Flapjack le dice a un inventor loco que Bubbie es más rápido que una máquina.

Flapjack quiere saber qué hace Bubbie a lo largo del día, así que trata de descifrarlo.

Después de ganar un juego de póker, el Capitán K’nuckles termina perdiendo a Flapjack como amigo.

Flapjack conoce a una anciana adinerada, que quiere convertirlo en un joven adecuado.

Bubbie y Flapjack se encuentran con el hermano gemelo del malvado inventor de Several Leagues Under the Sea, y Bubbie trata de ayudarlo a cumplir sus sueños y el de crear un barco volador. Sin embargo, parece que el hermano gemelo está realmente enamorado de Bubbie, lo que lleva a una aventura peligrosa por encima del mar embravecido.

Peppermint Larry se niega a darle dulces a Flapjack y K’nuckles a menos que le traigan envoltorios de caramelos para cambiarlos por golosinas. Egoístamente, K’nuckles toma todos los dulces para él, rompiendo el corazón de Flapjack.

K’nuckles localiza un mapa que supuestamente conduce a la isla Candied, pero cuando Flapjack queda “ciego” debido a su largo cabello cubriendo sus ojos (desarrollando una audición sobrehumana y aparente telepatía en el proceso para compensar), un grupo de barberos roba el mapa.

K’nuckles y Flapjack se guardan en un barco y llegan a una isla que ellos creen que es la isla Candied. Sin embargo, está habitado por una terrible bestia llamada Cammie.

K’nuckles distraídamente conduce a Flapjack a la boca de Ocho-Armado Willy, sin saber que estaba a la izquierda de la derecha. Esto hace que Flapjack crea que es su culpa que no puedan navegar por el mapa. Él y K’nuckles, instruidos por Bubbie, van a la escuela para recibir una educación básica en navegación. Sin embargo, se está tramando un plan más tortuoso en la escuela que los aventureros desconocen.

Flapjack y el Capitán K’nuckles sufren de un caso grave de quemaduras en los pies (pies quemados por el sol) después de dormir al sol. Y en su búsqueda para tratarlo, descubren un horrible conductor de carro a quien K’nuckles conocía de su pasado.

K’nuckles crea cuentos sobre sus manos protésicas, cuando aparece un hombre que dice ser el verdadero dueño de su mano derecha. Amenaza a K’nuckles y exige el regreso de su mano en 24 horas.

Para celebrar el cumpleaños de Flapjack, el Capitán K’nuckles y Flapjack navegan hacia el oeste, obligados por Bubbie a buscar la isla Candied. Flapjack es ajeno al peligro que lo rodea, a pesar de escenarios como barcos en llamas, monstruos, locos viejos ermitaños y otros peligros similares.

Flapjack incomoda a todos los ciudadanos de Stormalong cuando se hace amigo de una rata a la que llama “K’nuckles II”, mientras que el verdadero capitán K’nuckles está ausente. Resulta que K’nuckles II tiene la capacidad aparentemente sobrenatural de infectar a cualquiera que sea cruel con la plaga Flapjack golpeando sus pulgas, y, casi de la noche a la mañana, todos en Stormalong, pero el propio Bubbie y Flapjack están infectados (aunque el original K’nuckles se infecta a propósito para evitar ayudar al Doctor Barber a cuidar a los demás).

Flapjack, el Capitán K’nuckles y Bubbie viajan al Fondo del Mundo para recuperar el “músculo sittin” perdido de K’nuckles (su parte inferior), que él reemplazó con un cinturón de madera. Van a la cima de una montaña, donde se encuentra su músculo sentado.

Molesto por los constantes ruidos de Flapjack mientras intenta dormir, K’nuckles le cuenta a Flapjack sobre la maldición de Mute Mike y accidentalmente maldice a Flapjack con la incapacidad de hablar. Van al Knot Festival para tratar de encontrar una cura para su maldición. Van por ahí tratando de encontrar curas, hasta que K’nuckles oye hablar a Flapjack.

Después de un incidente con algunas mujeres en el Candy Barrel, el Capitán K’nuckles le cuenta a Flapjack cuándo estaba en una fiesta, y todos tenían citas, excepto K’nuckles, cuya cita lo abandonó. Él ha tenido Misogyny desde entonces.

Peppermint Larry presenta su Adventure Beard-Off anual. Hombres con barbas fantásticas compiten para ganar la mano de la hija de la dulce de pimienta de Peppermint Larry. El Capitán K’nuckles quiere una barba para competir (él y Flapjack piensan que la hija está hecha de dulces, y los dos quieren comerla), y Flapjack hace una barba falsa de pelo y pegamento. A la mañana siguiente, K’nuckles se despierta con una barba y entra a la competencia.

