Captain Rex und die Kloneinheit 99 müssen eine gegnerische Basis auf Anaxes infiltrieren.

Anakin Skywalker, Rex und die Kloneinheit 99 machen eine schockierende Entdeckung auf Skako Minor.

Jedi Anakin Skywalker und einige Klone entkommen einer Falle Wat Tambors und helfen einem örtlichen Dorf, sich gegen einen Angriff des separatistischen Admirals Trench zu verteidigen.

Während Jedi Mace Windu und Obi-Wan Kenobi einen Angriff gegen die separatistischen Streitkräfte auf Anaxes führen, infiltrieren die Kloneinheit 99 und Anakin Skywalker ein feindliches Raumschiff, um den Sieg der Republik zu sichern.

Nachdem sie den Jedi-Orden verlassen hat, findet sich Ahsoka Tano in der Unterwelt von Coruscant wieder, wo sie sich mit dem aufstrebenden Piloten Trace Martez anfreundet. Von Traces Schwester Rafa angeworben, um beim Bau gefährlicher Droiden zu helfen, beschließt Ahsoka, ihre Jedi-Vergangenheit geheim zu halten.

Trace trifft eine überstürzte Entscheidung, nachdem sie erfahren hat, dass sie mit ihrem Auftrag dem Pyke-Syndikat helfen würde.

Von den Pykes gefangen genommen, versuchen Ahsoka und die Martez-Schwestern zu fliehen.

Ahsoka feilscht um die Freiheit der Schwestern und macht eine verblüffende Entdeckung.

Anakin und Obi-Wan müssen sich entscheiden, ob sie Ahsoka bei der Verfolgung Darth Mauls oder bei der Rettung Palpatines helfen wollen.

Ahsoka und die Streitkräfte der Republik konfrontieren Darth Maul auf Mandalore.

Nachdem sie Maul auf Mandalore gefangen genommen hat, wird Ahsokas Reise zum Rat der Jedi unterbrochen, als die Order 66 ausgerufen wird, wodurch ihre Welt auf den Kopf gestellt wird.

Ahsoka und Rex müssen ihre Scharfsinnigkeit und Fähigkeiten einsetzen, um das turbulente Ende der Klonkriege zu überleben.