Lee Adama încearcă să convingă nava-penitenciar Astral Queen să ajute la colectarea apei pe Galactica. Însă, odată ajunși la bord, prizonierii au alte planuri.

Un sinucigaș cu bombă se aruncă în aer la bordul Galacticii, dar când se dezvăluie că insurgentul este un Cyclon umanoid, zvonul legat de o astfel de ființă devine o crudă realitate.

Când comandantul Adama o aduce pe soția lui Saul Tigh (presupusă moartă) la bordul Galacticii, stârnește și mai multă paranoia legată de Cycloni în rândul deja agitatei flote.

Raptorii coloniilor localizează planeta Kobol, leagănul legendar al omenirii. Laura și Adama au o dispută pe tema beneficiilor și a pericolelor iscate de descătușarea misterelor străvechi ale Kobolului.

Partea 2 din 2. În timp ce Adama plănuiește să distrugă nava-bază a Cyclonilor deasupra Kobolului, Laura se concentrează asupra străvechii profeții pentru a găsi o cale spre Pământ.

În absența comandantului Adama, care este la un pas de moarte după ce a fost împușcat, Tigh trebuie să preia comanda Galacticii și să asigure resursele necesare pentru a-i salva viața comandantului.

Urmând exemplul președintelui Roslin și al lui Tom Zarek, mai bine de o treime din flotă s-a desprins de Galactica și au sărit pe orbita lui Kobol.

Președintele Roslin, alături de aliații ei, pornesc în căutarea criptei Atenei, în timp ce comandantul Adama organizează o misiune de salvare pe Kobol.

O luptă pentru puterea militară amenință să se transforme într-un adevărat război atunci când Galactica și Pegasus își unesc forțele pentru a distruge o țintă importantă a Cyclonilor, o navă de „Renaștere”.

Navele Galactica și Pegasus se lansează într-o luptă încrâncenată pentru a distruge nava „Renașterii” a Cyclonilor.

Misiunea președintelui Roslin de a pune capăt comerțului pe piața neagră declanșează un val de violențe și o investigație care pătrunde adânc în cercurile militare, civile și guvernamentale.

În timp ce nava de luptă Pegasus se confruntă cu o criză internă și cu o amenințare externă, campania de alegeri prezidențiale se rezumă la o dezbatere aprinsă pro-viață versus pro-moarte.

Descoperirea accidentală a unei planete locuibile înclină balanța alegerilor în favoarea lui Baltar, în timp ce misiunea de salvare a lui Starbuck pe Caprica întâmpină probleme neașteptate.

Laura trebuie să aleagă între a frauda alegerile și a-l lăsa pe Baltar să câștige.

Pe Noua Caprica, Tigh și alți insurgenți atacă Cyclonii și colaboratorii lor umani. Pe Galactica, Adama plănuiește o misiune de salvare.

În urma exodului de pe Noua Caprica se reglează conturi, cei care au luptat împotriva Cyclonilor căutând răzbunare, sau dreptate, împotriva celor care au colaborat cu aceștia.

Adama trebuie să se confrunte cu cea mai neagră perioadă din cariera sa militară când lt. Daniel Novacek, un pilot considerat ucis într-o misiune secretă cu ani în urmă, evadează din custodia Cyclonilor și ajunge pe Galactica.

Încarcerat și acuzat de trădare, fostul președinte Gaius Baltar supraviețuiește unei tentative de suicid doar pentru a fi supus unei tehnici extreme de interogare de către cei care-l țin captiv pe Galactica.

Kara Thrace, dura de pe Galactica, este pe punctul de a avea o cădere nervoasă în timp ce se luptă cu sechelele emoționale ale captivității sale pe Noua Caprica.

În timp ce procesul lui Gaius Baltar ia o turnură neașteptată după alta, o serie de coincidențe creează noi alianțe la bordul Galacticii.

După revelațiile neașteptate din episodul ce marchează jumătatea sezonului, flota și aliații Cycloni și-au unit forțele pentru a căuta, împreună, Pământul. Ei găsesc o planetă devastată, iar așteptările le sunt spulberate de evenimente cu efecte de-a lungul mileniilor. Kara „Starbuck” Thrace (Katee Sackhoff) află că sumbrele previziuni despre ea ale bătrânului hibrid „Razor” ar putea fi adevărate.

Tyrol se confruntă cu o criză atunci când Boomer este acuzat de trădare. Kara leagă o prietenie cu un carismatic pianist în barul lui Joe, care o ajută să se confrunte cu o realizare cutremurătoare despre destinul ei.

În timp ce Galactica este dezmembrată pentru piese, se face un apel la voluntari pentru o ultimă misiune.

Conflictul ajunge la un punct culminant, iar Cyclonii și omenirea se confruntă cu o alegere dură.