Rufy viene spedito da Orso su un'isola sconosciuta dove mangia dei funghi che gli fanno perdere i sensi e che in seguito crescono su tutto il suo corpo. Viene trovato da delle donne che lo prendono con loro e rimuovono i funghi dal suo corpo, per poi scoprire stupefatte che si tratta di un uomo, a differenza di tutte le abitanti dell'isola. Sull'isola di Amazon Lily, una legge in vigore da centinaia di anni vieta a qualunque uomo l'accesso.

Margaret rivela a Rufy che gli è impossibile fuggire con le sue sole forze in quanto Amazon Lily si trova in una fascia di bonaccia, così egli continua a scappare dalle Kuja per tutta l'isola. Il vice-ammiraglio della Marina Momonga, al largo di Amazon Lily, chiede alla Principessa Serpente, l'imperatrice pirata Boa Hancock, di rispettare i suoi impegni presi come membro della Flotta dei 7 e di recarsi a Marineford per l'imminente guerra contro Barbabianca dovuta all'esecuzione di Portuguese D. Ace, pena la sua espulsione dalla Flotta dei 7; Hancock, ostile al Governo mondiale, ma, al contempo, interessata alla sua carica di membro della Flotta dei 7, pietrifica, grazie al potere del frutto del diavolo Mero Mero, tutti i suoi uomini. Momonga l'avverte che aspetterà altri due giorni mentre la donna si prepara a sbarcare.

Boa Hancock fa ritorno al suo palazzo ad Amazon Lily. La vecchia Nyon, precedente imperatrice, cerca di convincere Hancock a rispondere alla chiamata della Marina in modo da preservare il trattato che li lega e proteggere la sua gente, ma la sovrana si rifiuta e la scaglia fuori da una finestra. L'imperatrice si appresta quindi a farsi un bagno ed ordina l'evacuazione del palazzo. Una bambina, incuriosita dall'evacuazione, ne chiede il motivo ad una piratessa che le spiega che, secondo una leggenda, Hancock e le sue sorelle, dopo aver sconfitto la gorgone, hanno ricevuto i suoi occhi sulla schiena, i quali causano la trasformazione in pietra di chiunque li veda. Rufy, in cerca di qualcuno che lo sappia riportare dai suoi compagni, irrompe nel palazzo e cade nella stanza da bagno. Il ragazzo scorge la schiena della donna e non solo non si trasforma in pietra, ma sembra riconoscere quello che vede.

Boa Hancock prova, senza successo, a tramutare in pietra Rufy che scambia il suo raggio Mero Mero per il raggio Noro Noro di Foxy. Il ragazzo prova a fuggire, ma viene catturato dalle piratesse Kuja e portato nell'arena delle esecuzioni. Margaret confessa di aver portato Rufy al villaggio ed Hancock trasforma lei e le sue compagne in pietra. Irato dalla mancanza di pietà delle amazzoni, il capitano prende a pugni Bacura, la pantera che avrebbe dovuto portare a termine la sua esecuzione. Le due sorelle minori di Hancock, Sandersonia e Marigold, saltano nell'arena e, utilizzando i poteri dei frutti del diavolo, si trasformano in serpenti e si preparano a battersi con Rufy.

Rufy porta in salvo Margaret e le sue amiche pietrificate ed inizia a battersi con Boa Sandersonia e Boa Marigold. Il capitano incontra grosse difficoltà nel contrastare i poteri dei frutti del diavolo e l'abilità delle sorelle di prevedere le sue mosse con l'uso dell'Ambizione. Quando Sandersonia prova a colpire Margaret nel tentativo di provocare Rufy, questo urla a squarciagola manifestando una particolare tipologia di Ambizione, costringendo l'avversaria a fermarsi e causando lo svenimento di molte delle amazzoni presenti nell'arena. Con Margaret fuori pericolo, Rufy si appresta a combattere alla massima potenza.

Rufy attiva il Gear Second e prende il vantaggio nello scontro. Nel disperato tentativo di finirlo, Sandersonia e Marigold tentano un attacco con le loro mosse più potenti, ma il ragazzo di gomma le respinge e lega insieme le loro code. Marigold brucia accidentalmente le vesti della sorella, costringendo Hancock ad ordinare a tutte di evacuare l'arena per non rischiare che qualcuna veda la schiena di Sandersonia. Rufy copre il simbolo sulla schiena dell'avversaria con il proprio corpo dicendo che, nonostante ella sia sua nemica, il suo segreto non ha niente a che fare con il loro combattimento. Questo gesto commuove la Principessa Serpente fino alle lacrime.

Sandersonia e Marigold concedono la vittoria a Rufy ed Hancock, per metterlo alla prova, gli permette di scegliere se prendere una nave o salvare Margaret e le sue compagne ed il capitano sceglie la seconda opzione. Il ragazzo viene condotto a palazzo dove la Principessa Serpente rimane molto colpita nell'apprendere del suo attacco ai danni dei Nobili mondiali. Hancock rivela che lei e le sue sorelle erano un tempo schiave dei Draghi Celesti e, per questo, hanno sopportato atroci sofferenze, portate a termine grazie all'intervento di Fisher Tiger, un uomo-pesce che attaccò Marijoa per liberare gli schiavi; in seguito, Tiger creò la ciurma dei pirati del Sole ed il marchio a fuoco dei Draghi Celesti, che anche Hancock e le sorelle hanno sulla schiena, venne mutato in un sole, come quello di Hacchan. L'imperatrice, dunque, concede a Rufy l'uso di una nave.

