Kristoffer Nyholm (født 13. maj 1951 i Silkeborg) er en dansk instruktør der har filmet episoder af flere danske succesfulde tv-serier.

Kristoffer Nyholm, filminstruktør, der er søn af maler, keramiker Erik Nyholm (død 1990) og Janet Gay Nyholm, blev tegne- og grafikeruddannet fra Kunsthåndværkerskolen i 1974. Han har arbejdet med film siden midten af 70erne, hvor han lavede sine første kortfilm for Statens Filmcentral. Det blev aldrig til nogen traditionel uddannelse som filminstruktør, men via kurser på Den Danske Filmskole og praktiske erfaringer fra et hav af tv- og filmproduktioner, musikvideoer og reklamefilm har Kristoffer Nyholm etableret sig som filminstruktør. Kristoffer Nyholm har gennem sin karriere skrevet og instrueret en del produktioner til tv, bl.a. en filmversion af Karen Blixens "Ringen" (1988) til DR og "Radiomanden" (1990), der blev vist på TV2. Kristoffer Nyholm stod også bag tv-film som "Linegang" (1986) og "Cappuccino" (1997), samt flere af de film, der indgik i underholdningsprogrammerne "Enten Eller – du bestemmer", som DR sendte i midten af 90erne. Og så har Kristoffer Nyholm ikke mindst være med til at løfte TV-Dramas tv-serier til det niveau, de har i dag. Han startede allerede som instruktør på "Landsbyen" (1991-96) og lavede 6 afsnit. Derefter instruerede han 9 afsnit af "Taxa" (1997-99) og 6 afsnit af "Nikolaj og Julie" (2002-03). Imellem de to sidstnævnte serier var Kristoffer Nyholm tilknyttet TV2-serien "Hotellet", hvor han fungerede som kreativ producer på 30 afsnit. Sideløbende med sine egne projekter har Kristoffer Nyholm arbejdet som en slags sparringspartner for Lars von Trier og deltaget i produktionen af de fleste af Triers film. Kristoffer Nyholm stod blandt andet bag kameraet på "Epidemic" (1987) og var 2. unit fotograf på "Breaking the Waves" (1996). I dogme-filmen "Idioterne" (1998) var Kristoffer Nyholm både fotograf og instruktørassistent, og han har også været med under forproduktionen af Lars von Triers film, "Mandalay" (2005). I årene 1996 til 2006 var han gift med musiker, komponist Elisabeth Gjerulf Nielsen (16-08-1957 - 24-10-2022). Kristoffer Nyholm blev den 22. februar 2020 gift med skuespiller og filminstruktør Charlotte Sieling.