1582年，以統一天下為目標的織田信長（中村橋之助），就將實現這樣的夢想之前，卻被家臣．明智光秀的造反下在本能寺被暗殺。然而，信長右腕的豐臣秀吉（奧田瑛二）決定在數日後要討伐光秀，想以這樣的功績來繼承信長之位，成立豐臣政權。

這時出現了像彗星般的盜賊。他的名字叫石川五右衛門（江口洋介）。有著如超人般的體質，專門從有錢人盜取金銀珠寶，分給那些貧窮的人們，而成為英雄平民。

某天夜裡，五右衛門正要開始偷取財寶中發現了一只南蠻製的箱子。在那個箱子中隱藏著重大的秘密...。