Op een dag tijdens de zomervakantie verschijnt Papi, een buitenaards wezen ter grootte van een handpalm, uit een kleine raket die Nobita oppakt. Hij is de president van Pirika, een kleine planeet in de ruimte, en is naar de aarde gekomen om aan de rebellen te ontsnappen. Doraemon en zijn vrienden zijn verbaasd over Papi's kleine formaat, maar terwijl ze samen spelen met het geheime hulpmiddel 'Small Light', worden ze geleidelijk vrienden. Er komt echter een walvisvormig ruimteslagschip naar de aarde en valt Doraemon, Nobita en de anderen aan om Papi te vangen. Papi voelt zich verantwoordelijk voor het betrekken van iedereen en probeert in opstand te komen tegen de rebellen. Doraemon en zijn vrienden vertrekken naar de planeet Pirika om hun dierbare vriend en zijn huis te beschermen.