1946-ban Peggy Carter a Stratégiai Tudományos Egység titkárnőjeként dolgozik. Howard Stark segítséget kér tőle, mert az egész ország azt hiszi, hogy halálos fegyvereket adott el az ellenségnek.

Howard Stark leghalálosabb fegyvere az ellenség kezébe került, és egyedül Carter ügynök szerezheti vissza. De vajon sikerrel jár mielőtt az SSR vezetője, Dooley és Thompson ügynök leleplezi titkos küldetését?

Miközben Carter ügynök egyre közelebb kerül Howard Stark ellopott fegyveréhez, Peggy küldetése veszélybe kerül, amikor az SSR elfogja Jarvist, és fény derül egy titokra.

Peggy a szokottnál is nagyobb bajba kerül, amikor a szökevény Howard Stark titokzatos okokból váratlanul visszatér. Dooley új nyomon indul el, és egészen Európáig jut, ami tönkreteheti Peggy jövőjét az SSR-nél.

Carter végre lehetőséget kap arra, hogy bizonyítson, mivel Thompson ügynökkel és a kommandóval egy oroszországi küldetésre indul. Mindeközben Sousa ügynök fontos felfedezésre bukkan.

Carter úgy gondolja, hogy Start találmányát egy női ügynök lophatta el. Az SSR most már tudja, hogy Carter segít a tudósnak. Egy új kém is beépül az ügynökséghez.

Peggy aggódik és minden eddiginél sebezhetőbb, mivel a Leviatán mozgásba lendül ellene. Miközben az SSR egyre közelebb jut Howard Starkhoz, ám nagy árat kell fizetniük, amikor rájönnek, hogy a valódi ellenség sokkal közelebb van, mint gondolnák.

A Leviatán haragja Peggyre zúdul, Howard Stark pedig visszatér.