Il senatore Leroy Clark deve decidere se approvare o meno un nuovo finanziamento per il progetto "Time Tunnel". Gli scienziati sono sicuri di riuscire a provare che il viaggio nel tempo è possibile, ma gli esperimenti sono molto costosi e per il momento con pochi risultati. Mentre il Dottor Douglas Phillips, responsabile del progetto, illustra le idee della sua équipe al senatore, il suo secondo, il Dottor Tony Newman, è impaziente di poter dimostrare praticamente di cosa è capace il tunnel. All'insaputa dei suoi colleghi entra nella galleria del tempo e viene catapultato nel 1912, a bordo del Titanic...

Doug Phillips e Tony Newman si ritrovano dieci anni nel futuro, su un razzo diretto verso Marte. La loro presenza non prevista procura seri problemi in fase di decollo, quando infatti viene consumato del carburante in eccesso e l'equipaggio, ancora ignaro di avere clandestini a bordo, pensa di passare dalla luna per fare rifornimento. Le comunicazioni con la Terra sono impossibili, poiché qualcuno ha sabotato la radio. Quando Doug e Tony vengono scoperti, sono accusati di essere delle spie al soldo dei sovietici, intenzionati a impedire agli Stati Uniti di raggiungere per primi il pianeta rosso...

Nel 1910 la cometa di Halley passa vicino alla Terra e, secondo i calcoli del Professor Ainsley, dovrebbe colpirla. Doug e Tony atterrano durante il crollo di una miniera, ma non riescono a convincere il custode a far intervenire la gente del vicino villaggio per salvarli. Secondo l'uomo infatti non ha senso fare tanta fatica quando tutto il mondo sta per essere distrutto da una cometa. Mentre Tony cerca di convincere la folla impazzita ad aiutare gli uomini sepolti in miniera, Doug si reca dal Professor Ainsley per rivedere i suoi calcoli. Intanto, dalla base sotterranea del progetto la Dottoressa MacGregor, il Dottor Swain e il Generale Kirk tentano di far arrivare ai due fisici un radioscopio che potrebbe aiutarli a dimostrare l'erroneità della tesi di Ainsley...

Honolulu non è il posto più tranquillo dove arrivare il giorno precedente dell'attacco a Pearl Harbour, ma Tony e Doug si ritrovano proprio nel consolato giapponese alle Hawaii il 6 dicembre del 1941. Scambiati per spie riescono a fuggire, ma Tony vuole trovare suo padre, disperso durante l'attacco, per avvertirlo. I due riescono a rintracciare l'uomo, ma non hanno fortuna con il Comandante Newman, che si mostra scettico e incredulo di fronte all'eventualità di un attacco nipponico. Quando un bambino irrompe nella stanza, Tony si rende conto di trovarsi di fronte a se stesso all'età di sette anni...

Tony Newman e Doug Phillips arrivano nel bel mezzo della guerra del 1812 e vengono catturati dagli Inglesi.  Il Colonnello Southall li considera spie e i membri dell'équipe del tunnel temporale chiedono aiuto al Generale Southall, pronipote del colonnello e noto studioso di storia militare. Il generale è affascinato dalla possibilità di vedere la storia in prima persona e spera di scoprire perché il suo antenato causò una delle più disastrose sconfitte, meritandosi il soprannome di "macellaio". Intanto Tony è costretto a guidare un soldato inglese verso le linee americane...

Mentre il Dottor Holland, un eminente scienziato inglese, sta studiando l'attività del vulcano Krakatoa, Tony e Doug arrivano sull'isola. La figlia di Holland non si fida, perché teme che i due siano giunti per defraudare suo padre delle sue importanti scoperte, ma ai due fisici preme di più scoprire la data precisa per sapere quanto tempo rimane prima che il vulcano esploda. Quando finalmente appurano che mancano solo poche ore alla catastrofe, tentano di convincere l'ostinato scienziato e la figlia ad abbandonare l'isola. Gli indigeni che hanno accompagnato Holland sono invece convinti che sia sufficiente un sacrificio umano per placare le ire del vulcano e hanno scelto proprio Doug e Tony per il barbaro rituale...

