Cuando estaba a punto de morir por inanición, Atsushi Nakajima conoce a Osaumu Dazai, un miembro activo de la Agencia Armada de Detectives, cuyos miembros tienen poderes sobrenaturales. Tentado por la recompensa, Atsushi ayudará a Osamu a atrapar a un tigre comehombres que anda causando estragos de ciudad en ciudad.

Atsushi es reclutado por Osamu para que haga parte de la Agencia Armada de Detectives. Sin embargo, Atsushi no está seguro de que pueda ser de utilidad, así que prefiere buscar trabajo en otro lado.

Una mujer llega a la agencia buscando ayuda para vigilar a unos contrabandistas. El equipo decide que es el trabajo perfecto para Atsushi. Tanizaki y su hermana acompañan a Atsushi a la misión mientras este intenta adivinar la antigua profesión de Dazai.

La Port Mafia cuenta con una división armada del nivel de las fuerzas especiales llamada Lagartija Negra. Y ahora que Atsushi se ha convertido el objetivo declarado de la mafia, Lagartija Negra podría ir tras él.

Atsushi asiste al detective Rampo en un caso de homicidio. El detective Rampo es muy respetado dentro de la agencia, y su Ultradeducción le permite resolver hasta los casos más difíciles en cuestión de segundos.

Atsushi y Dazai acompañan a Kunikida a investigar un extraño caso de desapariciones en Yokohama. Las pistas los llevan a un hospital abandonado, por lo que deciden acudir a sus informantes de confianza antes de seguir con la búsqueda.

Atsushi, Dazai y Kunikida rastrean una bomba que planea hacer estallar el criminal conocido como "mensajero azul". De ellos dependerá que Yokohama y la agencia no terminen devastadas y destruidas.

Atsushi acompañaba a la doctora Yosano a cargar sus compras cuando uno de los vagones del tren en el que iban explota de repente. El incidente es obra de un famoso criminal perteneciente a la Port Mafia, que amenaza con matarlos a todos si Atsushi no se entrega.

Tras recuperar la consciencia, la extraña chica que servía de asesina a la Port Mafia tiene una cita con Atsushi, quien a su vez no se decide si salvarla, o entregarla a la policía, que muy seguramente la ejecutará por sus crímenes.

Higuchi, quien es miembro de la Port Mafia y compañera de Akutagawa, toma la peligrosa decisión de rescatar a su jefe sola, quien fue secuestrado por otro grupo criminal. Por otro lado, Atsushi sale a investigar con Kenji y aprende su peculiar forma de resolver casos.

Una organización norteamericana llamada "Guild" se presenta en la agencia para proponerle un trato al presidente. Guild es la responsable de la recompensa por la captura de Atsushi, y sus miembros cuentan con cargos importantes en mucho ámbitos de poder, por lo que harán lo que sea necesario para obtener lo que quieren.

Tres compañeros de copas se reúnen una noche en un bar, todos miembros de la Port Mafia: un líder, un oficial de inteligencia y un recadero. Cuando al otro día Ango, el oficial, no aparece, el jefe de la Port Mafia le encargará a Oda, el recadero, encontrarlo.

Sakunosuke Oda y Dazai intentan descubrir la verdad tras la supuesta traición de Ango, permitiéndones descubrir más sobre el pasado de Dazai en la Port Mafia.

El conflicto entre la Port Mafia y Mimic sube de escala, y por fin aparece su lider, Gide, a demostrar cuál es su poder. Pero ¿qué fue de Ango? ¿Cuál era su rol en todo esto?

Sakunosuke queda devastado luego de caer en la trampa que le tendió Mimic. Cegado por la venganza, decide enfrentarlos solo. Dazai descubre al cerebro detrás de todo e intenta prevenir que suceda una tragedia.

De vuelta al presente, Atsushi acompaña a Kyouka en su primer trabajo con la agencia. Sin embargo, uno de los líderes de la Port Mafia va en busca de Kyouka, y los eventos desembocan en un encuentro entre las tres organizaciones.

El líder de la Port Mafia es el primero en hacer su jugada. Miembros de Guild son emboscados en su crucero, mientras que el equipo de defensa de la agencia recibe un alarmante mensaje.

Al tiempo que los miembros de Guild van tras las secretarias de la agencia, Kunikida y Junichirou se apresuran a salvarlas. Por otro lado, Dazai y Atsushi se enfrentan al as secreto de la Port Mafia.

Pese a los esfuerzos de Kyouka, Atsushi es capturado por Guild. Pero no es el único. Q también cae en manos de Guild, y lo usan para llevar a cabo su terrorífico plan de emergencia.

Por sugerencia de Atsushi, los líderes de la Agencia de Detectives y la Port Mafia se reúnen para discutir una alianza. Por otro lado, Dazai y Chuuya revivirán una de las parejas más terroríficas del pasado.

Rampo recibe una misteriosa carta de desafío de uno de los miembros de Guild, así que, acompañado de Yosano, decide ir a hacerle frente. Por otro lado, Atsushi recibe la importantísima misión de infiltrarse en la base enemiga y evitar un nuevo caos en la ciudad.

Akutagawa y Atsushi se encuentran en el Moby-Dick. Mientras Atsushi intenta evitar la caída de la nave sobre la ciudad, Akutagawa busca venganza. Pero el líder de Guild demuestra ser un temible adversario.

El enfrentamiento final contra Guild llega a su fin, pero salvar la ciudad se antoja complicado dada la situación.

Tras la muerte del anterior jefe, Dazai se convierte en hombre de confianza del nuevo líder de la Port Mafia. Cuando unos misteriosos avistamientos indican que el antiguo jefe podría haber regresado de los muertos, Dazai acabará trabajando con alguien inesperado.

