Sur l'île de Hatsune-jima, 20 ans après qu'elle ait été connue pour ses cerisiers en fleurs éternels, les membres du club officiel du journal de l'Académie Kazami : Kiyotaka Yoshino, son cousin Charles Yoshino, son voisin Himeno Katsuragi, le président du club Ricca Morizono, Sara Rukawa, et Aoi Hinomoto décident que le thème de leur article sera "la magie" afin de battre leur rival, Suginami, le président du club de presse non officiel. Elles rendent visite au cerisier mort du parc Sakura, dont la rumeur dit qu'il était magique dans le passé. Lorsqu'ils font un vœu, le cerisier fleurit soudainement, à la grande surprise de tous.

Sakura se promène, confuse. Kiyotaka et son ami Kōsuke Edogawa discutent des filles. Ricca commence à enquêter sur le cerisier en fleurs. Charles tente de persuader Kiyotaka de lui préparer sa propre cuisine maison et y parvient peu après lorsque Kiyotaka promet de le faire. Cependant, il s'avère qu'Aoi a perdu ses clés pendant qu'ils recueillaient des informations, alors elle, Himeno, Sara et Kiyotaka se séparent pour les chercher. Heureusement, ils sont retrouvés, mais Kiyotaka a accidentellement rompu sa promesse avec Charles sans s'en rendre compte.

Kiyotaka rencontre la mystérieuse Sakura, qu'il sauve par hasard d'une chute et qu'il remercie par la suite. Il cherche dans les archives des phénomènes étranges des incidents qui se sont produits avant que les cerisiers en fleurs ne se fanent il y a 20 ans. Mikoto lui dit que le club officieux est également ancien. Le même jour, Kiyotaka et Sakura se rencontrent pour la troisième fois près du cerisier en fleurs. Kiyotaka l'aide à retrouver son chat perdu Utamaru, puis l'emmène dans une confiserie pour lui faire plaisir. Ils se rapprochent au fur et à mesure que la journée s'achève.

Kiyotaka est dans le bus avec Himeno, dans une atmosphère gênante depuis les événements du matin ; Kiyotaka est entré dans la chambre d'Himeno sans permission et l'a vue déshabillée, ce qui l'a rendue furieuse. Le bus s'arrête brusquement et Kiyotaka sauve Himeno de la chute, ce dont elle le remercie. Dans la salle du club, ils déchiffrent les informations qu'ils ont recueillies jusqu'à présent, ce qui les mène à l'ancienne directrice de l'Académie Kazami qui ressemble à Sakura disparue il y a 20 ans, à la grande surprise de Kiyotaka.

Ricca et Kiyotaka déjeunent ensemble dans la salle du club, ce qui suscite la jalousie de Kōsuke et des autres étudiants. Ricca lui dit que le peu de temps qu'il passe avec elle et celui qu'il passe avec les autres filles qui les assistent l'ennuient. Lorsque Suginami tente de convaincre Kiyotaka de partager et d'échanger des informations, Ricca intervient et lui dit qu'il doit battre le club officieux du journal. À la fin de la journée, Kiyotaka et Ricca font le tour de la ville en s'amusant à regarder du matériel et des vêtements magiques, et parlent de leurs vies passées comme des amoureux. Sakura est enfin présentée aux amis de Kiyotaka.

Les membres du club s'interrogent sur la parenté de Sakura avec Sakura Yoshino, mais ne sont pas sûrs de son âge. Kiyotaka remarque la fièvre d'Aoi et s'occupe d'elle pour la journée, y compris en changeant ses vêtements ! Le lendemain, Aoi est absente à l'école et Kiyotaka lui rend visite. Elle lui demande de la gâter une fois de plus en cuisinant et en couchant avec elle. En rentrant tard le matin sans prévenir, Himeno s'inquiète pour lui.

Tout le monde se rend dans une station balnéaire. Kiyotaka a gagné des billets à la loterie et invite même Sakura. Les filles essaient d'attirer l'attention de Kiyotaka en déterminant qui est le plus séduisant, mais Sakura ne cesse de l'éloigner. Il trouve également Mikoto, Kōsuke et sa sœur Shiki en train de les observer. Ils participent ensuite à un concours de maillots de bain organisé sur place. Sakura intervient lorsque Ricca perd accidentellement son haut.

Après que Kiyotaka et Kōsuke ont eu une conversation inconnue avec Suginami, Shiki et le conseil des élèves les saisissent pour les interroger. Shiki et le conseil des élèves les saisissent pour les interroger, mais Suginami réussit à libérer Kiyotaka d'une manière ou d'une autre. Après l'école, le conseil des élèves insiste encore pour que Kiyotaka parle et se lance à sa poursuite. Le lendemain, il accompagne Mikoto dans un parc d'attractions où les choses se déchaînent.

Kiyotaka rencontre Minatsu, Yuzu Kohinata (qui connaissait Nanaka Shirakawa) et Yuuhi Takanashi à l'agence de détectives Amakase. Il écoute leurs explications sur les robots, puis leur demande des précisions sur la magie des cerisiers en fleurs. Les membres du club poursuivent leur discussion sur la magie des cerisiers en fleurs. Kiyotaka montre aux agences l'étrange texto, apprend le passé de Minatsu et ses théories sur la magie.

Kiyotaka et Rikka rencontrent Sakura devant un cerisier qui ne meurt jamais. Au moment où Rikka le touche, un souvenir surgit dans l'esprit de Rikka et de Sakura. Le lendemain, une réunion a lieu dans la salle du club pour commencer à rédiger un article spécifique basé sur le contenu de l'interview. Cependant, Rikka n'est pas au mieux de sa forme et Kiyotaka la regarde avec inquiétude. Sur le chemin du retour, lorsqu'il parle à Rikka, elle lui dit qu'elle est troublée par les souvenirs des cerisiers en fleurs qui ne se faneront jamais, et qu'il doit en être de même pour Sakura.

Les membres du club du journal officiel sont soudain convoqués par Rikka. Sans en connaître la raison, ils marchent derrière elle le long des rangées de cerisiers, lorsqu'ils voient Sakura se tenir devant eux. En la voyant pour la première fois depuis longtemps, Kiyotaka et les autres sourient naturellement, mais Sakura leur demande de jouer avec elle pendant une journée, car elle a décidé de quitter l'île aujourd'hui. Ils furent surpris de cette demande soudaine, mais Rikka, qui était au courant, leur proposa de se faire de bons souvenirs tous ensemble à la fin de la journée. C'est ainsi que commence une longue journée pour le club du journal officiel et Sakura.

Après le départ de Sakura, tout le monde reçoit un message d'un expéditeur inconnu sur son téléphone portable. Le lendemain, le club du journal officiel tente de rédiger un article de fond pour le numéro consacré à la fête de fin d'études, mais en pensant à Sakura, ils décident de prendre une autre direction. Pendant ce temps, le conseil des élèves a également tenu une réunion sur la "fête de fin d'études", et les élèves de troisième année ont réalisé que la remise des diplômes approchait de plus en plus.