第一次宇宙大战后十年，是一个安定和平的年代，是地球重建的高潮阶段。一天，作战警报突然响起来了。在文化公园旁弃置多年的SDF－1突然开动起来，将一束粒子流射向天空。望着雨雾中的SDF－1，身为记者的神崎响露出了微笑。主炮自动开火这样的事在历史上只发生过一次，那是当年杰特拉蒂军初到太阳系的时候。

2090年代，在與傑特拉帝人（ゼントラーディ）的戰爭結束80年之後，地球即將遭到新的外星人馬爾杜克（マルドゥーク）（Marduk）侵襲；地球統合軍依照以往的成功模式，採用「明美攻擊」試圖擊退對方，卻驚訝的發現馬爾杜克軍也是利用歌聲驅使戰鬥部隊，且威力更勝過「明美攻擊」，地球遭遇到前所未有的危機。

電視記者神崎響在戰鬥中冒險深入戰線報導，親眼目睹地球統和軍節節敗退，因緣際會闖入了敵艦並解救了一位昏迷的女性伊絲蒂。

戰爭依舊持續著，而伊絲蒂在神崎響的帶領下，漸漸的瞭解了地球的文化，響也由她的口中得知SDF-1馬克羅斯（マクロス）其實原是亞爾斯（アルス）用來傳播愛的船。

神崎響被軍方以知情不報和擅用軍方線路為由監禁。而面對馬爾杜克軍即將發動的總攻擊，部分有遠見的高層私下釋放了他，並希望他與女飛官蘇菲能重新啟動馬克羅斯；終於馬克羅斯升空並發射了主砲，但是並沒有擊沉敵旗艦。正當絕望之時，伊絲蒂趕到並站在當年林明美所站的平台上演唱もういちど LOVE YOU 『再一次‧愛你』，藉由所有通信線路的傳播，終於感化了馬爾杜克軍。

3日後，馬爾杜克軍與地球簽訂了和平條約，新的領導帶領著重新拾獲文化的同胞們即將啟程前往未知的宇宙彼端，臨行前伊絲蒂向神崎響及蘇菲道別，而這段割捨不下的三角戀情也深植在她的心中永藏心底……。

2090年代，在與傑特拉帝人（ゼントラーディ）的戰爭結束80年之後，地球即將遭到新的外星人馬爾杜克（マルドゥーク）（Marduk）侵襲；地球統合軍依照以往的成功模式，採用「明美攻擊」試圖擊退對方，卻驚訝的發現馬爾杜克軍也是利用歌聲驅使戰鬥部隊，且威力更勝過「明美攻擊」，地球遭遇到前所未有的危機。

電視記者神崎響在戰鬥中冒險深入戰線報導，親眼目睹地球統和軍節節敗退，因緣際會闖入了敵艦並解救了一位昏迷的女性伊絲蒂。

戰爭依舊持續著，而伊絲蒂在神崎響的帶領下，漸漸的瞭解了地球的文化，響也由她的口中得知SDF-1馬克羅斯（マクロス）其實原是亞爾斯（アルス）用來傳播愛的船。

神崎響被軍方以知情不報和擅用軍方線路為由監禁。而面對馬爾杜克軍即將發動的總攻擊，部分有遠見的高層私下釋放了他，並希望他與女飛官蘇菲能重新啟動馬克羅斯；終於馬克羅斯升空並發射了主砲，但是並沒有擊沉敵旗艦。正當絕望之時，伊絲蒂趕到並站在當年林明美所站的平台上演唱もういちど LOVE YOU 『再一次‧愛你』，藉由所有通信線路的傳播，終於感化了馬爾杜克軍。

3日後，馬爾杜克軍與地球簽訂了和平條約，新的領導帶領著重新拾獲文化的同胞們即將啟程前往未知的宇宙彼端，臨行前伊絲蒂向神崎響及蘇菲道別，而這段割捨不下的三角戀情也深植在她的心中永藏心底……

A.D. 2089 - 80 years have passed since Space War I changed the lives of both human and Zentraedi races. Both races are at peace on Earth when a new alien race called the "Marduk" appear within the Solar System. While covering the first battle between the U.N. Spacy and the Marduk fleet, SNN rookie reporter Hibiki Kanzaki discovers Ishtar, an "Emulator" that enhances the Marduk's combat abilities through singing. Hibiki brings Ishtar to Earth to teach her the values of life and culture. Together with ace Valkyrie pilot Silvie Gena, Hibiki and Ishtar must find a way to save Earth from total destruction at the hands of the Marduk leader Ingues.

2089 après J.-C. - 80 ans se sont écoulés depuis que la première guerre spatiale a changé la vie des races humaine et zentraedi. Les deux races sont en paix sur Terre lorsqu'une nouvelle race extraterrestre appelée "Marduk" fait son apparition dans le système solaire. En couvrant la première bataille entre l'U.N. Spacy et la flotte Marduk, le reporter débutant de SNN Hibiki Kanzaki découvre Ishtar, un "Emulateur" qui améliore les capacités de combat des Marduk par le chant. Hibiki amène Ishtar sur Terre pour lui enseigner les valeurs de la vie et de la culture. Avec Silvie Gena, pilote de Valkyrie, Hibiki et Ishtar doivent trouver un moyen de sauver la Terre de la destruction totale aux mains du leader marduk Ingues.