Peppermint Larry se está preparando para el Stormalong Pun-Off, donde competirá con la leyenda de la comedia, Punsie McKale, en broma. Para practicar, Peppermint Larry enseña juegos de palabras de Flapjack, ya que Flapjack es un muy mal bromista.

Stormalong es visitado por un hombre excéntrico que promete maravillas nunca antes vistas. La “maravilla” resulta ser una película. La película que se muestra es solo el hombre caminando en una acera y sentado en una silla. Esto aburre a Flapjack, pero los otros habitantes de Stormalong están hechizados por la película. Flapjack se deja entretener a sí mismo.

Mientras busca Isla Candied, K’nuckles y Flapjack encuentran una isla con un genio mecánico. El genio engaña a Flapjack y K’nuckles para que crean que sabe dónde está Candied Island, y K’nuckles apuesta por la vida en un juego donde debe encontrar una pelota debajo de una de las tres copas. K’nuckles pierde, y él y Flapjack se convierten en los mayordomos del genio para siempre.

Después de que K’nuckles le dice a Flapjack que cuantos más enemigos tiene un aventurero, más grande de un gran aventurero que es, Flapjack se propone hacer tantos enemigos como pueda. En su lugar, termina ayudando a la gente, como dispararle a un anciano con un cañón y en cambio, arreglarle la espalda y romper una réplica de Candied Island Peppermint Larry hecha en siete años, pero haciendo un viaje de ladrón de caramelos y cayendo al océano.

Flapjack busca desesperadamente a un hermanito cuando el Capitán Knoge lo llama “bebé” por irritación. Flapjack va a Bubbie para descubrir de dónde vienen los bebés y adopta accidentalmente un pato como su nuevo “hermano pequeño”.

Cuando Peppermint Larry pierde la propiedad de su tienda, Flapjack trata de encontrarle un nuevo trabajo.

Flapjack le dice a Bubbie que no siga más al Capitán K’nuckles y le dice a Flapjack que lidere al Capitán K’nuckles, solo para que sea contraproducente. Flapjack lleva K’nuckles como un sello por error y K’nuckles se convierte en un sello.

Una pandilla de niños de la parte mala de Stormalong elige a Flapjack.

Cuando se cree que Flapjack se enamoró de una chica llamada Sally Syrup, Peppermint Larry y el Capitán K’nuckles esperaban sacar provecho del acuerdo robando los corazones amorosos que salen de su cabeza.

Bubbie se enamora de una ballena llamada Harvey, que secuestra al Capitán K’nuckles y Flapjack para trabajar en su fábrica en Laundry Island, desconocida para Bubbie, que cree que la están ignorando.

Después de que Flapjack encuentra un par de patas a la deriva en el mar, el Capitán K’nuckles las usa para aterrorizar a la gente del Puerto de Stormalong. Sin embargo, cuando llega el torso de un monstruo marino para recuperar las patas, se produce una batalla por la propiedad.

A Flapjack se le dice el origen de su nombre antes de obtener sus primeros “flapjacks especiales”. Sin embargo, cuando el Capitán K’nuckles le informa a Flapjack que no puede comer panqueques sin jarabe, los dos se disponen a resolver la reciente escasez de jarabe.

Cuando Flapjack descubre algo de fruta fresca, que no se ha visto en años, y el Capitán K’Nuckles se la come, los dos se dirigen a una isla para obtener algo más. Pero un hombre planta misterioso se interpone en el camino.

El Dock Hag atrapa a Flapjack y al Capitán K’nuckles ensuciando y los sentencia al servicio comunitario recogiendo cabezas de pescado. El doctor Barber, sin embargo, ofrece pagarles las cabezas, para su deleite, pero pronto descubren sus verdaderas intenciones para las cabezas de pescado.

A Flapjack lo siguen confundiendo con una niña, por lo que él y el Capitán K’Nuckles intentan engañarlo, solo para descubrir que su voz es el problema.

El Capitán K’nuckles se roba el corazón de una reina sirena llena de dulces, con la intención de que él y Flapjack lleguen a la isla Candied, pero rápidamente hacen un mal uso de los deseos y aprenden un terrible secreto sobre la sirena.

Flapjack y el Capitán K’nuckles son estafados por un hombre misterioso llamado Ben Boozle, y se ven obligados a trabajar en su barco hasta que Flapjack pueda alcanzar el rango de capitán.

