Thomas arriva a Los Angeles per consegnare dei documenti a una compagnia cinematografica per conto di Robin Masters. Durante il viaggio fa amicizia con una ragazza che però ritrova assassinata nella sua camera d'albergo. Thomas si mette in cerca del killer insieme all'affascinante avvocatessa della compagnia cinematografica. Nel frattempo alle Hawaii, uno dei giocatori della squadra di baseball di T.C., rimane coinvolto in un traffico di auto rubate ed assiste all'omicidio di alcuni amici dopo aver rubato un'automobile.

Magnum e Cynthia stanno indagando sull'omicidio di Marti e la vicinanza fa scattare la scintilla per entrambi. Le loro ricerche li portano fino a un trafficante di droga, ma la situazione si fa pericolosa e i due rischiano la vita. Nel frattempo alle Hawai, T.C. continua le ricerche di Kenny insieme e Rick e Higgins.

Una giovane artista di talento assiste a una rapina in banca finita in un bagno di sangue. La ragazza riesce a identificare uno dei criminali e Carol chiede a Magnum di ospitarla al Nido e proteggerla da eventuali ripercussioni della malavita.

Thomas viene colpito dalla sfortuna quando in seguito a una caduta non può partecipare a un evento sportivo di beneficenza al quale teneva molto. Come se non bastasse, s'imbatte in Leslie, la prostituta conosciuta mentre lavorava come detective in un albergo. Leslie ha abbandonato la sua professione e adesso fa la cameriera al Club di Rick. La ragazza vuole assumere Magnum per ritrovare sua sorella, anche lei coinvolta in un giro di prostituzione, che è scomparsa. Thomas è restio ad accettare l'incarico, perché l'impulsività della sua amica gli è già stata fonte di guai e infatti i due si ritrovano coinvolti in un intrigo pericoloso nel losco mondo della politica.

All'annuale Convention degli Investigatori Privati, Magnum riceve il premio come Investigatore dell'anno. Tuttavia la faccenda si trasforma in tragedia quando Jean Claude Fornier, un famoso detective francese, muore per avvelenamento durante il discorso. Magnum cerca di scoprire chi è il killer con l'aiuto, anche troppo ingombrante, dei suoi colleghi investigatori. La pista conduce a una gang di trafficanti di droga che il defunto stava indagando prima di essere assassinato.

Si avvicina il Quattro Luglio e Higgins parte per Maui per una conferenza, Rick e T.C. lasciano l'isola per un viaggio di relax, lasciando il povero Thomas ad affrontare l'orrore della sua dichiarazione dei redditi. Ma l'orrore vero si abbatte sul nostro detective quando un killer psicopatico comincia a tempestarlo di telefonate sinistre recitando rime e filastrocche infantili per annunciare il suo prossimo delitto. Thomas pensa a uno scherzo ma cambia presto idea quando ha notizia del primo omicidio avvenuto esattamente secondo le circostanze descritte dal maniaco.

L'ex moglie di Magnum, Michelle, lascia a Thomas la custodia dei Lily la sua figlioletta di cinque anni. Michelle e suo marito, il Generale Hue sono inseguiti da assassini Vietnamiti determinati a eliminarli. Magnum si prende cura di Lily e comincia a chiedersi se la bambina non sia in realtà sua figlia. Deciso a scoprire la verità, si mette ancora una volta sulle tracce di Michelle.

Higgins e Magnum sono in guerra per via di incidenti col computer che hanno causato un danno and entrambi: Higgins ha cancellato per sbaglio un costoso gioco avuto in prestito da T.C., mentre Magnum ha eliminato una parte delle memorie biografiche di Higgins. I due cominciano a vendicarsi tramite scherzi e prese in giro, che però prendono una piega amara trasformando la lite in una vera e propria battaglia. In tutto questo, Magnum sta indagando su un ring di scommesse illegali che opera sulle isole, ma il suo lavoro viene intralciato dalla guerriglia in atto con il suo antagonista.

Higgins sta conducendo Pamla Bates, un'editrice amica di Robin, e la sua segretaria alla tenuta ma vengono spinti fuori strada da qualcuno intenzionato ad eliminare Pamela. Magnum vorrebbe occuparsi del caso, ma la donna insiste perché la faccenda venga esaminata dal suo investigatore di fiducia che sta per arrivare dal continente. Seccato per essere stato snobbato, Thomas si concentra su un affare immobiliare che ha in corso con T.C.e Rick. Ma il suo istinto non gli da pace e comincia a indagare comunque sul caso. L'investigatore arrivato alla tenuta altri non è che Jessica Fletcher, famosa autrice di romanzi gialli. Insieme i due fanno squadra per scoprire chi è che vuole uccidere Pamela e perché.

Magnum sta lavorando a un caso e si prepara per un appuntamento con la cugina di Rick che si trova in visita alle Hawaii, tuttavia assiste una giovane del posto in difficoltà quando la ragazza si trova coinvolta in un omicidio. Inseguiti da uomini armati, scappano via mare, ma Thomas viene ferito da un colpo di pistola. Riprende conoscenza dopo alcuni giorni e si ritrova sulla remota isola di Kapu, ma della ragazza non c'è traccia. Magnum ha dei ricordi confusi circa l'accaduto ma le sue domande non trovano risposta e sembra anzi che gli abitanti dell'isola stiano nascondendo qualcosa.

