Liam e Hayden trovano un ragazzo di nome Alex, i cui genitori sono scomparsi. Ulteriori indagini rivelano che sono stati rapiti da un uomo a cavallo.

Corey scopre di poter vedere i Cavalieri fantasma dopo essere diventato invisibile e, assieme a Mason, assiste al rapimento di uno studente.

Un nuovo insegnante di fisica, il signor Douglas, si rivela più sinistro di quanto sembri. Il branco si raduna per tenere un amico al sicuro dai Cavalieri fantasma.

Lydia continua a cercare indizi che l'aiuteranno a trovare Stiles. Il branco adotta misure per proteggere tutti quelli che alla festa hanno visto il Cavaliere fantasma.

Stiles si ritrova intrappolato in una misteriosa stazione ferroviaria. Scott, Lydia e Malia scoprono la sua jeep nel parcheggio della scuola.

Scott, Lydia e Malia cercano indizi sui Cavalieri fantasma in una città abbandonata. Liam e Hayden escogitano un piano per combatterli.

Lydia inizia a sospettare che Claudia non sia quello che sembra. Il branco cattura un Cavaliere fantasma e cerca di interrogarlo.

Scott, Lydia e Malia decidono di attraversare il varco in un disperato tentativo di recuperare Stiles. Liam, Hayden e Mason fanno un accordo con Theo.

Lydia, Malia e Scott intensificano gli sforzi per recuperare Stiles. Nel frattempo, i Cavalieri fantasma continuano a provocare perdite.

Con il destino di Beacon Hills in bilico, Scott e il suo branco affrontano Douglas per la resa dei conti finale.

Un segugio infernale fugge da Eichen House per avvertire di un pericolo scatenato dal branco. Il nuovo consulente Monroe ha un programma segreto.

Scott e Malia cercano la consulenza di Chris per identificare un proiettile. Jordan s'imbatte in alcune difficoltà mentre indaga sulle origini del segugio infernale.

Scott, Lori e Malia inseguono Brett, che è ferito e tenta di sfuggire a una coppia di cacciatori. Chris e Melissa cercano d'identificare un cadavere.

La guerra incombe e Scott e Chris desiderano un incontro con il padre del secondo, Gerard, per negoziare la pace. Liam affronta una città in cui tutti sanno chi è.

Scott e il branco cercano di acquisire due nuovi licantropi rilasciati dalla polizia, ma si ritrovano con la stazione circondata dai cacciatori.

Theo e Liam attirano i cacciatori in uno zoo abbandonato. Il branco entra nell'arsenale di Gerard, ma la struttura è piena di trappole.

Jackson ed Ethan tornano da Londra, ma vengono catturati da Monroe. Scott e Malia cercano di reclutare un esercito per combattere Gerard.

Scott e Liam rintracciano il telefono di un primordiale morto. La storia tra Scott e Malia si fa seria. Gerard si allea con l'Anuk-Ite.

Gerard e Monroe armano la città di Beacon Hills, ma Scott è convinto che una guerra possa essere evitata distruggendo l'Anuk-Ite.

Gerard guida le forze per un attacco finale a Beacon Hills, spingendo Scott a compiere un sacrificio doloroso per salvare la città.