סנסיי וו ריכז ארבעה תלמידי אמנות ה"ספינג'יצו" והפקיד בידיהם ארבעה כלי נשק עתיקים. הוא הטיל עליהם משימה לשמור על כלי הנשק מפני "הזוחלים", נחשי אדם קדמונים שנכלאו בעומק האדמה בעת הקדומה, וכעת הם שוחררו מכלאם.

שיין מוביל את חבריו אל מפקדת הנחשים ביער, אבל בינתיים הנחשים שורפים את המנזר. עליהם למצוא להם בית חדש.

לויד מוביל את נחשי פנגפייר למתקפה על הוריו של ג'יי. לוחמי הנינג'ה באים לביקור ברגע האחרון להצלתם.

אחרי ששני שבטי נחשים בגדו בלויד, הוא פונה אל נחש קדמון אחר, האנקונדה, כדי שיעזור לו לנקום בכל אויביו. ארבעת הנינג'ות צריכים לפתור חידה של הסנסיי.

פייתור, הנחש הקדמון, מנסה לאחד את חמשת שבטי הנחשים כדי להשתלט על ארץ נינג'אגו. הנינג'ות יוצאים לעצור בעדו ונופלים למלכודות של הנחשים.

שיין עוקב אחר הבז ומגלה את האמת על עברו. סנסיי שותה את "תה הנוודים" שהשותים ממנו אינם שבים לעולם.

ג'יי נדקר מניב של נחש קדמון והופך לנחש. הוא לא מגלה זאת כדי לא להרוס את הפגישה עם ניה, שמנסה גם היא לשמור על הסוד שלה.

הכסף השני הפך לגביע נודד בתחרות כישרונות צעירים בעיר הולדתו של קול. קול צריך להתמודד עם עברו ועם אביו כדי לזכות בגביע, וחבריו עוזרים לו.

קאי משתוקק להיות הנינג'ה הירוק וחושב שאם הוא יגבר על לורד גרמאדון משאלתו תתגשם.

לוחמי הנינג'ה נופלים למלכודת של פייתור, ורק אומץ לבו של לויד ונאמנותו של אביו מצילים אותם.

פייתור מצליח לגנוב את ארבעת הלהבים ולהביא אותם לעיר בורה -בורה. האם האגדה נכונה, והטירוף הגדול אכן יתעורר?

הטורף הגדול מגיע לעיר נינג'אגו-סיטי ולוחמי הנינג'ה יוצאים לקרב של הכול או לא כלום.