Dopo una violenta tempesta viene ritrovato sulla spiaggia, nei pressi del Centro Navale Sottomarino, il corpo di un uomo privo di sensi. Nonostante le immediate cure, l'uomo non sembra riprendersi e i medici non capiscono il perché. La biologa marina Elizabeth Merrill, dopo avere esaminato gli assurdi risultati delle analisi effettuate sul paziente, decide di fare un tentativo disperato. Con un'ambulanza trasporta l'uomo sulla spiaggia e lo immerge nell'oceano. Dopo pochi minuti quello strano essere si riprende e le tende la mano. La Dottoressa Merrill vorrebbe studiare più approfonditamente questa persona che può respirare sott'acqua e compete in velocità di nuoto con i delfini, ma il Ministero della Difesa pretende che Mark Harris, così è stato battezzato, si immerga senza indugi a grande profondità per scoprire la causa della sparizione di un sommergibile. Mark non è disposto a farsi dare degli ordini, ma accetta di fare un favore alla sua salvatrice...

Durante una gita in barca, tre sub vengono attirati sott'acqua e scompaiono. Dopo pochi giorni il più anziano dei tre viene ritrovato morto sulla spiaggia. Gli altri due, un uomo e una donna, si aggirano indisturbati per le strade della città, ma non hanno più nulla di umano. Fisicamente hanno le stesse caratteristiche di Mark Harris, le mani palmate e la capacità di respirare sott'acqua, ma se si stringono la mano emettono una forte scarica elettrica, capace di stordire o addirittura uccidere. L'incaricato della Sicurezza di Stato li considera una seria minaccia e li vuole rinchiudere, ma l'uomo di Atlantide insiste per potere conoscerli meglio, convinto che possano fare luce sulle sue origini...

Mentre si trovano a bordo del Cetaceo, il sottomarino della Fondazione per le Ricerche Oceaniche, Miller Simon e Elizabeth Merrill ricevono una richiesta di aiuto dalla NASA. Una sonda in fase di rientro dovrebbe ammarare proprio nella zona delle loro ricerche ed è molto importante che venga recuperata al più presto. Mark accetta di collaborare e riporta la sonda intatta a bordo del Cetaceo, ma da quel momento inizia a comportarsi stranamente. Maneggiando il delicato apparato della NASA è infatti venuto in contatto con alcune spore senzienti che si sono impadronite del suo corpo, cercando un mezzo per ritornare nello spazio. Sotto l'influsso di questi esseri, Mark fugge dal laboratorio e si dirige verso il deserto. Le spore infatti ignorano che Mark deve periodicamente tornare ad immergersi nell'acqua per non morire...

La Dottoressa Merrill viene rapita da Dick Redstone, un uomo che aveva dichiarato di avere una nave da donare alla Fondazione. Mark Harris assiste al rapimento, ma non riesce a salvare Elizabeth, anzi rischia di morire rinchiuso in un capanno per gli attrezzi e viene liberato appena in tempo dal Dottor Simon e da C.W. Crawford. Mentre gli amici cercano di rintracciarla, Elizabeth si trova in un laboratorio segreto sotto l'oceano, dove la scienziata Mary Smith sta per portare a termine un suo folle progetto. Convinta che la Terra sia ormai condannata, vuole emigrare su un altro pianeta per cominciare una vita nuova, portando con sé i migliori cervelli di tutta la Terra...