Flapjack y el Capitán K’nuckles se cuelan a bordo de un crucero de golosinas, pero accidentalmente enojan al Poseidón cuando destruyen el mascarón de proa del barco, que era de su hija.

Flapjack es bautizado como el ángel guardián del Capitán K’nuckles por Bubbie, pero cuando Flapjack lo molesta con protección constante, K’nuckles simula su propia muerte para tener paz.

Cuando el Capitán K’nuckles y Bubbie leen el diario secreto de Flapjack, Flapjack decide vivir como un ermitaño en una isla remota, para mantener todos sus secretos a salvo.

Cuando se burlan de un niño rico por ser pobre, Flapjack y el Capitán K’nuckles buscan diamantes que el niño asegura que se encuentran en las alcantarillas del Upper Stormalong Harbour.

Flapjack se entera por el Capitán K’Nuckles de un hombre extraño que regala panales a cambio de dulces. Al enterarse de que la familia de este hombre se encuentra en una situación similar a la suya, Flapjack decide ayudar al hombre, Tee Hee Tummy Tums, a vender sus peines.

Flapjack and Captain K'nuckles get stranded on an island inhabited by a mechanical genie; after fishing for food, they discover that not everything is as it seems.

Captain K'nuckles tells Flapjack that the more enemies an adventurer have, the greater adventurer he is. This results in Flapjack going on a quest to make enemies and all his plans backfiring.

Desperate to find a younger sibling after Captain K'nuckles calls him "a baby" out of annoyance, Flapjack asks Bubbie where babies come from and mistakenly adopts a duck as his new "baby brother".

When the Candy Barrel is shut down by the Dock Hag due to a misunderstanding, Peppermint Larry tries his hand at puppetry. He eventually finds success with "The Amazing Adventures of Pancake" – a spoof of Flapjack and his adventures, much to Flapjack's dismay.

Believing K'nuckles to be a bad influence Bubbie tells Flapjack to stop following the pirate, but to lead him instead. Unfortunately, after taking the advice of an animal trainer Flapjack accidentally hypnotizes K'nuckles into believing he is a seal.

When Bubbie sends Flapjack and K'nuckles to get shelf polish on the "bad side" of town, they get into trouble with a group of alley kids and ultimately are challenged to a dance-off to get their possessions back.

Flapjack denies he is in love with Sally Syrup, despite the little red hearts that pop up around his head.

Bubbie falls in love with a whale named Harvey, who kidnaps Captain K'nuckles and Flapjack to work in his factory on Laundry Island – unknown to Bubbie, who thinks they are ignoring her.

After Flapjack finds a pair of legs adrift at sea, Captain K'nuckles uses them to terrorize the people of Stormalong Harbor. However, when a sea monster's torso comes to reclaim the legs a battle for ownership ensues.

Flapjack is told by Bubbie the origin of his name before getting his first "special flapjacks". However, Captain K'nuckles forbids Flapjack from eating pancakes without syrup and the two set out to solve the recent syrup shortage.

When Flapjack discovers some fresh fruit (which hasn't been seen in years) and Captain K'Nuckles eats it, the two head to an island to get some more but a mysterious plant man keeps getting in the way.

The Dock Hag catches Flapjack and Captain K'nuckles littering and sentences them to community service collecting fish heads. Doctor Barber offers to pay them for the heads (much to their delight), but they soon discover his true intentions for the fish heads.

Flapjack keeps getting mistaken for a girl so he and Captain K'nuckles attempt to literally "man him up", only to discover that his voice is the problem.

Captain K'nuckles steals a mermaid queen's heart filled with wishes (in the form of candy) so he and Flapjack can go to Candied Island, but they quickly misuse the wishes and learn a terrible secret about the mermaid.

Flapjack and Captain K'nuckles sneak aboard a candy cruise ship, but accidentally anger Poseidon when they destroy the ship's figurehead.

Flapjack is dubbed Captain K'nuckles' guardian angel by Bubbie but when Flapjack annoys him with constant protection, K'nuckles fakes his own death to have peace.

When Captain K'nuckles and Bubbie read Flapjack's secret diary, Flapjack decides to live like a hermit on a remote island to keep his secrets safe.

Taunted by a rich boy for being poor, Flapjack and Captain K'nuckles search for diamonds that the rich boy claims are in the sewers of Upper Stormalong Harbor.

Flapjack learns from Captain K'Nuckles about a strange man who trades combs in exchange for candy. After finding the man's family is in a similar situation to his, Flapjack helps the man (Tee Hee Tummy Tums) sell his combs.