A.D. 2089 80 Jahre sind seit dem Krieg mit den Zentraedi vergangen und es herrscht Frieden. Die SDF-1 Macross ist zu einem Raumschiff Museum geworden und die Zentraedi wurden in die Gesellschaft der Menschen eingeführt. Doch es droht neuer Ärger, in dem Förderationsbereich Terra sind außerirdische Truppen eingefallen und die sind nicht gerade freundlich. Sofort schickt man Valkyries los, um die Gegner aufzuhalten und die alte Taktik mit den Musik Liedern von Lynn Minmay wird erneut benutzt, um die Gegner zu verwirren. Doch die Marduk, so nennen sich die Angreifer, kontern ihrerseits mit einem Lied, das die Aggressivität fördert.

Ein Reporter, Hibeki, wird ins All geschickt, um den Kampf zu Filmen, aber er landet aus versehen auf einem Schiff der Marduk. Dort sieht er ein hübsches Mädchen, Ishtar, das ohnmächtig ist und er nimmt sie mit, es stellt sich heraus, dass sie eine Emulatorin ist, so heißen die Sängerinnen der Marduk und sie ist auch noch ihre beste.

A.D. 2089 - Sono passati 80 anni da quando la Prima Guerra Spaziale ha cambiato la vita degli umani e degli Zentraedi. Entrambe le razze sono in pace sulla Terra quando una nuova razza aliena chiamata "Marduk" appare nel sistema solare. Mentre copre la prima battaglia tra l'U.N. Spacy e la flotta Marduk, la reporter esordiente della SNN Hibiki Kanzaki scopre Ishtar, un "emulatore" che migliora le capacità di combattimento dei Marduk attraverso il canto. Hibiki porta Ishtar sulla Terra per insegnarle i valori della vita e della cultura. Insieme all'asso della Valchiria Silvie Gena, Hibiki e Ishtar devono trovare un modo per salvare la Terra dalla distruzione totale per mano del leader dei Marduk Ingues.

かつてのゼントラーディとの戦争終結から長い年月がたった。TVレポーター・ヒビキは、突如侵攻してきた異星軍と統合軍の戦闘を取材する事になった。だが目撃したのは、撃破される統合軍部隊だった。混乱するままに敵戦艦に進入した彼は、そこで美少女・イシュタルと出会う。二人の出会いが新たな物語の幕を上げた…。

