בזמן שגו וקלואי הולכים אל בית הספר, קלואי חושפת שהיא לא החליטה אם היא תתפוס אי פעם פוקמון משל עצמה. בינתיים, יאמפר מושך את תשומת הלב של איבי שנמצאת במעבדת התפתחות איבי. איבי בורחת ומצטרפת ליאמפר, אך כמה חוקרים יוצאים למרדף אחריה.

אש, גו וקלואי עולים על מטוס אל גאלאר כדי לחפש מאובנים נדירים באזור הפרא. שם, הם פוגשים שני חוקרי מאובנים בשמות קרה ליס ובריי זן. אבל כשהחוקרים מנסים לשחזר שני פוקמונים מאובנים, הם מבלבלים בין החלקים ומסיימים עם שני פוקמונים מוזרים.

גו ממשיך להרחיב את משפחת הפוקמונים שלו כשהוא תופס ג'יאודוד, בזמן שאש רוצה לעזור לפארפץ' שלו להפוך למאסטר כרישה! אש גם רוצה לעלות בדירוג שלו בסדרת ההכתרה העולמית, כך שהוא נחוש להלחם כמה שאפשר.

לאקסטון, אחד מהתלמידים לשעבר של פרופסור צ'ריס, הוא עכשיו הבעלים של חווה משלו. אבל כשהוא מבקש עזרה בהתמודדות עם דיגלט ודאגטריו שהשתלטו על האדמה, גיבורינו מגיעים להצלה! לאחר קצת מחקר, הם מגלים שהפוקמונים חיו קודם על גבעה קרובה...

הפוקמון האגדי סוויקון אותר! אומרים שסוויקון מטהר מקורות מים מזוהמים ואז עוזב, אבל מסיבה כלשהי, הוא מתעכב ליד אגם מסוים. לכן, גיבורינו יוצאים לחקור. כשהם מגיעים, הם מגלים שציידי פוקמונים מזהמים את האגם כי הם רוצים לתפוס את סוויקון.

אש וגו גילו שסרט המשך לסרט פופולרי מצולם במקום קרוב, אז הם יוצאים לשם! בסרט מככבים ג'קלין והשותף שלה אינטליאון, שמעורר את הערצתו של סובל... כי אינטליאון הוא הצורה המפותחת הסופית של סובל!

לאחר שקלואי קוראת ספר על צורות גאלאר של פוניטה וראפידאש, פרופסור צ'ריס מציע שהיא, אש וגו יגיעו אל יער גלימווד ויראו אותם מקרוב. שם, קלואי מגלה שחיזיון שהיא ראתה בזמן שקראה את הספר היה אמיתי: ראפידאש נפצעה, ופוניטה מודאגת!

פארפץ' של אש עדיין נחוש להפוך למאסטר כרישה, ואש יעשה כל שביכולתו כדי לעזור! לאחר שהם מגלים על טירת האבירות, מתקן אימונים שמנוהל על ידי וויקסטרום מהרביעייה המובילה של קאלוס, גיבורינו יוצאים לדרך!

זה יום עמוס וקריר בעיר ורמיליון! פארקר לוקח את יאמפר למסיבת פיג'מות, גו רוצה לתפוס פוקמונים מסוג קרח, וקריסה וקלואי עורכות ערב בנות. אחרי שקלואי מבחינה באוסף מוצרי סאידאק של קריסה, קריסה נזכרת בפעם שהיא הרגישה כמו כשלון...

אש וגו סקרנים מטבעם, אז זו לא הפתעה כשאש מתגנב מאחורי גו בזמן ריצה. אבל כשהוא מפיל את גו לשיח, גאלפין פראית נצמדת לראש של גו! עוד גאלפין אחר נצמד לגב של אש, אז גיבורינו מחליטים שזה הזמן לקבל עזרה מפרופסור צ'ריס.

כשגו מתעורר מסיוט, הוא מוצא גרוקי שנצמד לזרוע שלו. הוא מנסה לתפוס אותו, אבל רוטום-פון שלו אומר שכבר יש לו מאמן! השאלה היא מי הוא, אז אש וגו יוצאים למצוא את ביתו האמיתי של גרוקי.

סדרת ההכתרה העולמית בשיאה, ואש התאמן קשה יותר מאי פעם! הוא וגו עורכים קרב תרגול, ואז יוצאים אל מרכז הפוקמונים. שם, הם נתקלים ברינטו, שהביס את אש בקרב קודם ומאז עלה לדירוג אדיר. אש מאתגר את רינטו לקרב רשמי: קרב חוזר בין פארפץ' וגאלייד!

ברזי מים מקולקלים במעבדת צ'ריס מובילים את פרופסור צ'ריס להזמין את "פלאסל ומאינאן שירות כולל" לעזרה. שני עובדים, דבי ומולטה, מגיעים. והם לא סתם שרברבים... הם מתקנים כל מיני דברים ואפילו מטפלים בפוקמונים!

