Son of Naruto Uzumaki, Boruto, follows his father's footsteps along with his friends to become great ninja. Throughout all their adventures, Boruto is determined to make his mark in the ninja world and live outside of his father's shadow.

After the Chunin Exams, Katasuke has returned to work at the invitation of the Hokage. Upon seeing him, Boruto becomes annoyed thinking about what happened during the exam. Team 7 is given a mission to escort Katasuke and transport a Scientific Ninja Tool. Stuck on a mission he doesn’t like, Boruto runs into Ao while aboard the Thunder Train headed to their destination.

Team 7 has arrived at a high-tech research center along with Katasuke. There, they end up running into some familiar faces. The mission has ended without incident, and Boruto is ready to head home. However, there’s more they must do. Boruto and his friends end up cooperating in a test-run of a Scientific Ninja Tool that is under development. Boruto is unhappy at first, but as the test run continues his feelings start to change. As that happens, Team 7 is given a new urgent assignment from the Hokage.

After finding out that Konohamaru and Mugino have gone missing, Team 7 is ordered to go to their last known location and investigate what happened. Team 7 and Katasuke arrive at the airship wreckage, but are attacked by strange puppets.

Ao è diventato ostile. Per sfuggire ai suoi attacchi, Mugino tenta una strategia rischiosa, che permette a Boruto e agli altri di fuggire. Boruto e i suoi amici sono scioccati dagli eventi che si sono svolti, ma poi Katasuke confessa qualcosa di ancora più scioccante. Nel frattempo, dopo aver permesso a Boruto e agli altri di fuggire, Ao viene visitato da Koji Kashin, un membro di Kara, l'Husk.

Inizia la resa dei conti tra il Team 7 e Ao! Il Team 7 lavora insieme per lanciare una raffica di attacchi, ma contrastare l'uso abile degli Strumenti Ninja Scientifici da parte di Ao non sarà facile. Proprio mentre sembrano averlo messo alle strette, Ao rivela la sua arma più grande.

Mentre Boruto e i suoi amici finiscono la loro battaglia con Ao, appare Koji Kashin, un membro di Kara! Koji li lega con un Sealing Jutsu e cerca di eliminarli e completare la sua missione, ma Konohamaru dissipa il jutsu e lo affronta uno contro uno!

Koji mostra interesse per la trasformazione di Boruto e si ritira, e Boruto e i suoi amici decidono di tornare al villaggio. Sulla via del ritorno, scoprono un ragazzo incosciente che ha lo stesso strano segno sul palmo della mano di Boruto.

La battaglia tra Garo, un Esterno, e Kawaki, noto anche come la Nave, ha inizio! L'intero corpo di Garo è dotato di strumenti ninja scientifici e Kawaki è in grado di trasformare il suo braccio in varie forme. Boruto e i suoi amici sono senza parole. Mentre la battaglia infuria, Kawaki viene gradualmente sopraffatto e catturato.

Il team torna all'Advanced Technology Lab con Kawaki. Konohamaru è tornato al villaggio per riferire sulla missione. Naruto, preoccupato per la relazione tra Kawaki e Kara, decide di andare in laboratorio.

Kawaki fugge dall'Advanced Technology Lab e si ritrova in un vivace quartiere dello shopping. Esausto e affamato, cerca disperatamente cibo. Sumire e Nue lo trovano, e Sumire esprime la sua preoccupazione per il suo infortunio, ma Kawaki continua ad essere ostile.