העונה השניה עוקבת אחרי מסעם של חבורת העבריינים הבורחים מפני החוק. שמונת האסירים הנמלטים מתמודדים עם מרדף חסר תקדים בהיקפו. כל אחד מהם מנסה למצוא מחסה מהמשטרה ולהתחיל בחיים חדשים.

לינקולן רוצה להבריח את אל-ג'יי מבית המשפט. טווינר מצליח לעלות לטרמפ לאריזונה. גם טי-באג נוסע בעצמו ליוטה. בליק מפוטר מעבודתו ויוצא לחפש את הנמלטים שהוכרז על ראשם פרס כספי גבוה.

מייקל לוקח את לינקולן לניקה כדי לטפל ברגל שלו ומגלה שהמכונית נפרצה והתרמיל עם הדרכונים נגנב. סי-נוט קובע עם אשתו פגישה. סוכרה מגלה שמריקרוז מתחתנת בעוד יומיים. קלרמן עוקב אחרי שרה.

בליק חוטף את מייקל, לינקולן וניקה. קלרמן מתקרב אל שרה. טווינר עושה חיים עם הבחורה שהציעה לו טרמפ ליוטה. אברוצי מתפתה לחסל חשבונות עם פיבנצ'י שבגד בו.

מייקל ולינקולן מגיעים ליוטה בעקבות הכסף של ווסטמורלנד ומגלים שהם לא היחידים בעקבות הכסף. סוכרה מגיע לווגאס. קלרמן בולש בביתה של שרה. הסוכן מהון מגלה עוד חלק בתוכניתו של מייקל.

מייקל והנמלטים מתחילים בעבודות החפירה בתקוה למצוא את הכסף של ווסטמורלנד. הייווייר עדיין חופשי. הסוכן מהון מרכז את מאמצי החיפוש ביוטה. המושל טנקרדי מגלה שנשקפת סכנה לבתו.

שוטרת מגיעה לבית בו נמצאים הנמלטים. לינקולן שומע בשורות על אל-ג'י ומקבל החלטה. שרה מקבלת חדשות רעות. הסוכן מהון לוחץ על טווינר.

סוכרה נמלט עם הכסף אך מצפה לו הפתעה. בליק יוצא בעקבות טי-באג. מהון נחקר ע"י חקירות פנים ושרה נמלטת על חייה.

מייקל חוקר אודות מהון ומגלה את סודותיו. סי-נוט מנסה להתאחד עם משפחתו כשהאף.בי.איי. בעקבותיו. טי-באג מבקש לנקום ב-"אהובתו" ומנסה להגיע אליה.

שרה מגיעה למקום בו מייקל צפוי לפגוש אותה אך מהון גם בדרכו לשם. סוכרה מגלה שמריקרוז נסעה למקסיקו. בליק וגירי ממשיכים במאמציהם לגלות את מיקומו של הכסף ואף טומנים מלכודת.

לינקולן עושה דרכו לפגישה עם מייקל. קלרמן מענה את שרה בנסיון לקבל תשובות לשאלותיו. קים משחרר את מהון שנכלא ע"י מייקל, ומאיים עליו. מייקל נתקל בקשיים באירגון הטיסה לפנמה.

קים מוציא חוזה על קלרמן. מייקל נזכר בפעם הקודמת שבה פגש את אביו. החבורה מצליחה להגיע לאתר נחיתת המטוס ושם מתקבלת החלטה גורלית. בליק נחקר בעניין רצח גירי.

מייקל ולינקולן נתפסים ומועברים בשיירה מאובטחת ל-"פוקס ריוור". קלרמן משכנע את קים שיש לו דרך לחסל את האחים. טי באג ממשיך לחפש את גב' הולנדר. בליק מואשם ברצח גירי.

מייקל ולינק מגיעים עם קלרמן לבית של סטדמן וקלרמן מסביר שסטדמן נעדר כל סימני זיהוי. טי-באג הופך את סוזן וילדיה לבני ערובה. אשתו של סי-נוט, נשפטת על סיוע לפושע. בראד מסתבך עם הבריון של הכלא.

מייקל, לינק וקלרמן חוטפים צלם טלוויזיה ומצלמים קלטת שבה הם חושפים את הקונספירציה סביב טרנס סטדמן. הקלטת ומעוררת דאגה גדולה אצל קים. הנשיאה מתקשרת לקלרמן. סוכרה ממשיך במסעו הארוך במקסיקו.

שרה פוגשת את מייקל ולינק ומגלה שקלרמן הוא השותף החדש שלהם. סי-נוט נקלע למסעדה כשמגיע אליה שודד. טי-באג מחליט לעבור עם המשפחה של סוזן למקום אחר. מהון מוציא את בליק מהכלא כדי שיעזור לו.

מייקל ושרה כמעט נתפסים במועדון הסיגרים אך מגלים שהנרי פופ, חבר במועדון. טי-באג נוסע עם סוזן ועם ילדיה לאלבמה, להקים לעצמו משפחה. בתו של סי-נוט חולה מאוד. סוכרה נפגש עם מריקרוז במקסיקו.

מהון שולח את בליק למקסיקו לתפוס את סוכרה. מייקל ולינקולן יוצרים קשר עם קופר גרין, איש "החברה" ששהם אמורים לתת לו את הקלטת שמנקה את לינקולן מאשמה. קים מודיע למהון שהוא צריך להיפטר מסי-נוט.

מייקל ולינק מפליגים לפנמה. סוכרה נאלץ לשתף עם בליק פעולה כי הוא אומר לו שכלא את מריקרוז בבור. וילר נותן לסי-נוט זהות בדויה תמורת עדות נגד מהון. סוכרה מודיע למייקל באינטרנט איפה טי-באג.

מייקל, סוכרה ובליק נפגשים ליד מלון "פין דל קמינו" כדי לתפוס את טי-באג, אך העניינים מסתבכים. לשרה נערך משפט ומוצעת לה עיסקת טיעון אכזרית.

סוכרה יוצא מביה"ח כדי לחפש את מריקרוז, פוגש את בליק ומנסה להוציא ממנו מידע. מייקל נותן למהון את האנייה. כשקים מגיע למחסן שבו כלא מהון את מייקל ואת לינק מתפתח קרב יריות.