Capaz de ver los recuerdos de todos aquellos a los que toca, el agente especial Makoto Midorikawa recibe la solicitud de investigar una misteriosa explosión de gas.

El agente de la resistencia Jack Norman usa su habilidad extrasensorial para "adelantar el tiempo" para ir tras la investigadora Sarah Coppola.

Sarah y Makoto van al laboratorio secreto de Hulong, en la profundidad del bosque de Kioto, pero se enfrentan a las fuerzas de seguridad de Liu y a Jack en el camino.

Después de conseguir pasaportes falsos de un profesional llamado Zion, Makoto y Jack Norman abordan un vuelo a Suiza para rescatar a Sarah de Hulong.

Los científicos de Hulong prueban los efectos de la materia exótica oscura en Sarah, que usa sus habilidades especiales para hablar con Makoto a través de los portales.

Makoto usas sus poderes para buscar una ruta de escape con la ayuda de los protectores del lugar sagrado mientras unos mercenarios lo siguen de cerca.

Camino al CERN para rescatar a Sarah, Makoto y Jack son contactados por ADA, el programa de IA creado para analizar datos complejos de materia exótica.

El cuerpo de Jack empieza a fallar y Liu revela lo lejos que llegó Christopher Brandt con los poderes de la materia exótica oscura.

Los portales rojos toman el control de toda la red y las personas que tienen lentes con materia exótica oscura empiezan a colapsar de dolor.

El plan diabólico de la verdadera mente maestra se acerca un poco más al objetivo. Mientras tanto, Makoto enfrenta a Liu, que quiere terminar lo que empezó a toda costa.