SD-6 se zmocní tajných kódů, ale ani Jack neví, k čemu doopravdy slouží. CIA odhalí, že jsou to kódy k ovládání jaderných hlavic, které byly před půl rokem ukradeny.

Sydney, Jack en Irina moeten hun meningsverschillen opzijzetten en zich voordoen als één blije familie om zes kernkoppen van een vijandig land in handen te krijgen. Sloanne vertelt de wantrouwige medewerkers dat Mr Sark bij SD-6 komt werken. Vaughn moet wellicht Will z'n onderzoeksopdracht voor de CIA afnemen. Sloane wordt benaderd door een onbekende groep die beweert dat Emily nog in leven is.

Sydney, Jack and Irina must put aside their differences and go undercover as a loving family in order to seize six nuclear warheads from an unfriendly nation. Meanwhile, Sloane announces to a suspicious staff that Mr. Sark will be working with SD-6, and later he is contacted by an unknown group claiming that Emily is still alive.

Sydney dit à Sark que s'il la dénonce, elle fera de même. Sark essaye de la rassurer, lui disant qu'il doit aussi se taire pour sa propre sécurité. Plus tard, Sydney, inquiète, demande à Irina si elle a dit à Sark qu'elle était un agent double. Irina lui assure qu'elle a su se taire mais que cela ne veut pas dire qu'elle n'est pas en danger ...

Sydney und Dixon erhalten den Auftrag, die Kommunikationscodes der usbekischen Bodentruppen zu beschaffen, bevor diese in die Hände tadschikischer Extremisten gelangen. Es stellt sich heraus, dass die Codes eigentlich Steuerungscodes für mobile Atomsprengköpfe sind, die von Rebellen im Kaschmir versteckt gehalten werden. Da nur Irina das Versteck kennt, wird sie für diese Mission aus der Haft entlassen und zusammen mit Jack und Sydney in die gefährliche Region geschickt …

סארק מוסר לסלואן צפני הפעלה ל-6 ראשי נפץ גרעיניים, הנמצאים בידי קבוצת טרור. סידני ואביה יוצאים לקשמיר כדי לחלץ משם את ראשי הנפץ, ואמה של סידני משוחררת מהכלא כדי לעזור להם.

A CIA kideríti, hogy Kasmírban nukleáris rakétafejek vannak, amik az SD-6 kezébe kerülhetnek. Egyetlen ember tudná elvezetni a csapatot a helyszínre: Irina Derevko. Jack, aki gyűlöli volt feleségét, úgy dönt, hogy elkíséri Sydneyt és Irinát Indiába. Irina nyakába egy robbanószerrel teli nyakéket tesz, amit ha megpróbál levenni, felrobban. Így akarja kizárni annak lehetőségét, hogy az asszony megszökhessen. Kasmírban a lázadók fogságába esnek, akik megölik az összekötőjüket. Jack, Irina, és Sydney magára marad...

Sydney, Jack e Irina devono fare la parte della famiglia felice in una missione sotto copertura avente lo scopo di sottrarre sei testate nucleari in mano ad una fazione nemica. Sloane ha deciso che Sark lavorerà per la SD-6. Vaughn allontana Will dalla sua ricerca. Emily Sloane potrebbe essere ancora viva.

시드니는 이리나에게 팀을 카슈미르로 안내하라고 설득한다.

La relación entre Sydney y Sark, ahora que éste es parte del SD-6 es tensa, pero ambos acuerdan que exponer la condición de traidora de Sydney les traería problemas a ambos. Irina, a su vez, asegura a su hija que nunca le dijo a Sark que era una doble agente. La tensión se palpa en el ambiente y los agentes del SD-6 no confían en Sark, a pesar de la aparente excelente relación entre Sloane y el nuevo recluta.

Irina solicita que la liberen de su confinamiento para acompañar a Sydney a su nueva misión encargada por el SD-6 pero la CIA rechaza su petición tajantemente. La misión consiste en recuperar una serie de claves de un grupo terrorista. Sloane y Sark acuerdan no revelar el uso de los códigos a Jack, ante el temor de que pueda influir negativamente en la actitud de su hija. La misión es un éxito.

Sloane recibe una misteriosa llamada donde se le chantajea: o entrega los números de cuentas del SD-6 o saldrán a la luz pruebas donde se le hace responsable de la muerte de Emily.

Will informa a Vaughn de los progresos de su investigación, pero es informado de que abandone la investigación a petición del director de la CIA ya que podría sacar a la luz ciertos elementos secretos sobre los que la CIA no quiere dar muchas explicaciones. Sin embargo, prosigue en privado su investigación y obtiene una lista con los mejores resultados para aquellos tests y se la facilita a Vaughn.

En la CIA descubren que los códigos secretos que recuperó Sydney están relacionados con la secuencia de lanzamiento de seis cabezas nucleares y que Sark los ha enviado secretamente a otro grupo terrorista desconocido, cuya localización descubren que está en Cachemira. Sydney decide que su compañera en esta misión debe de ser su propia madre y la CIA autoriza tal plan, pero Jack decide unirse al equipo también para vigilar a Irina, a la cual pone un collar con explosivos que no vacilará en detonar si trata de escapar. La familia de espías unida...

Tras un largo periplo hasta llegar a la India, la familia Bristow caen en una emboscada por parte de los terroristas a los que persiguen, pero logran zafarse gracias a la estrecha colaboración entre los tres. Perdidos en medio de la India, deciden ponerse en camino hasta llegar a un refugio de la CIA...