Rufy apprende da Nyon che Hancock fa parte della Flotta dei 7 e che lei e gli altri membri sono stati chiamati dalla Marina per fornire supporto nell'attacco a Barbabianca. Quando Cappello di Paglia scopre che suo fratello Ace sta per essere giustiziato a Marineford in modo da attirare allo scoperto Barbabianca, decide di andarlo a liberare dalla prigione di Impel Down dove è attualmente detenuto. L'unico modo per arrivare sul posto prima che suo fratello venga trasferito è che Hancock risponda alla convocazione e che Rufy si unisca a lei sulla sua nave della Marina. Tuttavia, l'imperatrice ha appena contratto una grave malattia e giace a letto morente.

Nyon scopre che la malattia di Hancock è la stessa che ha ucciso le due imperatrici prima di lei ed organizza un incontro tra lei e Rufy. Questi chiede ad Hancock di portarlo con sé ad Impel Down e, quando lei accetta, con grande sorpresa di tutti, Nyon capisce che la Principessa Serpente è innamorata del ragazzo. Hancock sale a bordo della nave di Momonga per rispondere alla chiamata della Marina, nascondendo Rufy sotto il suo vestito e, prima che la nave parta, de-pietrifica la ciurma. Altrove, Sengoku apprende che Jinbe, membro della Flotta dei 7, si rifiuta di combattere ed è attualmente detenuto ad Impel Down e che le 23 navi che stavano tenendo d'occhio la nave ammiraglia di Barbabianca sono state distrutte. Intanto, Garp fa visita ad Ace in prigione.

Mentre Rufy ed Hancock sono a bordo della nave della Marina diretta alla prigione, viene mostrato cosa è successo agli altri protagonisti dopo gli avvenimenti alle Sabaody. Nami è stata scagliata su un'isola nel cielo, Weatheria, dove un signore anziano la ospita; questi studia la scienza meteorologica ed ha sviluppato diversi congegni che mostra anche alla ragazza: con l'aiuto di questi e del suo bastone, Nami riesce a fermare una tempesta. Franky è finito nell'isola invernale della Rotta Maggiore Karakuri, luogo di nascita di un certo genio; qui stringe amicizia con un bambino che, inizialmente, balla con lui e, in seguito, lo accompagna all'ospedale per curare il suo congelamento.

Chopper atterra su un'isola nel Regno Torino, sul nido di due uccelli giganti che, dopo averci giocato un po', lo fanno cadere accidentalmente di sotto. Mentre è alla ricerca di cibo per rimettersi in forze, alcuni abitanti dell'isola lo catturano. Quando questi si distraggono per sfuggire ad un uccello, nel nido del quale avevano tentato di intrufolarsi, Chopper fugge e capisce che sono gli uccelli i veri padroni dell'isola. Sanji si ritrova sull'isola Momoiro che è apparentemente popolata per intero da donne bellissime ed Elizabeth, una di queste, lo accudisce fino a che non si riprende. Quando il cuoco si reca a casa di Elizabeth per restituirle un fazzoletto, si rende conto che questi è un travestito e comincia a scappare per tutta l'isola mentre gli abitanti lo inseguono per cercare di farlo vestire da donna.

Nico Robin si ritrova a Tequila Wolf, un luogo innevato. Le viene offerto rifugio da Soran, una giovane schiava, con la quale discute del resto del mondo che la ragazza finge di visitare attraverso i suoi disegni. Alcuni soldati fanno irruzione nel rifugio alla ricerca di Robin, distruggendo i disegni e catturando la piratessa. La ragazza apprende di trovarsi su un'isola popolata da prigionieri e cittadini di paesi che si sono rifiutati di obbedire al Governo mondiale e che vengono costretti a costruire un ponte. Intanto, Usop atterra su Greenstone, un'isola piena di piante cannibali ed insetti giganti dove incontra un uomo di nome Heracles.

Roronoa Zoro atterra su Kuraigana, la stessa isola dove Orso Bartholomew ha spedito Perona da Thriller Bark. La ragazza cura il pirata, ma lo tiene prigioniero e gli impone un trattamento umiliante. Brook si ritrova sull'isola di Namakura dove viene scambiato per un demone essendo apparso durante un rituale che gli abitanti dell'isola stavano svolgendo allo scopo di vendicarsi della tribù Braccia-Lunghe. Intanto, numerosi ufficiali di fama mondiale si riuniscono presso il Quartier Generale della Marina, così come i membri della Flotta dei 7 ad eccezione di Hancock e Jinbe. Ad Impel Down, Ace implora Garp di ucciderlo, ma il vecchio si rifiuta dicendo che, anche se lo facesse, la guerra con Barbabianca sarebbe inevitabile.