Ulisse si sta chiedendo come fare per sbloccare l'assedio di Troia, che dura ormai da ben dieci anni, quando due stranieri vengono portati al suo cospetto. I loro abiti non fanno pensare a delle spie troiane e Ulisse si convince di trovarsi al cospetto di due dei. Tony e Doug non fanno nulla per smentirlo, affascinati dalla possibilità di trovarsi a vivere la più leggendaria fra le guerre dell'antica Grecia. Il braccio destro di Ulisse però pensa che si tratti di due impostori troiani e sfida Doug a duello...

Arrivati in una pianura dove è appena infuriata una battaglia sanguinosa, Tony e Doug vengono catturati dagli indiani. Doug riesce a fuggire grazie all'aiuto di un trombettiere, unico sopravvissuto al massacro, mentre Tony viene condotto al cospetto di Toro Seduto. Sta per essere bruciato vivo, quando il capo sioux, impressionato dal coraggio e dalle parole di pace di Tony, interrompe la cerimonia. Intanto Doug raggiunge il campo del Generale Custer, che sta completando i piani per la battaglia dell'indomani, uno scontro decisivo che si svolgerà nei pressi di Little Big Horn...

Dal 1852 al 1946 la Francia utilizzò una piccola isola al largo della Guyana come prigione e quando Tony e Douglas vi giungono è già tristemente nota come l'Isola del Diavolo. Gli scienziati vengono scambiati per due evasi e condotti al campo con gli altri detenuti. Qui scoprono che i prigionieri stanno organizzando una fuga per liberare il Capitano Alfred Dreyfus. Tony e Doug sanno che il tentativo è destinato a fallire, perché secondo i libri di storia Dreyfus non riuscì ad evadere dall'isola, ma non riescono a convincere i loro compagni di sventura. Al centro di monitoraggio del progetto, il Generale Kirk, con Swain e Ann MacGregor, tenta di riportare Tony e Doug al presente. Al loro posto giunge un disorientato prigioniero che non ha nessuna intenzione di farsi rimandare indietro...

Appena arrivato nella Francia del 1793, in pieno Regno del Terrore, Doug viene arrestato dal Comitato per la Pubblica Sicurezza e finirebbe sicuramente sulla ghigliottina se Tony non riuscisse a liberarlo. Con l'aiuto di un negoziante fedele a Maria Antonietta, Tony e Doug si mettono in salvo. Il Generale Kirk, sperando di riuscire a mettere a fuoco la loro posizione e riportarli a casa, invia nel passato un suo inconfondibile anello, ma i due scienziati non capiscono il messaggio e, incontrato un militare identico al generale, credono che sia lui stesso venuto in loro aiuto e gli corrono incontro. Si tratta invece del Generale Querque, fedele servitore di Robespierre, che senza indugi li arresta...

Tony e Doug arrivano nella Russia del 1956 e scoprono subito un messaggio proveniente dal futuro. Devono incontrare un certo Alexis che affiderà loro una missione segreta. Giunti all'appuntamento, scoprono che l'ignoto Alexis è un agente segreto che consegna loro falsi documenti e un incarico. Devono scoprire quanto più possibile del misterioso Progetto A-13. I due scienziati vengono condotti sul luogo del progetto e non credono ai loro occhi quando vedono un tunnel del tempo, all'apparenza funzionante e identico a quello che li ha condotti lì. Nel presente, il Generale Kirk e la sua squadra non riescono a comprendere come i russi abbiano potuto realizzare il tunnel del tempo con così tanto anticipo rispetto agli Stati Uniti...

La storia insegna che il Presidente Lincoln venne ucciso nel 1865, perciò Doug e Tony sono stupiti quando arrivano nel 1861 e si ritrovano nel bel mezzo di un dibattito che organizza l'assassinio del presidente. Vengono scambiati per due cospiratori e aiutati a fuggire quando gli uomini di Pinkerton fanno irruzione, ma Doug viene arrestato. Tony si ritrova a casa dei due capi, Jeremiah e Matthew, che gli spiegano di aver preparato una bomba a orologeria e di volerla fare esplodere sul treno che porta Lincoln a Washington per il suo insediamento. Mentre Doug cerca di convincere Pinkerton della sua innocenza e Tony tenta invano di far desistere Jeremiah e Matthew dai loro intenti omicidi, il treno presidenziale si avvicina...

