Quando Sheldon viene a sapere che i suoi amici hanno sabotato i dati raccolti nella spedizione polare, parte affranto per il Texas. Questo costringe i ragazzi ad andarlo a riprendere, il che intralcia con la speranza di Leonard di avere momenti romantici con Penny e mette a rischio l'amicizia tra i ragazzi.

Leonard e Penny fanno fatica a passare oltre una goffa prima volta, mentre Sheldon e Howard mettono in palio i loro migliori fumetti in una scommessa a proposito di un grillo.

Howard e Raj vanno a rimorchiare in un locale Goth, mentre Sheldon cerca di "modellare" Penny sperimentando la tecnica di modifica del comporamento basata sul cioccolato...

Raj deve trovare un nuovo lavoro o verrà rimandato in India, ma Sheldon ha una soluzione, che però lascia Penny e Leonard a ritrovarsi Howard come terzo incomodo...

Sheldon si prepara a dare battaglia contro l'attore dell'universo di Star Trek che lui detesta: Wil Wheaton. Intanto Wolowitz chiede a Penny di presentargli una delle sue amiche.

Sheldon insegna a Leonard le regole del football, mentre un incidente crea una frattura tra Wolowitz e Raj.

Sheldon fa da mediatore tra Leonard e Penny per via di un battibecco tra innamorati, tuttavia le sue motivazioni non sono per niente altruistiche...

Leonard, Raj e Wolowitz sono fuori città per un campeggio nel desertoo e Sheldon si ritrova a dover soccorrere Penny che subisce un infortunio.

Barry Kripke mette in imbarazzo Sheldon e gli amici si organizzano per fargliela pagare. Wolowitz è disperato perchè la storia con Bernadette si sta affievolendo e chiede consiglio a una visione di Katee Sackhoff.

Penny chiede aiuto a Sheldon per capire meglio gli esperimenti di fisica di Leonard. Intanto Wolowitz si ingelosisce perchè Leonard invita la sua ragazza Bernadette ad assistere ad un suo esperimento.

Leonard teme per la sua relazione con Penny a causa di una visita della madre. Sheldon è invece elettrizzato per la presenza di Beverly.

Quando Leonard e Sheldon subiscono un furto nel loro appartamento, si rivolgono ai loro amici per creare un sistema antifurto ipertecnologico.

La ricerca della risposta ad un problema di fisica porta Sheldon a lavorare con Penny alla Fabbrica del Cheesecake.

Leonard può portare solo una persona in un viaggio in Svizzera per visitare l'acceleratore di particelle del CERN.. il giorno di S.Valentino..

Sheldon è chiamato in giudizio per una multa presa a causa di Penny.

I ragazzi in un mercatino trovano un anello che sembra provenire dal set de "Il signore degli Anelli" e che è causa dell'ennesima discussione.

Gli amici di Sheldon intervengono in suo aiuto quando la sua paura di parlare in pubblico si frappone tra lui ed un ambito premio.

Sheldon e il suo arcinemico, Wil Wheaton, si battono nuovamente, stavolta sulla pista da bowling, mentre Leonard e Penny affrontano una discussione.

Una lite fa sì che Leonard e Penny non si parlino più e Sheldon fa di tutto per rendere entrambi felici.

Sheldon ospita una scienziata in visita la cui intelligenza è pari solo alla sua carica sessuale.

Dopo una discussione sulla temperatura dell'appartamento, Leonard si confida con Penny e le racconta come e quando ha conosciuto Sheldon.

Howard e Raj cercano di trovare la ragazza perfetta per Sheldon usando un sito internet. Penny è preoccupata perchè convinta che dopo aver avuto Leonard come fidanzato, non riuscirà ad uscire con ragazzi normali.