Als Facharzt, wie J.D. sich seit Kurzem nennen darf, steht er nun auf der gleichen Stufe wie Dr. Cox, was der natürlich nicht akzeptieren will und sich weiterhin bei jeder Gelegenheit über ihn lustig macht. Erst als J.D. es wagt, sich im Interesse eines Patienten mit Dr. Kelso anzulegen, erkennt Dr. Cox, dass er 'Flachzange' Unrecht tut.

Ahora un médico de cabecera, J.D. tiene que tratar con sus propios interinos bajo la supervisión del Dr. Cox whether he's still willing to bend the rules despite more responsibility. Turk duda si dejar emabarazada a Carla. Mientras tanto, Elliot empieza sus amistades en County Hospital e intenta no parecer loca.

Attending at Sacred Heart, J.D. now has to deal with his own interns. Turk has doubts having children, then tries to prevent Carla from getting pregnant. Meanwhile Elliot struggles to find her way at County Hospital and doesn't want to seem like the helpless person she was before.

J.D. trasloca momentaneamente in hotel perché il suo nuovo appartamento ha il soffitto sfondato. Turk però non accetta che il suo miglior amico sia costretto a vivere in un albergo e lo invita a dormire a casa sua, ma all'insaputa di Carla. J.D. è ora diventato medico di ruolo come il dottor Cox e quindi deve istruire a sua volta degli specializzandi. Elliot cerca invece di ambientarsi nel nuovo ospedale dove ha ottenuto una borsa di studio e comincia a fare amicizia con infermiere e dottoresse. Turk nel frattempo cerca di convincere Carla a non avere un bambino perché crede che sia ancora troppo presto, ma Carla non gli dà ascolto. Elliot non conosce ancora bene il nuovo ospedale e non sa dove si trovano le cose, ma non volendo sfigurare ruba quello che le serve dal Sacro Cuore. Cox dà cinque carte "Man" ("Uomo") a J.D. e se ne riprende una ogni volta che quest'ultimo si comporta come una donna. J.D. perde presto tutti e cinque i foglietti, ma alla fine della giornata riesce a salvare un paziente infrangendo le regole e se ne prende la responsabilità, guadagnandosi la stima di Cox. Kelso invece è frustrato perché ha scoperto che J.D. si è alleato con Cox ed è arrabbiato con Elliot che, dopo essere stata formata come medico al Sacro Cuore, lo ha abbandonato.

Jako lekarz prowadzący, J.D. musi radzić sobie ze swoimi stażystami. Turk ma wątpliwości co do posiadania dzieci, po czym próbuje zapobiec ciąży Carli. Elliot stara się odnaleźć w nowym szpitalu, nie chcąc wyjść na bezradną osobę, którą kiedyś była.

Po atestaci má JD potíže s rozhodováním a odpovědností, kterou nyní nese. Dr. Cox přitom stále zkouší jeho schopnosti.

Теперь Джей Ди лечащий врач и он вынужден работать со своими собственными стажёрами, в то время как доктор Кокс проверяет собирается ли он подчиняться правилам, несмотря на возросшую ответственность. Тёрк колеблется по поводу идеи Карлы завести ребенка. Тем временем Элиот начинает свою работу в окружной клинике и старается не выглядеть глупой.

Nu när JD är överläkare måste han ha hand om egna AT-läkare. Turk känner sig osäker på om han vill ha barn och försöker hindra Carla från att bli gravid. Elliot försöker finna sig tillrätta på County Hospital.

לג'יי-די יש עכשיו מתמחים משלו. לטורק יש ספקות בנוגע לילדים, והוא מנסה למנוע את ההריון של קרלה. אליוט נאבקת למציאת מקומה בבי"ח קאונטי, ולא רוצה להיראות חסרת ישע כבעבר.

JD est maintenant médecin titulaire et goûte à ses nouvelles responsabilités en accueillant ses internes en chef sympa, mais le docteur Cox encourage ces derniers à lui désobéir. Dans un autre hôpital, Elliott tente de s'acclimater mais ne peut s'empêcher de revenir au Sacré-Cœur. Pendant ce temps, Carla essaie d'avoir un enfant avec Turk...

J.D. heeft nu een volledige baan als dokter bij Sacred Heart en krijgt dus zijn eigen stagiaires. Turk weet niet of hij kinderen wil en probeert ervoor te zorgen dat Carla niet zwanger wordt. Elliot heeft het moeilijk in het Country Hospital, haar nieuwe werkplek.