2003年，寄生真菌的爆发肆虐了全世界，乔尔米勒试图带着女儿和弟弟逃离越演越烈的混乱局面。20年后，乔尔与泰丝努力在集权主义下求生存。而叛乱组织“火萤”则收容了一位天赋异禀的少女。

2003年，印度的科学家有了毁灭性的发现。2023年的隔离区外，波士顿早已成了废墟；当乔尔与泰丝试着从感染者中逃离时，他们因艾莉的命运起了冲突。

末日生存者比尔准备好独自一人在末世生活，一名神秘的陌生人却打乱了他的计划。多年后，乔尔与艾莉试图寻求比尔的帮助，并发现他们站在了命运的十字路口。

历经千辛万苦长途跋涉横越荒凉的美国之后，乔尔与艾莉徒步穿越危机重重的堪萨斯城。随后，反抗军领袖凯瑟琳展开了一场追捕行动，她手下暴力的民兵令拯救世界的希望备受威胁。

在刚重获自由的堪萨斯城街道上，反抗军士兵奉无情的领袖之命对山姆发起攻击，亨利为了保护弟弟而战。随着追捕行动的升温，凯瑟琳也越来越渴求复仇。同时，艾莉与某人展开了一段充满意义的友谊。

旅程又过了好几个月，乔尔与艾莉收到了关于未来的严正警告。不久之后，艾莉对乔尔的过去有了更多了解；但对乔尔来说，他只想忘掉一切。

乔尔为求生而努力奋斗，艾莉在拯救他的过程中想起在对策局孤儿院的回忆。在遇到乔尔的几周前，艾莉与好友莱莉一起度过了最美好的一夜；而这份回忆将永远改变两人以及全世界的命运。

一群怀恨在心的生存者与艾莉相遇，她努力奋斗的模样吸引了其中的领袖不必要的注意。命在旦夕的乔尔挣扎求生，面临嗜血的狩猎集团威胁。

经历了被感染者的追杀后，大腹便便的安娜将希望寄托在挚友身上。几年后，艾莉被迫面对自己这段旅程所累积下来的创伤，而乔尔则面临自己的一个毁灭性决定。