Mentre la peste dilaga nel paese, Francesco parte in cerca di Lola e del figlio e Maria e Caterina cercano di sfuggire alla morte.

Diminuito il pericolo della peste, Francesco ritorna a casa con Lola e il figlio, creando tensioni con Maria. Un potente signore rinfaccia a Maria la morte del figlio.

Mentre la Francia è flagellata dalla carestia successiva alla peste, Maria cerca in tutti i modi di sfamare il popolo. Intanto Caterina fa progetti per l'incoronazione.

Mentre Francesco organizza il battesimo del figlio, Maria e Lola fanno fronte comune per aiutare una donna in difficoltà. La regina riceve notizie importanti.

La vigilia del matrimonio di Greer è macchiata da uno spargimento di sangue. Francesco cerca di nascondere a Maria il suo passato e teme che il segreto lo distruggerà.

La rivolta contadina spinge Maria e Caterina nella foresta, mentre Francesco è sulle loro tracce. Intanto Lola e Narcisse cedono al desiderio.

La figlia di Caterina si ritrova rivale inaspettata di Kenna e Narcisse fa pressioni su Francesco perché accantoni i problemi di coscienza per non rischiare il trono.

Lo scontro tra protestanti e cattolici si accende dopo le richieste di un emissario del Vaticano. Intanto Claudia sospetta che Caterina voglia eliminarla.

Mentre impazza la violenza tra protestanti e cattolici, Maria cerca una soluzione che avvicini le due fazioni e risolva il problema posto dal matrimonio di Claudia.

Francesco è attanagliato dal senso di colpa per l'aggressione a Maria e giura di trovare gli assalitori. Durante la notte Caterina riceve una visita inaspettata.

Maria e Condé cercano di sfuggire agli inquisitori del Vaticano, mentre Kenna prova a spiegare alla principessa Claudia il comportamento pazzoide e violento di Caterina.

La rivalità tra Condé e Francesco per Maria si fa sempre più intensa. Dopo il confronto con Claudia, Caterina in preda alle allucinazioni pensa al suicidio.

È la festa di Pentecoste e Francesco spera in una riconciliazione con Maria, mentre Caterina scopre la verità sulle sue allucinazioni.

Maria e Francesco vengono a conoscenza del legame tra Enrico e la "pazzia" di Caterina. La visita di uno dei corteggiatori di Caterina fa ingelosire Narcisse.

La madre di Maria la mette in guardia dal vivere separata da Francesco, mentre quest'ultimo desidera che il figlio si leghi per matrimonio a una famiglia potente.

Antonio minaccia di rivelare a Francesco la relazione che sta nascendo tra Maria e Condé. Intanto Bash smaschera il piano di Kenna, mettendo fine al loro matrimonio.

Caterina fa visita a Francesco per rivelargli la relazione tra Maria e Condé, ma Francesco si sente male e perde i sensi; Leith diventa la guardia personale di Claudia.

Pur essendo grata a Francesco per aver salvato la Scozia, Maria rifiuta di lasciare Condé. A seguito di una minaccia terroristica, Maria e Francesco si riavvicinano.

Francesco è sempre più risoluto a distruggere Condé per l'alleanza tra questi e l'Inghilterra. Caterina chiede a Narcisse di provare la sua devozione, tradendo Lola.

Mentre il piano di Condé di occupare il castello si concretizza, Maria rischia la vita per avvertire Francesco. Intanto Narcisse è vittima della gelosia di Caterina.

Maria decide di sedare la rivolta di Condé, Caterina coinvolge la regina Elisabetta per rovinare Maria, mentre il segreto di Kenna decide la sua sorte e quella di Bash.