Nella base sotterranea del progetto, il Generale Kirk, il Dottor Swain e la Dottoressa Ann MacGregor hanno solo nove ore di tempo per riuscire a trasportare i loro uomini lontano dalle coordinate spazio tempo in cui si trovano. Doug e Tony infatti sono all'interno di Alamo, poco prima della battaglia decisiva contro i messicani. Doug è stordito a causa di un brutto colpo alla testa e Tony riesce a fuggire per cercare un medico nella città vicina, ma viene catturato dai messicani. Il lavoro alla base è complicato dal fatto che dopo la battaglia il forte venne raso al suolo, quindi è impossibile riuscire a determinare con precisione il luogo in cui si trovano i due viaggiatori. L'unica cosa certa è che non ci furono sopravvissuti fra i difensori del forte, dopo che i messicani fecero irruzione...

Giunti in pieno deserto, Tony e Doug vengono aggrediti da un gruppo di Afghani. Doug viene condotto all'accampamento e interrogato da Singh, capo della tribù, mentre Tony, colpito da una fucilata e creduto morto, è abbandonato al suo destino. Soccorso da un giornalista di nome Rudyard Kipling, Tony scopre di trovarsi nel 1876. Doug viene invece a sapere dal crudele Singh che gli Afghani preparano un attacco contro gli inglesi. Con l'aiuto di un vecchio cieco, Doug fugge e raggiunge il forte, dove si riunisce con Tony. Insieme cercano di convincere il Colonnello Fettreetch del pericolo, ma l'ufficiale ha ricevuto ordini ben precisi che gli impediscono di sferrare un attacco preventivo...

Tony e Doug vengono catturati dalla Gestapo a Cherbourg, due giorni prima dello sbarco in Normandia. Il Maggiore Hoffman è impaziente e vorrebbe interrogarli subito, ma ha l'ordine di assecondare il Dottor Kleinemann, che invece vuole sottoporre Doug a uno speciale lavaggio del cervello. Tony viene lasciato fuggire e seguito, nella speranza che riesca a raggiungere gli uomini della resistenza. Doug invece è trattenuto in infermeria, dove il Dottor Kleinemann lo convince, con l'aiuto di droghe e di registrazioni, di essere Heinrich Krieger, un ufficiale delle SS. Il diabolico medico si spinge ancora oltre e Doug si convince di dovere uccidere Tony Newman, il suo peggiore nemico...

Nel 1215 Re Giovanni sta per arrestare il Conte di Huntington per avere osato proporgli di firmare la Magna Carta quando arrivano Doug e Tony. Doug viene arrestato insieme a Huntington, ma Tony riesce a liberarlo. Nella fuga i due sono costretti ad abbandonare Huntington, ma seguendo le istruzioni del conte si rifugiano nella foresta, dove vengono intercettati da Little John, Fra' Tuck e gli altri uomini di Robin Hood. Scoprono così che il Conte di Huntington altri non è se non Robin Hood in persona e, grazie alle loro nozioni di chimica, aiutano Little John e gli altri a liberarlo, così che possa unirsi agli altri nobili e obbligare Re Giovanni Senzaterra a firmare la Magna Carta...

Tony e Doug arrivano su un'isola sperduta nell'oceano verso la fine della seconda guerra mondiale. Due giapponesi presidiano il territorio, l'anziano Sergente Itsugi e il Tenente Nakamura, un giovane ossessionato dall'odio per gli americani. Incurante del fatto che Tony si sia slogato una caviglia durante il salto temporale, Nakamura decide di divertirsi con i due nemici e dà loro un'ora di tempo per nascondersi nella giungla. Trascorso quel tempo, inizierà una vera e propria caccia all'uomo. Nella sede del progetto il Generale Kirk cerca di capire su quale isola si trovino i suoi due scienziati e chiede aiuto al Dottor Nakamura, senza sapere che si tratta del padre del sadico tenente. Viene così a sapere che il Tenente Nakamura era un pilota kamikaze che ha fallito la sua missione e che non è mai tornato a casa, considerato disperso in guerra...

Trovandosi su un'astronave, Doug e Tony si convincono di essere approdati nel futuro, e l'apparizione di due alieni sembra confermare questa ipotesi. In realtà si trovano nel 1865 e Centauri e Taureg, questi i nomi dei due alieni, dichiarano di avere intenzione di accaparrarsi tutte le proteine presenti sul pianeta Terra. Trasferitisi alla periferia di una piccola città dell'Arizona, tengono sotto controllo la mente di Doug, mentre Tony dovrà recarsi ad ordinare allo sceriffo di mettere a disposizione degli invasori tutte le proteine presenti in città, mandrie incluse. Lo sceriffo però è alle prese con gli indiani e non crede a una parola del racconto di Tony. Credendolo pazzo o ubriaco, preferisce fargli passare qualche ora in prigione...

