يبدو أن سيون البالغ من العمر 12 عامًا له مستقبل مشرق كمواطن مختار من نخبة المجتمع المثالي في المدينة رقم 6 ، حتى قرر توفير المأوى لـنيزومي أثناء إعصار حتى بعد علمه بأنه هارب مطلوب.

بعد إيواء أحد الهاربين، يجرد سيون من امتيازات مواطنة النخبة وإجباره على العيش في الضواحي مع والدته. بعد أربع سنوات ، أثناء عمله في مركز التخلص من النفايات، اكتشف طفيل غامض يجعل الناس يكبرون ويموتون في ثوانٍ. بعدها استجوبته سلطة المدينة مرة أخرى وقبض عليه، ولكن أنقذه نيزومي وأظهر له ما يكمن حقًا خارج أسوار رقم 6.

بعد فترة وجيزة من هروب سيون من المنطقة رقم 6، اكتشف سيون أنه مصاب أيضًا. يستخرج نيزومي الطفيلي من جسد سيون ويبقى على قيد الحياة ، ولكن مع بعض الآثار الجانبية.

بعد تعليمات والدة سيون، يقوم سيون ونيزومي بزيارة إلى ريكيغا، وهو صديق قديم لوالدة سيون. يعرض ريكيغا رعاية سيون، لكن يغضب سيون منه عندما يطلب من نيزومي أن يعمل لديه كعاهرة ويغادر.

امرأة في المنطقة رقم 6 كبرت فجأة وتوفيت. يسمع سيون عن هذا الأمر من ريكيغا ويتسابق إلى المسرح حيث كان نيزومي يؤدي مسرحية لإبلاغه بالأخبار.

عادت سافو إلى المنطقة رقم 6 بسبب وفاة جداتها. أثناء عودتها علمت بما حدث لسيون. في الوقت نفسه يواصل سيون ونيزومي مناقشتهما حول مستقبل المنطقة رقم 6 والنحل الطفيلي.

Nezumi leads Sion to the edges of the Western District to seek information from a legless old man belonging from No.6's past. Safu finds herself to be a sample of research at the correctional facility.

With Rikiga's help, Sion and Nezumi are able to extract information on the correctional facility from a top No. 6 official. Upon learning that infiltration will be more difficult than they expected, they struggle to devise a plan just as Holy Day comes around. Yoming reveals his plans for the future to Karan. Safu encounters an unexpected powerful entity that helps her gain consciousness.

The plan to rescue Safu is going as expected. But the further Sion and Nezumi go inside the facility, Sion’s attitude changes dramatically.

Sion and Nezumi have overcome many difficulties to reach Safu. However, Safu has now merged with Elyurias. Meanwhile, the people gathered to celebrate the Holy Day have been attacked by a large number of parasite bees. Will No. 6 survive? And what will be the fate of Sion and Nezumi?