讲述2022年即将上映的系列最新电影《沉默的巡游》4年前发生的故事，一名自由撰稿人被杀害，他的房间里有个仓库墙壁上突然开了个洞的奇怪视频，使得汤川学教授对这起案件产生了兴趣。

刑警草薙俊平與搭檔牧村朋佳奉命調查一起自由記者命案，在他遺留的記憶卡中發現一段影片，記錄了從死者房間看到倉庫牆壁突然開了一個洞的奇妙現象。草薙找上老友–物理學教授湯川學諮詢，不料卻在調查過程中發現此案與湯川的高中學弟–古芝伸吾息息相關，案情更因牽涉眾議院議員而陷入膠著…

故事以電影版《沉默的遊行》的四年前為舞台，在帝都大學擔任准教授的湯川學（福山雅治），有多年朋友刑警草薙俊平（北村一輝）及他的部下牧村朋佳（新木優子）到訪。他們在調查自由作家長岡修被被朝後腦毆打致死的事件，草薙查到長岡是茨城縣光原市一個有關科學技術公共事業的反對派成員，而在現場留下一張記憶卡，內裡有一支影片，拍到從死者房間中看到倉庫牆壁突然開了一個洞的奇妙現象，看了這支影片的湯川意外地對此感興趣，要草薙帶他去到影片中的倉庫……

フリーライターの長岡修が自宅で後頭部を殴打され殺害された。現場には、ある動画ファイルが収録されたメモリーカードが残っていた。刑事・草薙俊平（北村一輝）、牧村朋佳（新木優子）らの捜査により、長岡は茨城県・光原市で計画中の科学技術に関する公共事業の反対派だったことが判明。長岡が残した動画に突然倉庫の壁に穴が開いた奇妙な現象が映っているのを見た草薙は、部下の牧村朋佳（新木優子）を連れ、帝都大学の准教授・湯川学（福山雅治）のもとを訪ねる。その動画を見た湯川は思い詰めた表情に変わるが・・・。

테이토 대학 의학부 신입생인 코시바 신고라는 학생이 유카와 준교수를 찾아온다. 이 둘은 같은 고등학교의 물리 연구회 선후배 관계로 유카와는 물리 연구회 졸업생으로서 코시바에게 실험을 지도했다. 우수한 과학자였던 아버지를 동경하여 과학자가 될 것이라고 기대했던 코시바가 의학부에 들어간 건 뜻밖이었지만 유카와는 코시바를 응원한다. 코시바는 존경하는 유카와를 만난 기쁨에 친누나에게 전화를 거는데 누나의 전화를 받은 것은 다름 아닌 경찰이었다...