Фокс Малдер и Дана Скалли связываются с Тэдом О'Мэлли, ведущим популярного конспирологического интернет-шоу, который считает, что раскрыл большой правительственный заговор. С помощью заместителя директора ФБР Уолтера Скиннера, О'Мэлли хочет заручиться поддержкой бывших агентов Секретных материалов Малдера и Скалли, которые с тех пор разорвали отношения с ФБР. Через О'Мэлли они знакомятся со Светой, возможной жертвой похищения инопланетянами, которая делится шокирующей информацией, оспаривающей все, во что Малдер когда-либо верил о существовании инопланетян и роли правительства в их сокрытии.

Учёный, работающий на Министерство обороны США, неожиданно совершает самоубийство. В ходе расследования Малдер и Скалли находят секретную лабораторию, где уже на протяжении десятилетий изучают детей с генетическими заболеваниями.

Когда в лесу находят мертвое тело, Малдер и Скалли проводят расследование, было ли это нападение животного, серийного убийцы или может быть странного существа, которое описали очевидцы. Тем временем, Малдер противостоит своим собственным демонам в чувстве разочарования в деле всей своей жизни.

Малдер и Скалли отправляются на расследование убийства городского чиновника, которое вряд ли мог бы совершить человек. Тем временем, Скалли сталкивается с личной трагедией, которая возвращает былые чувства к ребенку, которого она отдала на усыновление.

Когда взрывают художественную галерею, которая выставляет потенциально нежелательное искусство, Малдер и Скалли ищут какой-то способ общения с подрывником, находящимся в коматозном состоянии, с целью предотвращения будущих атак. Между тем, пара молодых агентов ФБР ведущих дело, давит на Малдера и Скалли, чтобы проверить свои собственные убеждения, поскольку Скалли ищет ответы в неврологии, а Малдер в мистике.

Расследование, которое Малдер и Скалли начали со сторонником теории заговора и ведущим веб-ТВ-шоу Тэдом О`Мэлли, кажется, пробудило могущественных врагов. Распространяется паника, когда люди по всей стране начинают тяжело заболевать, и Скалли должна попытаться найти лекарство. Тем временем, Малдер сталкивается с человеком, который, как он считает, стоит за всем этим, но другая фигура из прошлого Малдера и Скалли может оказаться ключом к их спасению.