海咲野心是个非常喜欢海洋生物的女高中生。她的脑子里装的全是关于自己担任代理馆长的“戛玛戛玛水族馆”的事。为了从倒闭的危机中守住水族馆，即使是暑假期间她也努力工作。另一方面，宫泽风花放弃当偶像以后，漫无目的地来到冲绳，而偶然经过的观光协会人员久高夏凛，介绍她去“戛玛戛玛水族馆”参观。风花因此在水槽前有了不可思议的体验，“难道你刚刚看见了？”此时，心开口向那样的风花搭话。

风花决定要在“戛玛戛玛水族馆”工作，她受到心爷爷奶奶的欢迎，寄住在海笑野家。为了重整濒临倒闭的水族馆，心把暑假视为最后决赛，对于工作展现出更旺盛的干劲。隔天，尽管风花从心那边学到水族馆的工作有多么严格，但还是准备两个人一起进行企鹅喂食秀。

心与风花了解彼此以后逐渐缩短内心距离。这天，爷爷因为出差不在水族馆，两人一起替企鹅量体重。风花手脚俐落地处理工作，让人感觉不出她先前还喂食失败。另一方面心则是察觉企鹅的状态有异。生命托付在自己手上的重责大任，使得不安的心等不及爷爷回来，便先去找还在休产假的竹下兽医师商量。

“戛玛戛玛水族馆”决定举办触摸池活动，让游客可以直接与海洋生物接触。为了暑假的招牌活动即将开放，心干劲十足。只见她有条不紊地对给予协助的饲育员屋嘉间志空也、以及青梅竹马仲村棹陆续下达指示。另一方面，风花被指派担任导览员，尽管面对群众令她感到不安，但风花仍然尽力准备着。此时，知道风花以前是偶像的饲育员贝殿轰介休完假回到了工作岗位上。

风花的妈妈绘里来到“戛玛戛玛水族馆”要带女儿回家。然而还不想回去的风花，在心的协助之下逃离妈妈身边。风花再次无处可去，就这么闲晃到心的朋友照屋月美帮忙工作的餐厅“KAME”，在那里，风花与一名人物重逢了。另一方面留下的心，则是执行各式各样的作战计划来拦住绘里。

“戛玛戛玛水族馆”将在8月底关馆的事迫在眉梢，于是心拼命思考着能改变现况的揽客方法，但却迟迟想不出好主意。此时风花说的话成为契机，心决定挑战制作原创甜点。借助月美的力量，三个人努力开发着“戛玛戛玛水族馆”的新名产，随后也顺利定下了菜单，本以为制作原创甜点之路会一帆风顺，然而……

心等人的努力得到了回报，“戛玛戛玛水族馆”的来客数持续增加。做出成果令心相当高兴，于是她更加努力想阻止关馆。然而无理的提议却使得空也跟她起了争执。看不下去的爷爷，表示为了让饲育员们能稍微喘口气给大家放个假。隔天，加上夏凛、月美，众人一起来到海边。心利用假期充分享受烤肉与玩水的乐趣，但这阵容里却多来了一个人。

来自兴建中水族馆“银河水族馆”的新人饲育员南风原知梦为了实习，来到了戛玛戛玛水族馆。心在爷爷的指示下担任她的指导人员。但心不认同新的水族馆，将知梦视为敌手，三番两次想要考验她。而后心与知梦仍旧感情不睦，关系别扭的两人就这样跟风花一起开始了企鹅的散步时间……？

倒闭之时已迫在眉睫，心开始思考能够一次翻盘的点子。心想利用风花曾经在水槽中看见幻影这点来进行宣传，然而夏凛等人认为不能宣传这种虚无缥缈的事而反对。尽管如此心仍不放弃，开始寻找能够确实看见幻影的方法。另一方面，风花收到了出演电影的邀请而感到困惑。

台风逼近南城市的八月某日，为了呼吁反对关馆，心一个人固守在“戛玛戛玛水族馆”里。而担心她的风花也跑来跟她一起闭门不出。可是心却以冷淡又不坦率的态度，对待烦恼出路的风花。与此同时，台风威力增强导致水族馆停电。两人便开始巡视水槽跟生物是否有异常状况。

最后一天营业，众多客人光临“戛玛戛玛水族馆”。心等人看到这幅景象心满意足，创造最后回忆的同时，大家今天仍然努力工作。最后在许多人的笑容与欢闹声中，小小的水族馆正式关馆。当天晚上，心与风花谈论起彼此的前程，而她们做出的决定究竟是……？

