分不满。

于是源便和猛一起练习，并在练习中发现了取胜的关键。

安塔雷斯少年又来踢馆了，而且指名道姓要和源战斗。源在决斗中用刚刚学到的技巧击败了少年，少年巨大化成安塔雷斯，源也变成了雷欧，击倒了安塔雷斯。

这天晚上，福利普星人突然出现在东京，但MAC出击后不久就消失了。

源和小香、小通吃冰淇淋前，发现百子也在帮忙洗自己的衣服。而吃冰淇淋的时候一个男的（=潮哲也）一直在盯着自己看，这时百子突然跟着那个男的走了。

因为这件事忧郁的源得到宇宙人出现的消息，当他赶到时宇宙人正在攻击着百子和那个叫做津山的青年。源和宇宙人战斗，失败了；但津山击倒了宇宙人。团便让他去找津山学空手道。

源在找津山的路上发现百子也一脸愉悦地走过去，他很生气，就开始自己练习。这时得到消息，宇宙人再次出现。源没有按照团的要求向津山学习，导致战斗失败，在团的说教下，源终于肯去找津山学习空手道了，并从津山那里学会了使用敏锐的感官击败对手。

这时，福利普星人再次出现，源也变身成雷欧，在战斗中失利。为了让雷欧利用自己敏锐的感官，团驾机发射泡沫封住了雷欧的眼睛，雷欧终于战胜了敌人。

原来，津山是黑潮岛的唯一幸存者，他也因此而怨恨MAC，但因为这件事终于化解了自己心中的恨。团给在这次战斗中牺牲的队员献花，并告诉源战斗是伴随着牺牲的。

小通等人去鬼屋探险，并发现了幽灵，但是没有人相信他。邻居家的大哥哥也去了那里，竟发现一个白衣女人（=星野百合），然后被变成了蜡像。自此之后，东京经常出现这样的事件，团断定是阿托拉星人，并告诉源他目前还打不赢阿托拉星人。

深夜，阿托拉星人出现在了一栋公寓里，将除了百子外公寓内所有人都变成了蜡像。随后，阿托拉星人巨大化，MAC战斗失利，阿托拉星人则照射光线，将人们变成蜡像。忍受不住的源变身成了雷欧，团用奥特念力支援雷欧，但体力不支没有坚持下去，而雷欧也败下阵来。

源对自己没能击败敌人非常沮丧，团鼓励了他，两个人便一起出击，发现了阿托拉星人的弱点在于胸前的花，于是源驾机撞向阿托拉星人，危急时刻变身为雷欧一击秒杀了阿托拉星人。

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