Peter Quill (alias Star-Lord), Rocket, Gamora, Groot et Drax le Destructeur forment les Gardiens de la Galaxie. Ils découvrent l'existence un puissant artefact, la graine cosmique, une arme redoutable qui peut créer un nouvel univers. Son immense pouvoir est convoité par de nombreuses personnes, dont le maléfique Thanos. La carte de la Graine Cosmique est cachée dans un objet nommé le CryptoCube de Spartax. Pour protéger la galaxie, Ils vont devoir trouver cet artefact tout en empêchant de nombreux ennemis tels que Thanos, Ronan l'Accusateur, Nébula, les Ravageurs de Yondu ou Korath le Poursuiveur de s'en emparer.