ينتهي الاضراب في قرية الصخر بموت التسوتشيكاغي الثالث أونوكي. بينما يعود شينوبي قرية الورق إلى ديارهم، يواجه كلّ من بوروتو وسارادا قرارًا صارمًا من الهوكاغي كعقوبةٍ لمغادرتهما القرية دون إذن، بينما يخضع ميتسكي للاستجواب لأجل تحديد مصيره

岩隐村叛乱结束，大野木在五影与村民的送别下安葬，五影通过这次事件意识到需要培养更多的年轻人，再由他们逐渐团结起来并传承最坚定的意志。但善后过程中，帮大野木制造人造人的博士遗体消失不见，为众人留下一个谜团。其他人连同巳月返回木叶，擅自离村的博人和佐良娜被剥夺下忍资格，巳月同时接受审问，木叶最终没有将事情追究下去。辛牙与博人的通灵契约同时终止，但辛牙也从此对人类产生不同的看法。巳月为石英一行人制作墓碑作为纪念，得到博人和佐良娜的谅解而重新加入第七班，他们同时因这次难忘历险而找到各自的“心之石”。事后，黑土亲自造访木叶，亲自感谢博人一行下忍拯救岩隐村，帮他们拿回下忍的资格，使他们开始一番新的忍者生涯与日常任务。

Boruto and the other Leaf Genin return to the Hidden Leaf with Mitsuki. However, Mitsuki is detained and subjected to hours of interrogation. And since Boruto and the others have taken actions that would normally banish them from the village, it is decided that they will lose their genin qualification as punishment.

Boruto et les autres aspirants sont renvoyés à Konoha par le train. Bien qu’il ait sauvé Iwa d’une castastrophe, Mitsuki est soumis à un interrogatoire poussé, en prélude à une inévitable sanction. Coupables du même délit de désertion, Boruto et Sarada n'échapperont pas non plus à des mesures disciplinaires.

Die Katastrophe in Iwagakure wurde abgewendet und der Alltag kehrt so langsam wieder ein. Jedoch erwartet Team 7 noch eine Bestrafung.

ボルトたちがミツキとともに木ノ葉隠れの里に帰ってきた。　だが、今回の事件に自らの意志で関わり、事情を知らないボルトたちを巻き込むことになったミツキはひとりだけ隔離され、長時間の事情聴取を受けることになる。さらに、里抜け同然の行動をとったボルトたちにも、「下忍の資格を剥奪する」という厳しい処分が下る。　そして、岩隠れの里では、さまざまな問題や謎を残しつつも、四代目土影・黒ツチたちの努力によって、事件後の里に平穏が戻り始めていた。

바위 마을의 반란이 무사히 진압되고 보루토와 아이들은 나뭇잎 마을로 강제 송환된다. 나루토를 비롯한 어른들은 비록 허가도 없이 마을을 빠져나갔으나 닌자계의 대참사를 막는 데 큰 공을 세운 아이들을 어떻게든 구제해 주고 싶지만 규율이 규율인 만큼 하급 닌자 자격을 박탈하기로 결정한다. 한편 그간의 사정과 알고 있는 정보를 알아내기 위해 따로 조사 기관의 심문을 받고 있던 미츠키가 드디어 풀려났다는 소식을 들은 보루토와 사라다는 한달음에 달려가는데…

Boruto e os outros Genins retornam à Vila da Folha com Mitsuki... Como Boruto e outros tomaram decisões questionáveis contra as vontades da vila, agora terão de enfrentar as consequências...

Восстание подавлено, и ребят отправляют домой. Все они что-то вынесли из этого приключения, но седьмую команду продолжают терзать слова Ооноки о причинах, по которым Мицуки покинул деревню…

Tras recuperar a Mitsuki y resolver el incidente con la Roca, los jóvenes protagonistas se preparan para recibir su castigo por lo ocurrido.

Todos los alumnos de Konoha regresan en tren a su aldea. Durante el trayecto, Boruto y Sarada hablan sobre el funeral de Ounoki, al que no le dejaron ir. Mientras, Mitsuki viaja en otro vagón con Konohamaru y Sai. Inojin mira con nostalgia el dibujo que le hizo a Akkun y recuerda cuando lo enterró. En el funeral, los cinco Kages deciden unir aún más las relaciones entre las aldeas mientras lloran la pérdida de Ounoki. Ya en Konoha, Mitsuki es interrogado y admite que se fue con los Creados no solo para investigarles sino también por curiosidad. En el despacho de Naruto, se le retira la licencia de Genin a Boruto y Sarada por haber abandonado la aldea sin permiso. Ellos ahora temen que no vuelvan a ver a Mitsuki nunca más. Boruto regresa a casa y se reecuentra con su hermana Himawari y con su madre, Hinata. Más tarde, Galaga se pone en contacto con él y le recuerda que su pacto de invocación se terminaba después de rescatar a Mitsuki, por lo que la gran serpiente le da las gracias y se va. El Uzumaki se queda dormido y empieza a soñar con todo lo sucedido, pero de repente Sarada lo despierta y le avisa de que Mitsuki ya salió del interrogatorio. Los dos shinobi deciden ir a buscarlo, siendo Boruto el primero que lo encuentra. Mitsuki, que había hecho una tumba para Sekiei y el resto de los Creados, se disculpa con él y le pide que todo vuelva a ser como antes. Boruto le dice que no, ya que esta vez tendrán una voluntad aún más fuerte. Sarada llega y el Equipo 7 choca sus puños en señal de amistad. Mientras, Naruto recibe la visita de la Tsuchikage Kurotsuchi y de Akatsuchi. Después de agradecerle el trabajo de los ninja de Konoha en la Aldea de las Rocas, la Tsuchikage le deja caer a Naruto que debería premiar a Boruto y compañía por sus acciones. Como consecuencia, Boruto, Sarada y Mitsuki reciben de nuevo su banda de Genin y se preparan para una misión junto con Konohamaru.