전작 마크로스의 시대로부터 80년이 흐른 시대. 인류는 최초의 접촉 이래 계속 젠트라디와 싸워 자신들의 문화를 지켜왔다. 그러나, 슬슬 통합군도 부패하기 시작하고, 매너리즘에 빠져 자신들의 군대가 최강이라는 식의 김 빠진 선전만 해댄다. SNN의 보도기자인 히비키는 통합군 고위층인 엑세글렌과 통합군 인기 넘버 1의 여성 파일럿 실비지나가 호텔에서 밀회를 나누고 빠져나오는 장면을 스캔들 특종으로 취재하지만, 군의 압력으로 되려 편집장에게 호통만 듣는다. 반항적인 기질로 똘똘 뭉친 히비키는 군은 항상 권력을 방패삼는다며 분개하고... 그러나 사실 실비는 통합군 내에 문제가 커져가는 것을 상관인 엑세글렌에게 비밀리에 보고하려던 것이었다. 이런 시기에 다시금 외계로부터 새로운 적이 나타난다. 첫 번째 접촉에서는, 통합군의 '민메이 어택'이 잘 먹혀들어 성공한 듯 보였다. 그러나, 뜻밖에도 새로이 조우한 적에게는 그들만의 '노래'가 있었다. 그들은 단순한 젠트라디 잔당이 아니었던 것이다. 지난번 스캔들 건으로 근신 명령을 받았던 히비키에게 베테랑 보도기자인 데니스와 함께 전선 취재를 나가라는 명령을 하는 편집장. 히비키와 데니스는 SNN의 민간용 발키리를 타고 전선으로 간다. 그곳에서 그들이 본 것은 전혀 적에게 대응하지 못하고 계속 패배를 거듭하고 있는 통합군의 모습. 한편, 공격받아 항해불능이 된 적함의 내부를 촬영하러 돌입한 그들은 세뇌를 받고 있는 젠트란들을 발견한다. 누군가 다른 존재가 젠트란들을 세뇌해서 전쟁도구로 조종하고 있는 것이다. 한편 정신을 잃은 한 소녀를 발견하게 되는데, 특이하게도 '마이크론 사이즈'의 인간이 거인들의 배에 있는 것을 묘하게 여긴 데니스가 소녀를 데리고 가자고 한다. 소녀를 발키리에 태우려다 폭발에 휘말린 데니스는 사망한다. "우리가 찍은 영상이다. 반드시 특종이 될 거야"라는 말을 남기고... 본래 히비키가 기자가 된 것은 한창때의 데니스가 직접 전선에서 취재한 영상에 감명을 받아서 였다. 무거운 마음으로 지구로 돌아와 편집부에 디스크를 넘기는 히비키. 그러나 다음날 TV에 나온 영상은 자신들이 촬영한 것이 아니라, 통합군이 연전연승한다는 식으로 조작된 것이었다. 분노하는 히비키. 이 때 마침 정신을 차린 소녀에게 번역기를 달아주고, 대화를 해 본 결과 그녀의 이름은 '이슈탈'이며 '마르두크의 이뮬레이터'라는 말을 듣게 된다. '취재'의 일환으로 이 소녀에게 지구의 문화를 가르쳐주고 그 모습을 지켜보자고 생각한 히비키는 그녀를 거리로 데리고 나가고, 히비키의 행동을 주시하던 실비와도 얽히게 된다. 컬쳐 플라자에서 지구의 과거 모습을 보여주는 시설을 보고 있을 때, 멀리서 '마크로스'의 모습을 본 이슈탈은 그것이 마르두크를 인도하는 '아르스의 배'라고 말을 한다. 자신이 꿈속에 보았던 것이라며... 이 때 이슈탈을 데리러 페프의 부대가 나타나는데, 이슈탈은 스스로의 의지로 페프를 거부하고 히비키에게로 달려간다. 지구의 '노래'를 배우기위해, 마르두크를 구할 '아르스의 배'에 대해 알기위해... 제작시기만을 놓고 보면 원조 마크로스의 후속작이지만 그 내용이나 시공간적 배경은 완전히 달리 하고 있는 작품이다. 원조 시리즈의 민메이라는 너무도 큰 위세를 떨치고 있는 캐릭터의 영향력에서 벗어나려는 듯 새로운 가수를 도입하고, 민메이 어택이라는 이름으로 불릴 정도로 유명해진 지구인의 공격을 이제는 지구인만의 독특한 공격법이 아니라 적도 스스로를 위해 사용한다는 새로운 설정 또한 도입하였다. 그러나 원조 시리즈보다 훨씬 미형화된 그림체에도 불구하고 히비키와 실비 지나, 이슈타르간 삼각관계 형성에 무리가 있고, 중간에 작화 퀄리티의 일관성을 유지 못한 것 때문에 상대적으로 큰 호응은 얻지 못하였다. 그러나 오프닝 곡을 비롯하여 음악을 중시하는 마크로스 시리즈인 만큼 작품 전반에 명곡들이 많이 포진하여 있고, '마크로스'라는 명칭에 중점을 두지 않고 하나의 독립된 작품으로만 본다면 충분히 그 나름대로의 재미와 작품성을 갖춘 작품이라고 할 수 있다.

2089 - 80 anos se passaram desde a Primeira Guerra Mundial, que mudou a vida das raças humana e Zentraedi. Ambas as raças estão em paz na Terra quando uma nova raça alienígena chamada "Marduk" aparece no Sistema Solar. Enquanto cobre a primeira batalha entre a Spacy da ONU e a frota de Marduk, o repórter novato do SNN, Hibiki Kanzaki, descobre Ishtar, um "Emulador" que aprimora as habilidades de combate do Marduk através do canto. Hibiki leva Ishtar à Terra para ensinar a ela os valores da vida e da cultura. Juntamente com o piloto da Valkyrie, Silvie Gena, Hibiki e Ishtar devem encontrar uma maneira de salvar a Terra da destruição total nas mãos do líder de Marduk, Ingues.

Около столетия прошло после окончания космической войны между землянами и Зентради. Теперь 2 расы мирно живут на нашей планете, установив новые правила, сформировав новое общество, а прошлый конфликт остался в истории. Но в один перкрасный день, были замечены боевые корабли расы Мардук, которые быстро приближались к Земле. Раньше люди боролись против Зентради песнями Минмэй, однако у новых агрессоров есть своя сирена, чье пение намного сильнее и повышает боевые характеристики кораблей.

La historia de "Chojiku yosai Macross II - Lovers Again" se remonta 80 años después de los acontecimientos sucedidos en Macross. Ahora la tierra vive en paz donde los Zentraedis y los humanos coexisten pacíficamente. La historia se centrará en el joven reportero de la cadena televisiva SNN, Hibiki Kanzaki, cuya vida cambiara completamente cuando una nueva fuerza alienígena entra a nuestro sistema solar y este es designado a cubrir la noticia donde las Fuerzas armadas Terrícolas son enviadas a detener a los invasores. Durante la batalla, Hibiki conoce a una bella extraterrestre llamada Ishtar y aquí es donde comienza toda la historia.