Tony e Doug arrivano in Italia, il 23 Ottobre 1915, poco prima di un bombardamento. Una violenta esplosione li mette fuori combattimento e scoperchia un'antica tomba, liberando lo spirito dell'Imperatore Nerone. Ripresi i sensi, i due scienziati scoprono di trovarsi nella villa del Conte Galba. Di fronte ai soldati tedeschi che si sono appropriati della lussuosa abitazione, il nobiluomo dichiara che i due americani sono suoi ospiti. Il fantasma di Nerone però vuole approfittare della sua libertà per uccidere il conte Galba, discendente di quel Servio Sulpicio Galba che fu la causa della sua morte...

Giunti in un accampamento fuori dalle mura della biblica Gerico, Doug e Tony vengono condotti al cospetto di Giosuè. Tony ricorda perfettamente la profezia e la ripete, parola per parola, al profeta. Questi si convince che i due stranieri sono emissari del Signore e li invia all'interno della città per saggiare gli umori della popolazione. I due arrivano in tempo per impedire il sacrificio umano di una ragazzina, ma Doug viene arrestato. Tony si salva rifugiandosi in casa di Rahab, sorella maggiore della vittima sacrificale. Secondo le scritture, Rahab e la sua famiglia saranno i soli sopravvissuti quando Giosuè marcerà sulle rovine delle mura di Gerico...

Tony e Doug arrivano nell'anno 1519 in tempo per assistere alla tortura di due indigeni da parte di Hernando Cortèz. Il conquistatore spagnolo vuole scoprire l'ubicazione di una maschera d'oro, sacra per gli Indios. I due scienziati intervengono, ma gli uomini di Cortèz riescono a catturarli e a uccidere due indigeni. Grazie all'intervento di un Indio, Doug e Tony fuggono, insieme con un ragazzo, unico superstite delle torture di Cortèz, e si dirigono verso il nascondiglio della maschera d'oro, inseguiti dai soldati di Cortèz. Alla base, il Generale Kirk chiede aiuto a Castillano, un uomo che conosce bene la zona in cui si trovano Doug e Tony...

Poco dopo il loro arrivo nel 1860, Doug e Tony si ritrovano nell'ufficio dello sceriffo di Lincoln giusto in tempo per assistere all'evasione di Billy the Kid. Doug spara un colpo che apparentemente uccide il pistolero, poi fugge insieme a Tony. In realtà Billy the Kid è illeso e ordina ai suoi uomini di restare in città, mentre lui va a pareggiare i conti con i due forestieri. Ancora una volta Doug e Tony hanno la meglio e riescono a catturare il pericoloso bandito. Tony torna in città per avvertire lo sceriffo Pat Garrett, ma viene scambiato per Billy the Kid e incarcerato...

Doug e Tony piombano nel bel mezzo di una battaglia navale. La nave pirata su cui sono atterrati sta avendo la meglio su un galeone spagnolo. Finiti i combattimenti, i due fisici vengono condotti al cospetto del Capitano Beal insieme agli altri prigionieri. Il pirata non sa che farsene di loro perché non sono marinai e non hanno parenti ricchi disposti a pagare un riscatto, per cui ordina di ucciderli. E' molto più interessato a un bambino di dieci anni che dichiara con orgoglio di essere il nipote del re di Spagna. Il piccolo, molto maturo e coraggioso per la sua età, capisce che i due uomini vestiti in modo strano potrebbero essere dei validi alleati e chiede che siano risparmiati perché badino a lui in attesa che giunga il riscatto dal sovrano spagnolo...

Un sabotatore è riuscito a lavorare in incognito al tunnel del tempo per molti anni e ora ha deciso di far esplodere l'impianto. Dopo aver sistemato la bomba, fugge nel tunnel e si ritrova nello stesso spazio-tempo di Doug e Tony, il Grand Canyon del 1547. La vita di tutte le persone all'interno dell'impianto dipende dai due scienziati che devono trovare Nimon e farsi dire dove ha nascosto l'ordigno nucleare. Nimon riesce a fuggire nel futuro e il Dottor Swain lancia Doug e Tony al suo inseguimento. Al loro arrivo i due scoprono di essere giunti una decina di anni dopo Nimon. La spia si è già conquistata la fiducia degli esseri umani del futuro, persone geneticamente modificate che vivono in una società organizzata come un alveare...