“戛玛戛玛水族馆”结束营业后时光流逝，来到了隔天的春天。高中毕业的心来到“银河水族馆”就职。虽然心希望在新职场也能做饲育员，不知为何却被分配到营业部。还来不及整理心情，心便面临副馆长・诹访哲司的考验。再加上还与曾来“戛玛戛玛水族馆”实习的知梦再会。

心工作做不好感到十分沮丧，此时向她搭话的人正是回到冲绳的风花。隔天，诹访交代由心负责后场参观团的准备工作。为了一个礼拜后即将开办，心便四处拜托知梦及其同事岛袋薰等饲育员们提供协助。

心收到诹访的指示，必须想出突然决定要举办的主题展的点子。因为风花说了这是让大家了解生物的机会，让心开始积极行动。隔天心向诹访提出了各式各样的点子，其中海蛞蝓展被采用了。但是，想要展示不易饲养的海蛞蝓还有许多问题在等待着。

“银河水族馆”即将迎来企鹅蛋的孵化。为了守候新生命的诞生，风花等企鹅组的饲育员必须要轮流过夜观察孵蛋过程。但是不知为何，只有知梦不用排过夜的班表。心无法接受知梦得到特别待遇的事情，但她从饲育部部长·雅蓝洞凡人口中听到知梦似乎有着向周遭人们隐藏的某个秘密。

心、风花及月美三人睽违已久终于在同一天放假，于是她们决定找“银河水族馆”的员工们来办一场联欢会。心三人用料理请客，并盛情款待来到这里的工读生真荣田朱里和饲育员米仓Marina。之后结束工作的知梦与阿薰也前来会合，再加上空也、阿棹以及他们的同事比嘉瑛士，大家一起享受了一个热闹的假日。

朱里提案的让员工们进行与海洋生物有关的cosplay来迎宾的“cosplay活动”被采用了。但是在诹访的判断下，指派了心跟夏凛来代替打工的朱里负责这次活动。心以为朱里已经对水族馆的生物们抱有热情了，但朱里目前还是没有感觉。就在这时，活动开始的前一天晚上，才发现本应送达的鱼儿贴纸没有下订。

有节目决定在“银河水族馆”拍摄贴身采访小企鹅的纪录片。拍摄的前一天为了先过来看看，节目摄制团队与风花偶像时代的后辈城居琉佳一同来到了银河水族馆。风花很高兴能与后辈再相见，然而当场在导演的提议之下，却变成要她与琉佳一起担任报告人上节目。风花本打算拒绝，但当她看见显露出一丝不安的琉佳之后……

新区开设在即，心面临了大量的工作。在这时候，心从空也口中得知附近海边有迷路的野生海豚的事情。赶紧前往探查状况后，遇到一样前来观看海豚的爷爷。在那里得知“戛玛戛玛水族馆”的拆除工程即将开始一事，心感到非常冲击。但是就连整理心情的空闲都没有，诹访又指派了新的企划。

工作不顺，再加上目睹“戛玛戛玛水族馆”遭到拆除，使得心大受打击。结果隔天她自作主张休假不去上班，并且前往离岛。她在当地遇见了从事海龟研究及保育活动的轰介妻子——具殿岬。于是心决定一边帮忙岬工作，一边关注海龟的孵化过程。另一方面，风花由于担心心无法集中精神工作。此时她负责照顾的黑脚企鹅们发生了异常状况。

心见证了海龟的孵化之后，重整心情回到“银河水族馆”。夏凛与朱里温柔地接纳了她，诹访则是继续将要使用新区的婚礼企划交给她。当心烦恼有什么适合婚礼的点子时，她得到知梦与大家的协助，终于完成了企划书。然后，到了要向来馆的婚礼策划师三浦做简报的当天，究竟心的企划能不能过关呢？

星野发表了致力于研究海洋生物、环境问题的大型计划。风花先前曾经从岬那边听闻由于环境污染导致许多海龟丧命，因而对此产生了强烈的兴趣。然而参加条件却是要在夏威夷实习两年，风花不想与心分离，陷入了是否要参加的苦恼之中。另一方面，针对是否要调到饲育部，心与星野进行了面谈。却意外听到了诹访的往事。

为了迎接即将到来、由心筹划的婚礼与新区的试营运，“银河水族馆”的员工们大家都卯足全力做着准备。活动当天，会场充斥着新郎新娘与来宾们的欢笑，众人团结一致的努力得到了回报。在大型企划成功后，心与风花又一次走向不同的道路。向着未来迈出崭新一步的两人，将再次引发温柔的奇迹。