Chuuya y Dazai siguen investigando el misterio tras la supuesta reaparición del antiguo jefe, pero Chuuya solo tiene interés en el Arahabaki. Una apuesta entre ambos calentará el ambiente.

Ahora que Dazai y Chuya han descubierto el plan de Rando tendrán que enfrentarse a él, descubriendo una historia de traiciones que no tardarán en ver replicada en cierta persona...

A, uno de los líderes de la Port Mafia, ha logrado capturar a Fiódor e intenta que se una a él, pero controlar al responsable de la caída de Moby Dick no será tan sencillo.

La tregua entre la Port Mafia y la Agencia Armada de Detectives peligra por cierta belleza de estilo asiático que importuna a miembros de ambos bandos... aunque no hizo nada realmente.

Dos historias que nos ayudan a descubrir más sobre el pasado de Kyouka, de Atsushi y los sentimientos de todo lo relacionado con sus familias.

Louisa acude a buscar a su antiguo jefe, el líder de Guild, para intentar convencerlo de levantar de nuevo la organización, aunque el hombre que encuentra no es más que una sombra de lo que fue.

Un asesino enmascarado ataca al jefe de la Agencia y lo infecta con algo que sus subordinados son incapaces de detectar. En base a cómo ataca el criminal, no tardan mucho en descubrir su identidad, pero ¿qué pretende?

Cuando Kunikida y Atsushi se infiltran en la que creen la guarida del responsable del poder vírico, lo que encuentran es algo tan retorcido que ni siquiera ellos saben cómo reaccionar.

La Port Mafia y la Agencia entablan un conflicto que se saldará con multitud de muertes, algo inevitable dada la situación pese a que no es lo que nadie quiere realmente.

La pelea entre ambos jefes parece que no será la solución al problema, así que la intervención de cierto hombre será la clave para que Dazai ponga en marcha un plan con dos peones: uno blanco y uno negro.

Sigue el ataque a la base buscando encontrar a Fiódor, pero primero deberán lidiar con el virus que tiene entre la vida y la muerte a varios miembros de ambas organizaciones.

Un viaje al pasado nos lleva al momento en el que Rampo y Fukuzawa se conocieron.

Fukuzawa logra convencer a Rampo de que tiene superpoderes, lo que hará que gane un exceso de confianza... pero también se lance a resolver un complejo caso.

Rampo sigue dando caza al verdadero culpable de todo lo sucedido.

Rampo se encuentra con un misterioso caso buscando a un sospechoso, pero parece que es uno que no puede resolver.

Rampo enfrenta personalmente al responsable del crimen perfecto, pero todo es mucho más complejo de lo que parece a primera vista.

La Agencia Armada de Detectives recibe un encargo para investigar unos asesinatos en serie de personas importantes, pero la posible implicación del Gobierno y las reticencias de Rampo tras el mensaje que recibió de su último rival parece que complicarán mucho la situación.

Ahora que la Agencia Armada de Detectives ha caído en la trampa, los Perros de Caza entran en escena. Y el montaje es mucho más que eso.

La agencia está en apuros tras la trampa de La Corrupción de un Ángel, así que tendrán que formar alianzas inesperadas para intentar sobrevivir.

La Port Mafia quiere a Yosano a cambio de ayudar a la Agencia Armada de Detectives, pero esto es porque Yosano tiene su historia con los líderes de ambas organizaciones.

La Agencia Armada de Detectives parece haber caído en una trampa, pero Yosano sabe que hay algo más y que los Perros de Caza tienen algún truco en la manga.

Es la hora de huir para buscar un lugar seguro, pero por suerte, cuentan con ayuda.

La agencia cuenta con la ayuda de Lucy para trasladarse a un lugar seguro: un casino flotante fuera de la jurisdicción internacional pero que oculta un oscuro secreto.

El casino está a punto de venirse abajo y Sigma no está dispuesto a permitirlo, pero como sucede siempre, hay algo más detrás de todo lo que está ocurriendo.

Con casi toda la agencia en mala posición, con Kunikida y Dazai presos, Atsushi y Ranpo se convierten en su mayor esperanza para salir de todo el problema.

El mundo se prepara para crear una nueva agencia internacional y especial capaz de enfrentar a la nueva oleada de terrorismo por parte de la agencia, pero siempre hay algo más.

Akutagawa aparece para ayudar a Atsushi en su enfrentamiento contra Fukuchi por orden de Dazai, pero ¿podrán estos dos jóvenes hacer algo contra el poderoso héroe de guerra?

Akutagawa se sacrifica por Atsushi, pero ¿será eso suficiente para que el joven tigre pueda huir del poderoso Fukuchi?

Fukuzawa pretende hacerse con One Order, un arma extremadamente poderosa y que le ayudaría a tener un poder inmenso. En la agencia se preparan para contrarrestar sus planes.

Fukuchi está a punto de hacerse con One Order, así que varios miembros de la agencia siguen el plan de Rampo para intentar impedírselo.

Mientras Dazai y Fiódor siguen con su peculiar duelo mortal propiciado por Nikolai, Aya busca la forma de escapar con Bram de un aeropuerto cerrado.

Jono ha desaparecido y todos buscan un culpable. Los vampiros parecen ser los principales enemigos, pero no se van a quedar de brazos cruzados.

Mientras Fukuchi busca a quién se ha llevado a Bram, Atsushi está a punto de descubrir qué oculta todo su plan, y es más traumático de lo que esperaba.

Mientras Fiodor y Dazai continúan con su duelo, en el exterior Bram se ha convertido en cebo y el mundo está a punto de vivir su final.

Mientras Fukuzawa y Fukuchi siguen su duelo, el fin del mundo se avecina. Fiódor parece haber vencido a Dazai y Aya sigue intentando liberar a Bram.