Poco dopo il loro arrivo sul campo di battaglia di Gettysburg, Doug e Tony si ritrovano coinvolti in un'esplosione. Un ufficiale nordista incita Doug ad allontanarsi perché Tony è ormai morto. Poco dopo, grazie a un intervento da parte degli scienziati del tunnel, Tony si riprende, ma ha perso la memoria e segue un gruppo di sudisti che sta cercando un certo Michaels. Quest'uomo è in possesso di parecchi barili di polvere da sparo ed è disposto a cederli ai sudisti. Vestendo la divisa blu dei nordisti, Doug trova la casa di Michaels e scopre che si tratta in realtà di Niccolò Machiavelli, il famoso filosofo, politico dell'Italia del 1500. Per una stranissima combinazione, il suo segnale è identico a quello di Doug, ecco perché è stato trasferito anche lui in questo tempo...

Nel 1287 Doug e Tony vengono catturati dai Mongoli guidati da Batu, il nipote di Gengis Khan. Riusciti a fuggire, si uniscono a Marco Polo, che sta conducendo in salvo la figlia di Kublai Kahn, Sarit. Non appena posa gli occhi su di lei, Tony si innamora perdutamente e la donna ricambia il suo amore, affascinata da questo straniero. Tony confida a Doug di essere stanco di tante avventure e di volersi fermare per sposare Sarit e mettere su famiglia. Doug è allibito, insiste perché Tony si renda conto che il suo presente è il 1978 e che non potrà mai essere felice con una donna che per lui deve essere morta già da secoli. Anche al quartier generale le opinioni divergono. La Dottoressa MacGregor pensa che Tony abbia ragione, mentre il Generale Kirk e il Dottor Swain temono che una simile decisione possa avere conseguenze disastrose...

Nel quartier generale il tempo si ferma e Mago Merlino prende in prestito Doug e Tony perché devono aiutare Re Artù a sconfiggere i vichinghi. Durante una lotta, Tony viene catturato insieme al giovane sovrano, mentre Doug è lasciato sul campo di battaglia, in apparenza morto. Doug si risveglia in un letto, affidato alle cure della bella Ginevra e del misterioso Merlino. Intanto Tony e Artù riescono a fuggire. Intanto al quartier generale tutto è pronto per richiamare i due fisici e Merlino deve intervenire ancora una volta per bloccare i macchinari, spiegando agli allibiti MacGregor, Swain e Kirk di aver bisogno che Doug e Tony si fermino ancora per un po' nel 544...

Tony e Doug si ritrovano nel bel mezzo della battaglia di Khartoum fra arabi e inglesi nel 1883. La situazione sarebbe già abbastanza preoccupante da sola, anche senza l'arrivo di due alieni che li catturano e li conducono in un covo scavato nelle montagne. Lì, il capo degli extraterrestri confessa di avere notato il loro insolito arrivo sul campo di battaglia e di volere informazioni sul viaggio nel tempo. Nel frattempo ha già inviato agli scienziati del tunnel una bomba, per dissuaderli dall'intervenire in loro aiuto. Risponde alla curiosità di Doug affermando di avere il compito di conquistare tutti i mondi della galassia per dimostrare la sua capacità di comando e di avere già pronti due missili per fare esplodere Londra...

Appena arrivati in una cantina zeppa di apparecchiature elettroniche, Tony e Doug sono aggrediti senza alcuna ragione da un individuo che scompare dopo essere stato messo al tappeto. Saliti al pianterreno di quello che sembra un innocuo albergo, i due scienziati scoprono che l'intero villaggio del Maine in cui si trovano è stato invaso da alieni che intendono rubare tutto l'ossigeno della Terra. Inutile cercare aiuto: sembra che tutta la popolazione sia stata ridotta allo stato vegetale, tranne due ragazzi che in qualche modo sono riusciti a sfuggire agli extraterrestri. Unendo le loro forze i quattro tentano di sabotare il piano degli alieni, ma questi riescono a raggiungere il quartier generale del tunnel del tempo e iniziano ad aspirare l'ossigeno anche dalla sala controllo...