在第二季中，钱德勒和船员们积极发放解药，但当他们返回美国后，却遭到了其他想争夺权力的党派和天生对瘟疫免疫想要统治世界的幸存者们的反对。

昔日人马早已散去，钱德勒舰长另任新职，XO斯莱特林担任DDG151号上的新舰长，在钱德勒赴中国之后，斯莱特林遭到袭击被绑架，钱德勒受总统之令再度召集原班人马，前去营救。

Efter den episk spændende afslutning på anden sæson, skifter Nathan James’ besætning deres fokus til Asien. Præsident Michener har nemlig hørt rygter om at den kinesiske leder, præsident Peng, har hamstret store mængder af ‘Scott Kuren’, i stedet for at fordele den til folket i regionen.

Michener sender Chandler til et globalt topmøde, for at efterforske dette, samt for at undersøge rygterne om en mulig mutation af den originale virus, der har forårsaget et nyt udbrud i Japan. Hvis mutationen har fundet sted, og Asien ikke er blevet beskyttet, er konsekvenserne for verden dystre.

De bemanning van de Nathan James verschuift hun aandacht naar Azië nadat president Michener geruchten heeft gehoord dat de Chinese leider de "Scott-remedie" heeft opgepot in plaats van deze te verspreiden onder de mensen in de regio. Michener stuurt Chandler naar een wereldwijde top om deze beschuldiging te onderzoeken, evenals geruchten over een mogelijke mutatie van het oorspronkelijke virus dat een nieuwe uitbraak in Japan heeft veroorzaakt.

The crew of the Nathan James is shifting their attention to Asia after President Michener hears rumblings that the Chinese leader has been hoarding the "Scott cure" instead of distributing it to the people in the region. Michener sends Chandler to a global summit to investigate this allegation, as well as rumors of a possible mutation of the original virus that has caused a fresh outbreak in Japan.

Quando uma boa parte da população da Terra é dizimada, a tripulação de um navio precisa descobrir uma forma de sobreviver. A embarcação está sob o comando do Capitão Tom Chandler, um oficial de carreira, autoritário, decidido e líder nato, amado e respeitado por aqueles que trabalham com ele. Sua tripulação é formada pela Tenente Jackie Makena, responsável pelos mísseis; Chefe Hugh Jeter; Danny Green, líder da equipe de fuzileiros navais; Tenente Alisha Granderson; Quincy e Rachel Scott, especialistas em paleo microbiologia; e Mike Slattery, segundo em comando.

Después de haber encontrado un remedio contra el virus, batidas diversas milicias de mala fama y restaurado el gobierno americano, la tripulación empezará la tercera temporada con una nueva misión. Ya es hora de poner al imperio americano en la cumbre del sistema alimentario. El U.S.S. Nathan James se dirige a China para socorrer a un pueblo vejado por la dictadura local cuando algunos de los miembros de la tripulación son hechos prisioneros. Mientras que una posible mutación del virus aparece en Japón, el reloj corre en contra de los protagonistas si desean salvarlos a todos.