גו מקבל הפתעה משמחת כשהוא מגלה שסובל התפתח לדריזאיל! אבל דריזאיל לא מרגיש ככה... הוא רצה להתפתח לאינטליאון במקום זה. כשהוא מוצא נחמה בתוך מערה, גו וסינדרייס מושכים אותו החוצה, מה שגורם לו לברוח.

זה הזמן למירוץ האתלטי הימי לפוקמונים! לאחר שהם מגיעים, גיבורינו נפגשים עם קאילי, חבר של קריסה, כדי שקלואי ואיבי יוכלו ללמוד עוד על השותף של קאילי, ופוריאון. קאילי מבטיח לקלואי שאפילו שאיבי לא מסוג מים, היא עדיין יכולה להשתתף במירוץ.

אש וגו חוזרים אל הואן כדי לעזור לחבר שלהם הודג', שמסביר שהמעיינות החמים של העיירה לאבארידג' התייבשו. הדוד של הודג' חושד שזה באשמתה של אבסול, אבל אש וגו יודעים שזו רק אמונה תפלה. כשהם מטפסים על הר צ'ימני כדי לחקור, הם מגלים שהסביבה הוקפאה!

אש שמע מאייריס שביונובה! עכשיו היא אלופת ליגת יונובה והיא רצתה להלחם באש כשהיא עושה את דרכה בסדרת ההכתרה העולמית.מנהיג המכון דריידן מסכים לתת להם להלחם במכון אופלוסיד... ובקרב נלחמים דראגונאיט נגד דראגונאיט!

אש וגו מסתובבים בפארק צ'ריס כשקבוצת הפלאבבה של גו מתחרות זו בזו ומתפתחות לפלואט... אבל פלאבבה פרח לבן חסרה! היא התקשתה לעוף כי הפרח שלה איבד עלה כותרת, אז אש וגו יוצאים אל קאלוס כדי למצוא תחליף.

ביקור של השוטרת ג'ני והמפקח דקר מוקדם בבוקר במעבדת צ'ריס חושף שמישהו גנב כמויות גדולות של חשמל מתושבי העיר ורמיליון. ואם המצב לא מסובך מספיק, פיקאצ'ו הוא החשוד העיקרי! אבל גניבה נוספת מתרחשת בזמן שפיקאצ'ו במעצר, מה שמוכיח את חפותו.

גיבורינו מבקרים את פרופסור אוק, שם גו מגלה על פרויקט מיו ומחליט שהוא לא מעוניין. פרופסור אוק שומר על רוב הפוקמונים של אש במעבדה שלו, אבל אינפרנייפ נעלם, וגיבורינו יוצאים לחפש אותו. בדרכם, הם נתקלים בחבר והיריב הותיק של אש, גרי, שקצת מקשה על גו.

בזמן שהם מבצעים שליחות בשביל פרופסור צ'ריס, גו וקלואי מביעים את הערצתם לגרוקי ואיבי, אבל הם מבינים ששני הפוקמונים מעולם לא ביצעו שליחות כלשהי בעצמם! כשגרוקי ואיבי יוצאים לבדם, אש מציע להשגיח עליהם... בחשאיות, כמובן.

לחברי צוות רוקט כבר נמאס שמורפקו תמיד אוכלת את כל האוכל שלהם, וכשהם כבר לא יכולים לעמוד ברעב, ג'יימס מסכים להוביל את מורפקו אל ההרים ולהשאיר אותה שם לבד. אבל, כרגיל, מורפקו לא תקבל את זה!

הבקשה של גו להתקבל לצוות המחקר של פרויקט מיו אושרה! הוא ואש נוסעים אל הר קורונט במחוז סינו, שם חברת פרויקט מיו, דאניקה, מסבירה מה המשימה הראשונה של גו... לתפוס אלולאן נאינטיילס שתקועה על ההר!

אש וגו נמצאים בעיר דריפטבייל, מאוכזבים ששמועה על פוקמון חדש הייתה שקר. יחד עם קלואי שהצטרפה אליהם, הם מתחילים לאכול עוגיות, אבל נאלצים לעצור כשגרוקי ואיבי קופצים לתוך בור ענקי! גיבורינו יוצאים בעקבותיהם, וגם חברי צוות רוקט עוקבים אחריהם.

כשפרופסור צ'ריס מזכיר פוקמון בשם פיילינקס, אש וגו מחליטים לצאת אל מחוז גאלאר למחקר! פיילינקס מורכב משישה אינדיבידואלים שזזים יחד בתור פוקמון אחד... המוביל נותן פקודות, וחמישה עוקבים מקשיבים לו. אבל גיבורינו פוגשים פיילינקס שמתקשה בתיאום.

כשעולים דיווחים על סיוטים של תושבי מחוז סינו, פרופסור צ'ריס חושד שאולי דארקראי מעורב בזה, אז אש וגו מתכוננים למחקר! בינתיים, קלואי יוצאת לחופשה משל עצמה לאחר שפרופסור צ'ריס מודיע שהמשפחה שלהם לא תצא לחופשה יחד.

