Sora versucht, sich durch Backen von Arins Aufgaben abzulenken, was ihr jedoch nicht gelingt. Ihre missglückten Versuche geben Zane einen Hinweis auf Arins Aufenthaltsort. Die Ninja stoßen bei ihrer Suche auf eine gruselige Puppe. Nya, Kai und Wyldfyre suchen nach Jay und alte Konflikte flammen wieder auf. Die Verbannten Fünf enthüllen die Quelle ihrer Kräfte.

Arin pflegt Ras, während er weiterhin trainiert. Die Ninja verfolgen ihre Spur und müssen sich an einer Höhle trennen. Lloyd, Frak, Sora und Riyu kämpfen sich durch eine gefährliche Höhle. Auf der anderen Seite helfen ihnen die freundlichen Dragonie-Stammesbewohner, doch ein alter Feind, der Zyklop, überrascht sie. Sora gelingt es jedoch, den Zyklopen zu überlisten und die gefangenen Mitglieder des Drachenjagdtrupps zu befreien.

Ras’ Verletzungen werden lebensbedrohlich und zwingen Arin zu einer gefährlichen Reise in die Geisterlande, um ein Heilelixier zu holen. Auf seiner Suche trifft Arin auf Morro, der ihm hilft, sicher durch das Geisterland zu gelangen. Währenddessen versucht Kai in Ninjago, Jay zurückzuholen, indem er dessen Schwäche ausnutzt, und die Verbannten Fünf gehen einen neuen Deal mit Donnerzahn ein.

Während Lloyd, Sora, Frak und Riyu in ihrer Suche nach Arin zunehmend frustriert werden, führt ihn Zanes parallele Reise zu einem anderen Kloster und seiner lang gesuchten Freundin P.I.X.A.L. . Gemeinsam setzten sie die Suche nach Jay fort und treffen dabei auf den räuberischen Rapton und seine Freibeuter:innen. Jedoch werden die Kontrahenten zur Zielscheibe von Nokt und der Dragonie, die sich um jeden Preis eine Prisma-Klinge holen wollen.

Die Stadt der Tempel wird von den Helfer:innen der Verbannten Fünf angegriffen, während Nya, Kai und Wyldfyre weiterhin nach den Prisma-Klingen suchen. Riyu führt seine Freund:innen Lloyd, Sora und Frak weit weg von Arin, was zu einer Begegnung mit Zarkt und der Dragonie führt. Mitten im Kampfgeschehen taucht Pixal auf und wendet das Blatt zugunsten der Ninja. Schließlich hält Ras sein Versprechen und bringt Arin zu seinen Eltern.

Während die Ninja weiterhin nach Arin und Jay suchen, greift Rox das neue Djinnjago an, um Arrakore zu zwingen, die zerbrochene Prismaklinge mit seiner Wunschmagie zu reparieren. Sora, Riyu und Nya werden in den Kampf hineingezogen, um den Dschinn zu beschützen und Rox aufzuhalten. Gleichzeitig nimmt ein mysteriöser Kopfgeldjäger den Auftrag an, Ras zu finden und zu fangen, der mit Arin die Verschmelzung rückgängig machen will.

Ras und Arin werden im Welten-Wald von einem Kopfgeldjäger angegriffen und getrennt. Ras entkommt, während Arin von Drachen gerettet wird, die nicht erkennen, dass Ras ihr alter Feind ist. Gemeinsam reisen sie zum Tempel der Drachenenergie, wo Ras den Geist des Tempels herausfordert, während die Ninja eine Prismaklinge verfolgen und Wyldfyre ihre Angst überwindet, um Roby zu heilen.

Die Ninja konfrontieren Arin im Beisein von Ras im Welten-Wald und zwingen ihn, sich zwischen Ras und seinem ehemaligen Meister Lloyd und seinen Freund*innen zu entscheiden. Dabei werden sie von Drix und der Dragonie überrascht und es kommt zum Kampf um die Prismaklingen. Ein Rückblick auf die ersten gemeinsamen Tage von Arin und Sora in Crossroads zeigt die Ursprünge ihrer Freundschaft und ihres Zusammenhalts.

Die Ninja kämpfen im Welten-Wald gegen die verbannten Fünf und verlieren. Diese machen sich auf den Weg zu Donnerzahn, doch die Ninja nutzen ein Portaltor und kommen vor ihnen an. Trotz der Überraschung gelingt es den Ninja nicht, die Prismaklingen zurückzugewinnen, und sie verlieren erneut. Die verbannten Fünf befreien Donnerzahn und fordern ihre Macht ein, werden jedoch von ihm verraten und ihrer Kraft beraubt.

Die Ninja kämpfen gegen Donnerzahn und die Winde des Chaos. Wyldfyre unterstützt ihre Freund:innen, während Donnerzahn Lloyds Seele stiehlt. Arin erkennt, dass Hoffnung wichtiger als Wut ist, und besiegt Donnerzahn mit einem Elixier aus dem Brunnen der Verlorenen. Arin und Sora schließen sich Ras an, der verspricht, Arins Eltern wiederzubeleben. Nya bringt den verletzten Jay ins Kloster, wo eine große Party den Sieg über Donnerzahn feiert.

Ras leads Arin and Sora into unexpected chaos in Mysterium while the Ninja recruit Jay for a special mission.

With Mysterium under attack, Ras, Arin and Sora rely on the Sorceress for help, while Jay leads the Ninja to the Administration on their way to Lee.

Lloyd, Jay, Nya and Wyldfyre go undercover in the strange Land of Lee, while Riyu's training under Rontu is off to a bumpy start.

The Underworld tests Arin and Sora's commitment to Ras, while Nya and Jay work together to expose Lee's secret.

Cole, Frak and Kai unearth a shocking discovery outside the Land of Lost Things, while the Ninja reunite to liberate Lee.

The Ninja escape Lee and head for the source of the threat, while Ras plans his next move.

In the City of Temples, the Ninja find guidance from an unlikely source, while Cole, Kai and Frak battle the Hollow Ones in Imperium.

The Ninja embark on their separate journeys to awaken the Arc Dragon of Focus but deal with unexpected - and annoying - interruptions.

The Ninja reach the Caves of Bells while Lloyd and Arin fight their way through the Spectral Lands to summon the Arc Dragon.

ThunderFang gathers the last of his power in the Spectral Lands and only the Ninja can stop him - but at what cost?