Après avoir parcouru l'Europe tout l'été, Rory et Lorelai préparent la rentrée universitaire de Rory.

Rory s'installe dans sa nouvelle chambre où elle fait la connaissance d'une étrange camarade ainsi que de sa nouvelle colocataire.

Emily décide de redécorer la chambre de Rory sans sa permission, pendant que Lorelai et Sookie organisent une fête d'anniversaire sur le thème du Seigneur des anneaux.

De retour à Stars Hollow pour le week-end, Rory tombe sur son ex-petit ami Dean qui, gêné, l'invite à un grand évènement organisé le lendemain.

Lorelai tente de cacher les détails de sa vie à Emily. Rory découvre que la vie amoureuse se complique à l’université. Lorelai invite Luke à voir un film.

Emily met la fiabilité de Lorelai et Sookie à rude épreuve en leur demandant d'assurer le service lors de la fête de lancement de la nouvelle entreprise de Richard.

Affublées de leurs plus beaux costumes, Rory et Lorelai participent au festival d'arts de la ville en tentant de mettre en scène des tableaux célèbres.

À Yale, Rory adopte une nouvelle approche journalistique, tandis que Luke avoue à Lorelai qu'il essaye de raviver une ancienne flamme.

Alors qu'Emily fait une découverte bouleversante au sujet des fréquentations de son mari, Lorelai accepte une invitation à dîner.

Lorelai et Sookie décident de rénover l'auberge. Pendant que Lorelai profite d'une soirée romantique, Rory a du mal à accepter la nouvelle relation de Paris.

Lorelai est bouleversée d'apprendre que Luke a pris un appartement dans une autre ville. Quant à Rory, elle apprend que de fausses rumeurs circulent à son sujet.

La sœur de Luke débarque en ville. Lorelai hésite à parler de son nouveau petit ami à ses parents. La liaison de Paris se transforme en relation.

Jess croise Rory à plusieurs reprises à Stars Hollow. De passage en ville, la sœur de Luke lui présente son nouveau petit ami.

Accablée par des montagnes de travail pour l'école, Rory se confie à Dean qui prépare le chantier du Dragonfly.

Après avoir entrevu la nouvelle vie de Dean, Rory passe la journée au centre commercial avec Lorelai, où elles croisent Emily en pleine fièvre acheteuse.

Richard est dévasté par l'annonce d'un décès brutal. Emily accuse le coup après avoir mis la main sur une vieille lettre adressée à son mari.

Jason et Richard ont des comptes à rendre devant la justice. Rory est bouleversée par la décision de Dean qui a été prié de ne plus la voir.

Apprenant que Richard a rompu son engagement commercial, Lorelai monte au créneau. Luke s'ouvre sur sa vie sentimentale auprès de Lorelai.

Luke, déprimé, pense enfin avoir trouvé l'âme sœur. Quant à Lorelai, elle s'affaire à quelques jours de l'inauguration de son auberge.

Jess conduit sa mère à l'autel lors d'un mariage sur le thème de la Renaissance. Luke saute le pas avec son nouveau flirt. Dean se confie à Rory.

Courtisée par deux prétendants à la fois, Lorelai invite sa famille et ses amis à l'auberge avant la grande ouverture de son établissement au public.