Et skudd faller og rammer en ung gutt. På en karusell, i et tivoli. Kulen var ment for FBI-agenten Sean Archer, men rammet i stedet sønnen. Sean (John Travolta) tar opp jakten, besatt av tanken på å fange morderen. Den iskalde psykopaten og bombemannen Castor Troy (Nicholas Cage) skades under flukten og faller i koma, bare minutter etter å ha avslørt sin skremmende hemmelighet: En armert biologisk bombe som er stor nok til å utradere hele San Fransisco. Klokken tikker, men ingen vet hvor. På regjeringens ordre gjennomgår Sean en ny avansert kirurgisk metode...som utstyrer ham med morderens ansikt.