Misteriosos seres gigantes llamados "Colas del Dragón" han aparecido en todo el mundo. Debido al peligro que podría traer, la tropa Keroro hizo una investigación mundial sobre las Colas del Dragón, pero Tamama desapareció repentinamente durante la investigación. Por eso, toda la tropa comenzó la búsqueda de Tamama y terminó en el Mont-Saint-Michel, Francia, donde se encontraron con una misteriosa chica llamada Sion, que tiene el misterioso Libro del Dragón. Pero poco saben de los secretos sobre ella y la calamidad mundial que destruiría al mundo entero.