Nel 2552, gli umani sul pianeta Madrigal lottano per l'indipendenza dalla Terra, ma un fatale incontro con gli alieni Covenant fa cambiare tutto.

John porta Kwan da un vecchio amico e scopre di più sull'oggetto misterioso. Halsey ha un piano.

John conosce il suo nuovo partner e scopre dei segreti nascosti nella sua memoria. Kwan vuole tornare su Madrigal per continuare la lotta per l'indipendenza, ma Soren ha altri piani per lei.

Guidato dalle sue visioni, John porta Halsey e Cortana dove è cominciato tutto, alla ricerca di risposte nel suo passato. Protetta da Soren, Kwan va alla ricerca di un esercito.

In fuga e senza scelta, Kwan e Soren non sono d'accordo sul da farsi. John fa una terribile scoperta.

I sopravvissuti alla battaglia ritornano su Reach. John confronta Halsey e le bugie sul suo passato. Il nuovo prigioniero conosce John meglio di lui.

La ricerca del "vero scopo" della sua famiglia porta Kwan nel deserto di Madrigal. Degli affari in sospeso perseguitano Soren.

John e Makee accettano la loro visione. Halsey ha un'ultima possibilità per salvare la missione e se stessa.

Ferito e tradito, John 117 guida gli Spartan in una missione suicida per trovare l'Halo e salvare l'umanità.