I figli di T.C., Melody e Bryant, arrivano sull'isola per far visita al papà, ma all'aeroporto Melody viene rapita e il riscatto ammonta a 300.000 dollari. Magnum, Rick e Higgins accorrono in aiuto del loro amico, cercando di mettere insieme la somma da pagare e allo stesso tempo di scoprire il colpevole del crimine. Il rapimento crea attrito tra Bryan e suo padre e tra T.C. e la sua ex moglie Tina che prende il primo volo per le Hawaii appena messa al corrente dell'accaduto.

Rick sta organizzando un party a sorpresa per il compleanno di Ice Pick, mentre Magnum sta seguendo un caso delicato per fare una cortesia a Carol, la quale sospetta il Giudice Kearns, suo mentore, di essere corrotto. Con la speranza che i suoi timori si rilevino infondati, chiede a Thomas di fare qualche indagine, ma purtroppo le prove raccolte non danno il risultato sperato...

Higgins si trova a capo di una spedizione di un corso di sopravvivenza su un'isola con un piccolo gruppo di giovani criminali, come parte del programma di riabilitazione. Purtroppo le cose si mettono male e Higgins dovrà ricorrere a tutto il suo ingegno per salvarsi dai tre giovinastri che intendono eliminarlo. Nel frattempo, approfittando dell'assenza di Higgins, Magnum decide di organizzare una mega festa al Nido, ma i loro piani non vanno come previsto.

San Francisco, anni '40: l'investigatore privato Thomas S. Magnum sta indagando sull'omicidio del colosso della stampa William Maxfield. Il caso coinvolge dei personaggi che hanno una strana e spiccata somiglianza con i moderni Magnum, T.C. Rick e Higgins.

T.C. sta dando lezioni di volo a Thomas ma viene ferito ed è costretto in ospedale. Magnum si offre volontario per continuare i giri turistici della Island Hopper di proprietà del suo amico, ma si scopre che il colpo di pistola incassato da T.C. era in realtà diretto a Thomas. Si scopre che c'è un contratto sulla sua testa a causa di un uomo che ha tentato di ricattare il re della mafia Messicana facendosi passare per Thomas Magnum.

Thomas sta passando un periodo sfortunato: viene licenziato dal caso a cui sta lavorando, ha un debito di soldi con Rick e riesce perfino a deludere la squadra di baseball di T.C. Magnum decide di allontanarsi per un po' e riprendere fiato e si prepara ad una spedizione in montagna senza dirlo a nessuno. Purtroppo, durante la scalata, la sfortuna sembra perseguitarlo e rimane incastrato sotto il relitto di un aereo della seconda guerra mondiale.

Thomas is in Chinatown with Rick and T.C. celebrating his upcoming fortieth birthday, but he has little to celebrate when he loses his lucky $2 bill that his Grandpa gave him as a boy. While looking for it, he meets a beautiful woman who may cost him not just his lucky bill, but his heart -- and possibly his life.

Rick convince Thomas a occuparsi di un caso molto remunerativo, un semplice caso di persona scomparsa. Ma la persona disposta a pagare una bella somma altri non è che Michael Doheny, poliziotto di New York che ha i suoi motivi per trovare l'uomo in questione. Doheny è arrivato alle Hawai per rintracciare coloro che sono responsabili dello stupro e dell'omicidio di sua nipote, e chiede aiuto a Thomas per trovare i colpevoli.

Cynthia Farrell arriva alle Hawai per vedere Magnum e riallacciare la relazione cominciata a Los Angeles, ma Thomas è stato assunto da una stella di film per adulti e trascorre più tempo a risolvere il caso che a riaccendere la fiamma della passione con Cynthia.

Magnum's P.I. license has expired. He is tied up in red tape trying to renew it when his aunt -- best-selling, Pulitzer prize-winning playwright Phoebe Sullivan -- pays him an unexpected visit. She just finished authoring a new play and is convinced someone is trying to kill her for it. Is someone really after Aunt Phoebe, or is her mind playing tricks on her?

Rick insiste perché Magnum si metta alla ricerca di Ice Pick, ma subito dopo scompare misteriosamente, probabilmente per evitare di rispondere a domande che lo potrebbero mettere nei guai. Ma quando Rick viene arrestato per aver ucciso un killer pagato per assassinare Ice Pick, Magnum si trova coinvolto in un caso ancora più complicato, specie perché Rick non nega affatto le accuse, anzi presta una piena confessione dei fatti.

Thomas sta per consegnare le prove decisive per un caso in tribunale quando viene colpito in un parcheggio da un killer. In coma Magnum scopre di essere in una sorta di limbo e presta aiuto a Michelle, inseguita da alcuni assassini e s'imbatte in Mac, il fantasma di un suo amico della Marina. Inoltre dice addio a tutti i suoi amici, in caso non dovesse riuscire a sopravvivere.