אש וגו נמצאים בסינו, שם עיירות שלמות סובלות מסיוטים. גם קלואי ודון נמצאות שם... והם נתקלו בקרסליה פצועה. דון מטפלת בפציעות שלה, ואז מלמדת קצת את קלואי על תחרויות. בינתיים, אש וגו מאשרים שדארקראי גורם לסיוטים.

אש מוכן לקרב דירוג אולטרה הראשון שלו, והוא מתרגש במיוחד בגלל שהיריב שלו הוא אחד ממנהיגי המכון הכי חזקים בסינו, ולקנר!

מה שמתחיל בתור בוקר יפה במעבדת צ'ריס הופך לבוקר של בהלה כשקריסה ורן מגלים שכמות גדולה של נתוני מחקר נמחקה!

קלואי ואיבי רוצות ללמוד על אספיאון ואמבריאון, אז פרופסור צ'ריס מכוון את גיבורינו אל פסטיבל של ליקוי חמה בטירת אקליפס בג'וטו.

גו קיבל את משימת המבחן הראשונה שלו בפרויקט מיו! הוא צריך לאסוף את הקשקשים הזהובים של ולקארונה, אז לאחר תדריך מפרופסור צ'ריס, גיבורינו יוצאים לאתר הנופש המדברי ביונובה.

גו בדיוק תפס ולטורב זוהר כחול, מה שמעורר עניין רב מצדו של גורמאן, מעריץ פוקמונים כחולים! האיש הצעיר הזה מקאלוס מעוניין בכל מה שקשור לפוקמונים כחולים, והוא לא היחידי. יש לו יריב בשם בלוטו!

אש, גו וקלואי הוזמנו אל באלונלי שבגאלאר לאתגר מיוחד שנוצר על ידי אופאל, שמסתבר שהיא מנהיגת המכון של העיירה. היא תמיד חושבת על אתגרים יחודיים, ועכשיו היא ביקשה מגיבורינו להשתתף בתחרות קישוטי עוגות לצדם של ליאון וראיהאן משמונת המאסטרים!

כשאש וגו שומעים שעיירה קטנה בג'וטו נפלה לאפלה תמידית, הם יוצאים לחקור... וזה נכון! במשך שבוע בערך, היה שם לילה כל הזמן. אבל ילדה בשם טיארה מתארת פוקמון שהיא ראתה כשהכל התחיל: אנון.

לאחר שאש וגו צופים בקורינה ומגה לוקאריו שלה מנצחים בקרב במכון העיר שאלור, נושא השיחה הוא מגה התפתחות. קורינה נותנת לאש כפפת מגה עם אבן מפתח, אבל לוקאריו לא יכול לעבור מגה התפתחות אלא אם הוא יחזיק בלוקאריונאיט משלו, אז גיבורינו יוצאים אל האי מגה כדי למצוא אחת.

הקרב הבא של אש בסדרת ההכתרה העולמית הוא קרב חוזר נגד בי, מנהיגת מכון סטוו-און-סאיד! אבל קודם, קורינה מביאה קינוחים טעימים שכולם נהנים מהם. כשהקרב מתחיל, גראפלוקט של בי נותן לפיקאצ'ו אתגר, אז אש מוציא את לוקאריו במקומו.

כשהם ממשיכים בקרב דירוג אולטרה שלהם בסדרת ההכתרה העולמית, אש, בי והפוקמונים שלהם ממשיכים להביא התרגשות גדולה לאצטדיון! סגנון הלחימה של בי רציני כמו תמיד, והפוקמונים שלה מסוג לחימה משחררים מהלכים רציניים בזה אחר זה.

תלמידה חדשה מגיעה לבית הספר של קלואי וגו... קוראים לה רג'ינה, והשותף שלה הוא מירצ'ה, גלייסיאון. אבל נראה ששניהם מאופקים ומרוחקים, וכשהתלמידים מנסים להתחבר איתם, מירצ'ה מגיב במתקפת סופת שלג חזקה!

גו קיבל את משימת המבחן השניה שלו בפרויקט מיו: לתפוס קינגדרה פראי. בחיפוש אחר מערבולות שאולי נגרמות על ידי הפוקמון החמקמק, גיבורינו מגיעים אל המים שסביב העיר סלייטפורט בהואן, שם הם נתקלים בדרייק מהרביעייה המובילה של המחוז.

צוות רוקט מופיע בדיוק כשאש, גו וקלואי נוסעים למחוז סינו כדי לחקור מספר דיווחים על פוקמונים נעדרים – כולל הפיפלאפ של דון.

הזמן הולך ואוזל – וגם מתחיל לחזור לאחור: אש, גו וחבריהם נכנסים לעולם מוזר ונלחמים לצד גרסאות שונות של עצמם.