A második évad megdöbbentő fináléját követően Hannibal pszichiáterével, Bedelia Du Maurierrel Európába szökik az FBI elől. Dr. Lecter étvágya azonban az új körülmények között sem csillapodik. A gourmet pszichopata végül új álnévvel Firenzében telepszik le, és munkát vállal a Palazzo Capponi múzeumnál. Úgy tűnik, Hannibal elégedett új életével, ám mégsem tud ellenállni a kísértésnek, hogy Valentin napra üdvözlőkártyát küldjön Will Grahamnek.

Nyolc hónap telt el a második évad véráztatta fináléja óta. Will Graham sebei begyógyultak, ám lelke bosszúra szomjazik. Európába utazik, hogy végleg leszámoljon ellenfelével. Megérzéseit követve Olaszországba megy, ahol felkeresi a palermói Norman kápolnát. Ösztönei nem hagyták cserben: a kápolnában egy neki címzett, Valentin napi kártya várja Hannibal Lectertől. Will érkezése felkelti a helyi nyomozó, Rinaldo Pazzi érdeklődését. Rinaldo húsz évvel korábban egy Il Mostro néven emlegetett firenzei gyilkos után nyomozott, a gyilkos azonban túljárt az eszén. Miután a nyomozó áttekinti Will anyagát, rádöbben, hogy a fiú ádáz ellensége, Hannibal, nem lehet más, mint maga Il Mostro. Rinaldo megkéri Willt, hogy segítsen elkapni Il Mostrót, ám Will óva inti a férfit, mert valójában még ő maga sem tudja, hányadán is áll Lecterrel.

Will Graham továbbra is Hannibal Lecter után nyomoz. Ellátogat Hannibal szülőhelyére, a litvániai Lecter kastélyba, ahol érdekes titkokat tud meg. Eközben Jack Crawford Olaszországba utazik, hogy Willt megvédje egy újabb tragédiától.

Dr. Frederick Chilton túlélte a pisztolylövést, amelyet Miriam Lass adott le rá. A férfi hosszú lábadozás után felépül. Frederick bosszút akar állni Hannibalon, és tervéhez Will Grahamet akarja felhasználni csalinak. Eközben Jack igyekszik meggyőzni Willt, hogy hagyjon fel Hannibal keresésével - a vállalkozás szerinte túl veszélyes.

Jack Crawford és Pazzi nyomozó Hannibal firenzei tartózkodási helyét igyekeznek lenyomozni. Hamarosan Will és Chiyoh is megérkeznek Firenzébe, hogy elkapják Lectert. Hannibalt azonban nem lehet olyan egyszerűen fülön csípni.

Hannibal és Bedelia Du Maurier csomagolnak, hogy hátuk mögött hagyják Firenzét, ahol már forró a lábuk alatt a talaj. Hannibal grandiózus távozást tervez. Eközben Will és Jack megújítják szövetségüket, hogy együtt csípjék nyakon Lectert. Jack azonban még mindig nem biztos benne, hogy Will valójában melyik oldalon áll.

Mason Verger parancsára a rendőrség Olaszországban elfogja Willt és Hannibalt, és a Muskrat Farmra szállítják őket. Úgy tűnik, Mason Verger végre bosszút állhat. Eközben Alana tervet eszel ki Will és Hannibal megmentésére.

Három év telt el az előző epizód óta. Miután Hannibalt elmebetegnek nyilvánították, a Baltimore-i pszichiátrián tarják szigorú őrizetben. Eközben Crawford egy olyan sorozatgyilkos után nyomoz, aki teliholdkor lép akcióba és családokat gyilkol. Crawford nehezen boldogul az esettel, és felkeresi Will Grahamet, hogy a segítségét kérje. Will jelenleg új feleségével és annak tízéves kislányával él együtt. Fájdalmas múltjával a háta mögött nem akar ismét a terepen dolgozni, ám végül mégis elvállalja a munkát.

Will rendszeresen eljár Hannibalhoz az elmegyógyintézetbe, hogy megbeszélje vele a sorozatgyilkos Francis Dolarhyde esetét. Alana Bloom figyelmezteti Willt, hogy legutóbbi együttműködésük tragédiába torkollott, de Will úgy érzi nincs más választása, együtt kell működnie Lecterrel.

A rendőrség a Dolarhyde-nak tulajdonított gyilkosságok helyszínén rendre egy-egy hatalmas vörös sárkányt ábrázoló képet talál. Az ábra segítségével Will fokozatosan közelebb kerül a sorozatgyilkos elborult elméjének megértéséhez. Eközben Dolarhyde-nak sikerül kapcsolatba lépnie Hannibal Lecterrel, és beszámol neki fantasztikus átalakulásáról.

Will Graham és Jack Crawford biztosra veszik, hogy a legközelebbi teliholdnál Francis Dolarhyde ismét gyilkolni fog, azt azonban még nem tudják, hogy melyik család lesz a következő áldozat. Alana Bloom szerint Hannibal Lecter elvezethetné őket a Vörös Sárkányhoz, ezért üzletet ajánl a sorozatgyilkosnak.

Will Graham és az FBI felkéri Dr. Frederick Chiltont, hogy segítsen Francis Dolarhyde-ot tőrbe csalni. A nyomozás során azonban Will érzékeny elméjét egyre jobban megviseli, hogy Dolarhyde borzasztó élményeit újra és újra át kell élnie.

Will Graham ravasz tervet eszel ki, hogy Hannibal Lectert felhasználva elkapja Francis Dolarhyde-ot. Bedelia DuMauriert nem helyesli a tervet, amely szerinte nem csak Willt, de a körülötte lévő embereket is veszélybe sodorhatja. Grahamet azonban nem lehet szándékától eltántorítani.