Michael passe par un trou de ver et atterrit dans un futur lointain. Il y rencontre Book, un coursier mystérieux, qui lui révèle le sort connu jadis par la Fédération.

En arrivant au 32e siècle, le Discovery s'écrase sur un monde gelé. Alors que l'équipage répare le vaisseau, Saru et Tilly s'aventurent jusqu'à un campement voisin.

Réunis, Michael et l'équipage du Discovery suivent un message jusqu'à la Terre, où Saru rompt une trêve. Stamets rencontre Adira, un être humain au passé atypique.

Michael accompagne Adira jusqu'à Trill pour essayer de retrouver les souvenirs de leur symbiote. Saru convie des officiers de passerelle à dîner.

Le Discovery trouve les restes de la Starfleet sous la garde du prudent amiral Vance. Malgré ses doutes, ce dernier assigne sa première mission à l'équipage.

Comme le vaisseau de Book arrive sans lui à bord, Michael désobéit aux ordres et lance une opération de sauvetage dans un monde contrôlé par l'infâme Chaîne d'Émeraude.

Des données sur le Brasier lancent Michael dans une mission qui lui permet de renouer avec sa famille et révèle le sort des Vulcains, des Romuliens et de son frère Spock.

Un message personnel enjoint Book à revenir sur sa planète qui vient de subir une catastrophe naturelle et se trouve désormais sous le joug de la Chaîne d'Émeraude.

La maladie de Georgiou s'aggrave, mais un traitement existe peut-être dans le dangereux univers Miroir. Adira et Stamets décodent un signal de détresse vieux de 100 ans.

Piégé dans l'univers Miroir, l'Empereur Georgiou cherche à changer le cours de l'histoire mais se heurte à un obstacle infranchissable : Michael.

L'équipage du Discovery suit un mystérieux signal au cœur d'une dangereuse nébuleuse. Il secourt alors un unique survivant kelpien et découvre l'origine du Brasier.

Osyraa s'empare de Discovery et trouve le QG de la Fédération, mais prétend que ses intentions sont pacifiques. Michael se bat pour reprendre le contrôle du vaisseau.

Tandis que Saru tente de persuader Su'Kal d'abandonner son holoprogramme, Michael et Book affrontent Osyraa et la Chaîne d'Émeraude dans une ultime bataille.